-
公开(公告)号:CN120026018A
公开(公告)日:2025-05-23
申请号:CN202411948334.1
申请日:2024-12-27
Applicant: 大连理工大学
IPC: C12N15/10 , C12N9/12 , C12Q1/6895 , C12Q1/6851 , C12N15/82 , C12N15/54 , A01H5/00 , A01H6/82 , C12N15/64 , G16B20/00 , G16B35/20
Abstract: 本发明提供一种番茄抗晚疫病基因CDPK12的克隆方法与应用,克隆方法包括以番茄早粉2号的cDNA为模板进行PCR扩增,将得到的PCR产物与双酶切的pBI‑121克隆载体连接,转化大肠杆菌CDPK12,挑取单菌落提取质粒,进行质粒PCR后将质粒送测序,与CDPK12一致的即为连接正确的质粒;还提供了番茄抗晚疫病基因CDPK12在番茄抗晚疫病中的应用。本发明抗晚疫病基因CDPK12,将其过表达以后,可以增强番茄对晚疫病的抗性。此外,CDPK12的过表达还会上调PR基因的表达量,本发明为揭示CDPK参与番茄抗晚疫病的分子机制奠定了基础。
-
公开(公告)号:CN120015136A
公开(公告)日:2025-05-16
申请号:CN202411949750.3
申请日:2024-12-27
Applicant: 大连理工大学
Abstract: 本发明涉及植物基因组学、生物信息学领域,具体涉及一种番茄多肽基因组数据库及其索引文件的构建方法。番茄多肽基因组数据库的构建方法包括:S1.将番茄多肽基因组拆分;S2.对S1得到的多个染色体进行六框翻译;S3.将S2得到的多个氨基酸序列进行组合,得到番茄多肽基因组。番茄多肽基因组数据库索引文件的构建方法包括(1)提取S2得到的多个氨基酸序列的长度、名称和氨基酸排列;(2)合并提取的多个氨基酸序列的长度、名称和氨基酸排列信息,并按照6个阅读框进行拆分;(3)运行自写脚本,根据每条氨基酸的长度计算其核苷酸的位置,并输出bed文件。本发明通过构建番茄多肽基因组及索引文件,为番茄非编码肽的挖掘提供了新的思路,对番茄分子育种有着重要意义。
-