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公开(公告)号:CN101545908A
公开(公告)日:2009-09-30
申请号:CN200810035372.2
申请日:2008-03-28
Applicant: 复旦大学 , 复旦大学附属中山医院 , 北京蛋白质组研究中心
Abstract: 本发明属生物技术领域,涉及硫氧还蛋白-2在制药中的新用途,具体涉及硫氧还蛋白-2在制备肝纤维化诊断制剂中的用途,本发明采用DIGE技术研究了不同病程的肝纤维化病人血浆蛋白质组的差异,确定并验证了硫氧还蛋白2的表王既要随着病程的发展而上升,可进一步制备肝纤维化诊断制剂,用于诊断不同阶段的肝纤维化病人。本发明在此基础上,构建了可以高效地诊断肝纤维化各个阶段的决策树。本发明能够联合多个血液学指标,共同评价肝纤维化程度,可全面准确地提高临床非创伤性诊断肝纤维化的准确率,灵敏度和特异度。
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公开(公告)号:CN108913689B
公开(公告)日:2021-09-07
申请号:CN201810009392.6
申请日:2018-01-05
Applicant: 复旦大学
IPC: C12N15/113 , C12N15/867 , A61K31/713 , A61P1/16
Abstract: 本发明涉及一种靶向肝星状细胞同时双敲低Pdgfrβ和TβrII基因的人工miRNA及其载体系统,其在肝星状细胞(HSC)特异性的GFAP启动子控制下能够抑制Pdgfrβ和TβrII基因的表达,且其高度的靶向性和灵敏性,在肝纤维化的治疗方面有很好的临床应用前景。
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公开(公告)号:CN102809600A
公开(公告)日:2012-12-05
申请号:CN201210249904.9
申请日:2012-07-19
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N27/62
Abstract: 本发明涉及蛋白质组学技术领域,具体为一种用于一级相同质量二级b,y碎片离子对定量方法的数据分析方法,该方法采用Matlab语言编写,在Matlab界面下运行,其基于SEQUEST搜索引擎得到的蛋白定性结果,通过提取串级质谱中b,y碎片离子对的峰强度信息,做比值后得到肽段和蛋白的定量信息。该方法还加入了一个“谱图拆分”的优化模块,减少了b,y碎片离子对共碎裂谱图对肽段正确定性的影响。本发明还构造z统计量计算定量蛋白的显著性,为确定实际样品中上下调变化蛋白提供参考依据。本发明为一级相同质量二级b,y碎片离子对的定量蛋白质组学新方法的发展和应用,提供了一个通用的、开放的、准确的定量分析手段。
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公开(公告)号:CN108913689A
公开(公告)日:2018-11-30
申请号:CN201810009392.6
申请日:2018-01-05
Applicant: 复旦大学
IPC: C12N15/113 , C12N15/867 , A61K31/713 , A61P1/16
Abstract: 本发明涉及一种靶向肝星状细胞同时双敲低Pdgfrβ和TβrII基因的人工miRNA及其载体系统,其在肝星状细胞(HSC)特异性的GFAP启动子控制下能够抑制Pdgfrβ和TβrII基因的表达,且其高度的靶向性和灵敏性,在肝纤维化的治疗方面有很好的临床应用前景。
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公开(公告)号:CN102243218B
公开(公告)日:2013-11-27
申请号:CN201110123885.0
申请日:2011-05-13
Applicant: 复旦大学
Abstract: 一种基于细胞培养和串级质谱的蛋白质组学相对定量方法。在细胞培养过程中加入相同质量增加的重同位素标记的精氨酸或赖氨酸,细胞蛋白提取液按不同比例混合,经过特异性内切酶Lys-N和Arg-C酶解后,直接2D-LC-MS/MS分析,提取串级质谱中具有固定质量增加的b,y碎片离子对的峰强度,做比值后确定相应肽段和蛋白的相对量,该方法克服了一级质谱定量的复杂度增加的问题和同重同位素标签串级质谱定量的低质量端抑制效应,提高了一级质谱信号的灵敏度,同时由于在串级质谱中采用多对b,y碎片离子对进行定量,从而保证了该定量方法的准确性和可靠性。为定量蛋白质组学的研究和发展,提供了一个新的方法和技术平台。
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公开(公告)号:CN101901345B
公开(公告)日:2013-02-27
申请号:CN200910052187.9
申请日:2009-05-27
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属蛋白质组学分类领域,涉及差异蛋白质组学分类方法。包括:用单变量统计分析、顺序特征选择和遗传算法选择特征,用主成分分析和偏最小二乘法提取特征,并与线性判别分析、k-最近邻分类器、支持向量机、决策树、朴素贝叶斯分类器和人工神经网络分类器串联整合,得系列串联整合分类器并将其并联组合,对各基分类器按分类准确率赋予权重系数,以模糊属性值为分类结果输出形式,得对目标样本的分类判断结果。本方法在差异蛋白质组学的异常和正常样本分类和判断中具有较高的分类准确率和鲁棒性。适用于对差异蛋白质组数据的分类分析。
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公开(公告)号:CN102243218A
公开(公告)日:2011-11-16
申请号:CN201110123885.0
申请日:2011-05-13
Applicant: 复旦大学
Abstract: 一种基于细胞培养和串级质谱的蛋白质组学相对定量方法。在细胞培养过程中加入相同质量增加的重同位素标记的精氨酸或赖氨酸,细胞蛋白提取液按不同比例混合,经过特异性内切酶Lys-N和Arg-C酶解后,直接2D-LC-MS/MS分析,提取串级质谱中具有固定质量增加的b,y碎片离子对的峰强度,做比值后确定相应肽段和蛋白的相对量,该方法克服了一级质谱定量的复杂度增加的问题和同重同位素标签串级质谱定量的低质量端抑制效应,提高了一级质谱信号的灵敏度,同时由于在串级质谱中采用多对b,y碎片离子对进行定量,从而保证了该定量方法的准确性和可靠性。为定量蛋白质组学的研究和发展,提供了一个新的方法和技术平台。
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公开(公告)号:CN101901345A
公开(公告)日:2010-12-01
申请号:CN200910052187.9
申请日:2009-05-27
Applicant: 复旦大学
Abstract: 本发明属蛋白质组学分类领域,涉及差异蛋白质组学分类方法。包括:用单变量统计分析、顺序特征选择和遗传算法选择特征,用主成分分析和偏最小二乘法提取特征,并与线性判别分析、k-最近邻分类器、支持向量机、决策树、朴素贝叶斯分类器和人工神经网络分类器串联整合,得系列串联整合分类器并将其并联组合,对各基分类器按分类准确率赋予权重系数,以模糊属性值为分类结果输出形式,得对目标样本的分类判断结果。本方法在差异蛋白质组学的异常和正常样本分类和判断中具有较高的分类准确率和鲁棒性。适用于对差异蛋白质组数据的分类分析。
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