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公开(公告)号:CN109584968B
公开(公告)日:2022-09-23
申请号:CN201811428144.1
申请日:2018-11-27
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明公开了一种用于筛选参与生物学过程调控新基因的方法,通过使用生物信息学方法在基因本体论搜索工具,筛选特定生物学过程的语义关系;在不同物种的基因组注释数据库中,筛选被注释到上述语义的不同物种中的基因集合信息;对特定物种的基因集合信息进行同源性分析,筛选其在待研究物种中的直系同源基因;将上述基因与待研究物种中参与该生物学过程的参考基因进行比较分析,筛选特定物种中参与生物学过程调控新基因。本发明基于特定生物学过程在不同的物种之间具有高度保守性的特征,建立了一种用于筛选参与生物学过程调控新基因的方法,为进一步重构系统的基因调控网络提供支撑作用,这对于疾病早期诊断、个性化治疗、药物研发具有重要意义。
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公开(公告)号:CN109584968A
公开(公告)日:2019-04-05
申请号:CN201811428144.1
申请日:2018-11-27
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明公开了一种用于筛选参与生物学过程调控新基因的方法,通过使用生物信息学方法在基因本体论搜索工具,筛选特定生物学过程的语义关系;在不同物种的基因组注释数据库中,筛选被注释到上述语义的不同物种中的基因集合信息;对特定物种的基因集合信息进行同源性分析,筛选其在待研究物种中的直系同源基因;将上述基因与待研究物种中参与该生物学过程的参考基因进行比较分析,筛选特定物种中参与生物学过程调控新基因。本发明基于特定生物学过程在不同的物种之间具有高度保守性的特征,建立了一种用于筛选参与生物学过程调控新基因的方法,为进一步重构系统的基因调控网络提供支撑作用,这对于疾病早期诊断、个性化治疗、药物研发具有重要意义。
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公开(公告)号:CN105117617B
公开(公告)日:2017-10-24
申请号:CN201510532046.2
申请日:2015-08-26
Applicant: 大连海事大学
IPC: G06F19/12
Abstract: 本发明公开了一种用于环境敏感性生物分子的筛选方法,包括以下步骤:组学数据加载和标准化处理,计算特征的四分位距和设定阈值,利用此阈值进行四分位距算法过滤,得到差异表达特征,然后,用方差分析算法对标准化后的数据集进行过滤,得到差异表达特征。结合以上两种算法,匹配共同差异表达变化的特征,进行随机森林算法排序,得到重要性的差异表达特征。在此基础上,通过聚类分析,确定环境敏感的分子标志物。本发明提供的用于筛选环境敏感的分子标志物组合算法,降低了计算时间、提高了准确性,给出了特征的重要性排序,为生物学家快速定位到环境敏感的靶分子,揭示生物的响应机理,进行早期预警和防治,提供了高效便捷的数据处理工具。
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公开(公告)号:CN105117617A
公开(公告)日:2015-12-02
申请号:CN201510532046.2
申请日:2015-08-26
Applicant: 大连海事大学
IPC: G06F19/12
Abstract: 本发明公开了一种用于环境敏感性生物分子的筛选方法,包括以下步骤:组学数据加载和标准化处理,计算特征的四分位距和设定阈值,利用此阈值进行四分位距算法过滤,得到差异表达特征,然后,用方差分析算法对标准化后的数据集进行过滤,得到差异表达特征。结合以上两种算法,匹配共同差异表达变化的特征,进行随机森林算法排序,得到重要性的差异表达特征。在此基础上,通过聚类分析,确定环境敏感的分子标志物。本发明提供的用于筛选环境敏感的分子标志物组合算法,降低了计算时间、提高了准确性,给出了特征的重要性排序,为生物学家快速定位到环境敏感的靶分子,揭示生物的响应机理,进行早期预警和防治,提供了高效便捷的数据处理工具。
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公开(公告)号:CN110349633B
公开(公告)日:2021-03-16
申请号:CN201910631911.7
申请日:2019-07-12
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明公开了一种基于辐射响应生物学通路筛选辐射生物标志物及预测辐射剂量的方法,属于生物信息技术领域。给定辐射响应生物学通路并检索基因本体论语义,获取在特定物种中的注释基因集合,联合辐射暴露同一物种后的表达谱数据,提取表达谱数据;经过单因素方差分析和蛋白互作网络分析,获取差异表达特征及矩阵;利用生物统计学方法或机器学习算法,建立多元回归模型,通过对模型预测性能的比较分析,确定显著的表达特征集合和最优的统计模型类型,即为基于辐射响应生物学通路筛选到的辐射生物标志物及预测辐射剂量的方法。本发明的方法具有很好的预测效果,可为应急条件下核辐射生物剂量监测、核辐射损伤诊断、以及风险预警提供新的技术方法。
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公开(公告)号:CN110349633A
公开(公告)日:2019-10-18
申请号:CN201910631911.7
申请日:2019-07-12
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明公开了一种基于辐射响应生物学通路筛选辐射生物标志物及预测辐射剂量的方法,属于生物信息技术领域。给定辐射响应生物学通路并检索基因本体论语义,获取在特定物种中的注释基因集合,联合辐射暴露同一物种后的表达谱数据,提取表达谱数据;经过单因素方差分析和蛋白互作网络分析,获取差异表达特征及矩阵;利用生物统计学方法或机器学习算法,建立多元回归模型,通过对模型预测性能的比较分析,确定显著的表达特征集合和最优的统计模型类型,即为基于辐射响应生物学通路筛选到的辐射生物标志物及预测辐射剂量的方法。本发明的方法具有很好的预测效果,可为应急条件下核辐射生物剂量监测、核辐射损伤诊断、以及风险预警提供新的技术方法。
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公开(公告)号:CN107479087B
公开(公告)日:2019-06-11
申请号:CN201710660869.2
申请日:2017-08-04
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明公开了一种用于生物叠中辐射粒子分析生物样品击中情况的方法及系统,方法至少包括:获取待分析的生物叠中生物样品的坐标数据和击中生物样品的辐射粒子探测数据;获取待分析的生物叠中生物样品的直径r,生物叠衬底材料的厚度d以及生物叠中辐射粒子的入射平面;计算生物叠中生物样品中各辐射粒子的运动轨迹、生物样品中心到辐射粒子运动轨迹的距离L及该辐射粒子与两个平面的交点坐标;依据L判断辐射粒子击中该生物样品的情况,并计算出被辐射粒子击中生物样品的坐标;对生物叠中辐射粒子击中生物样品情况进行显示统计。本发明为空间飞行生物叠中生物样品的研究提供了数据处理、样品筛选和数据可视化等有效的手段和辅助技术。
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公开(公告)号:CN109584955A
公开(公告)日:2019-04-05
申请号:CN201811429273.2
申请日:2018-11-27
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明公开了一种基于多种植物基因组识别人类辐射响应生物标志物的方法,包括检索辐射响应的基因本体论(GO)语义关系,获取多种植物中的注释基因及在拟南芥中直系同源基因;计算多种植物每一GO语义在拟南芥中直系同源基因的并集与辐射品质特异性基因集合;经蛋白互作网络分析,获取蛋白连接度大于设置阈值的基因集合;统计基因在多种植物中出现次数,获取基因多样性指数大于设置阈值的基因集合;最后,经基因同源性分析,获取这些基因在人类中的直系同源基因集合,导出人类辐射响应生物标志物。本发明解决了利用植物的基因组筛选新的人类辐射响应生物标志物的问题。在辐射剂量估算、辐射损伤诊断、以及辐射健康风险预警等方面有应用前景。
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公开(公告)号:CN115743950A
公开(公告)日:2023-03-07
申请号:CN202211470350.5
申请日:2022-11-23
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明属储油罐领域,尤其涉及一种应用于煤油、汽油、溶剂油的智能化浮顶罐,在所述罐体(25)内设有纵向移动式注油组件与软密封组件;纵向移动式注油组件包括空心浮板(24)、喷管(20)、伸缩支撑杆(11);喷管(20)固定设于空心浮板(24)下部,其上端口与空心浮板(24)的腔体相通;在罐体(25)外部设有输油泵(4);软密封组件包括圆形橡胶气囊(22);圆形橡胶气囊(22)底部与空心浮板(24)上部固定相接;圆形橡胶气囊(22)与罐体(25)内壁滑动封接;在罐体(25)外部设有在出气口处配置驱动阀门(31)的气泵(3);本发明安全性好,注油效率高,密封效果理想,可确保储油质量。
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公开(公告)号:CN109447905A
公开(公告)日:2019-03-08
申请号:CN201811314691.7
申请日:2018-11-06
Applicant: 大连海事大学
Abstract: 本发明公开了一种基于判别字典的海上图像超分辨率重建方法。通过构建图像特征表征之间的内在结构关联,实现更加清晰鲁棒的海上图像超分辨率重建。本发明利用压缩感知理论,在稀疏编码框架下,针对图像超分辨率重建过程中由于缺乏结构关联分析导致重建结果不准确的问题,构建判别字典学习求解过程。根据图像特征的空间距离,构建组字典和共有字典表达;进一步引入组稀疏约束项,局部限制性稀疏约束项和不一致惩罚项,通过在字典学习过程中,保存图像特征表征的固有结构特性,进而获得更加准确的海上图像超分辨率重建结果。
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