番茄多肽基因组数据库及其索引文件的构建方法

    公开(公告)号:CN120015136A

    公开(公告)日:2025-05-16

    申请号:CN202411949750.3

    申请日:2024-12-27

    Abstract: 本发明涉及植物基因组学、生物信息学领域,具体涉及一种番茄多肽基因组数据库及其索引文件的构建方法。番茄多肽基因组数据库的构建方法包括:S1.将番茄多肽基因组拆分;S2.对S1得到的多个染色体进行六框翻译;S3.将S2得到的多个氨基酸序列进行组合,得到番茄多肽基因组。番茄多肽基因组数据库索引文件的构建方法包括(1)提取S2得到的多个氨基酸序列的长度、名称和氨基酸排列;(2)合并提取的多个氨基酸序列的长度、名称和氨基酸排列信息,并按照6个阅读框进行拆分;(3)运行自写脚本,根据每条氨基酸的长度计算其核苷酸的位置,并输出bed文件。本发明通过构建番茄多肽基因组及索引文件,为番茄非编码肽的挖掘提供了新的思路,对番茄分子育种有着重要意义。

Patent Agency Ranking