番茄多肽基因组数据库及其索引文件的构建方法

    公开(公告)号:CN120015136A

    公开(公告)日:2025-05-16

    申请号:CN202411949750.3

    申请日:2024-12-27

    Abstract: 本发明涉及植物基因组学、生物信息学领域,具体涉及一种番茄多肽基因组数据库及其索引文件的构建方法。番茄多肽基因组数据库的构建方法包括:S1.将番茄多肽基因组拆分;S2.对S1得到的多个染色体进行六框翻译;S3.将S2得到的多个氨基酸序列进行组合,得到番茄多肽基因组。番茄多肽基因组数据库索引文件的构建方法包括(1)提取S2得到的多个氨基酸序列的长度、名称和氨基酸排列;(2)合并提取的多个氨基酸序列的长度、名称和氨基酸排列信息,并按照6个阅读框进行拆分;(3)运行自写脚本,根据每条氨基酸的长度计算其核苷酸的位置,并输出bed文件。本发明通过构建番茄多肽基因组及索引文件,为番茄非编码肽的挖掘提供了新的思路,对番茄分子育种有着重要意义。

    一种基于手动加压的高效瞬时茄科作物转基因方法

    公开(公告)号:CN114774463A

    公开(公告)日:2022-07-22

    申请号:CN202210377507.3

    申请日:2022-04-12

    Abstract: 本发明提供了一种基于手动加压的高效瞬时茄科作物转基因方法,首先配制携带目标基因的农杆菌侵染液,然后将注射器空筒的细口处封闭,将大小适宜的茄科作物叶片和农杆菌侵染液置于注射器空筒内,并使茄科作物叶片完全浸入农杆菌侵染液中,通过反复按压注射器推杆促使菌液全部浸染茄科作物叶片,最后将浸染的茄科作物叶片取出,再培养获得瞬时转基因茄科作物叶片。该方法通过反复抽拉注射器将农杆菌侵染液多次正压渗入茄科作物叶片,从而将外源基因高效瞬时导入植物叶片细胞中。相比传统方法,本发明方法具有耗时短、操作简单、成本低、效率高等诸多优势。

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