RNA解旋酶的三维结构及其应用

    公开(公告)号:CN111647577B

    公开(公告)日:2023-02-10

    申请号:CN202010442787.2

    申请日:2020-05-22

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及来源于人体的DEAD‑box RNA解旋酶DDX21的晶体结构和应用。所述RNA解旋酶DDX21包括野生型全长DDX21和DDX21解旋酶核心区域,均可结合三磷酸腺苷(ATP)和有效解旋双链RNA。DDX21解旋酶核心区域的晶体结构共有四套,RNA解旋的初始状态(DDX21‑apo,分辨率,空间群为C2),结合三磷酸腺苷(β,γ‑亚氨基)三磷酸(AMPPNP)和ssRNA的解旋后状态(DDX21‑AMPPNP‑ssRNA,分辨率;空间群为P21),以及结合二磷酸腺苷(ADP)的水解后状态(DDX21‑ADP,分辨率;空间群为P21),和一套解旋循环以外的结合单磷酸腺苷AMP的结构(DDX21‑AMP,分辨率;空间群为P21)。DDX21的晶体结构及其活性口袋,以及相关结合或作用位点,为抗肿瘤药物的筛选、设计和抗RNA病毒类药物的研发提供有效的结构基础,具有广泛的应用前景。

    一种用于脑恶性胶质瘤诊断和预后的趋化因子及其应用

    公开(公告)号:CN114657252A

    公开(公告)日:2022-06-24

    申请号:CN202210450323.5

    申请日:2022-04-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于生物诊断和医药技术领域,具体为胶质瘤标志物基因的表达产物在制备用于胶质瘤诊断、筛查和/或预后的检测试剂盒中的应用。本发明研究表明,胶质瘤患者肿瘤组织CCL18的mRNA和蛋白水平显著高于健康人群,且其基因和/或基因的表达产物与患者病情及预后显著性相关。因此CCL18基因及其表达产物能够作为预后评估和治疗效果的分子标志物,并应用于胶质瘤患者病情及预后评估的试剂中。本发明还提供用于胶质瘤诊断、筛查和/或预后的检测试剂盒,包括用于对样本中CCL18蛋白表达量进行检测的检测试剂。

    一种来源于GSDMD蛋白的抗菌肽及其应用

    公开(公告)号:CN107312080B

    公开(公告)日:2021-02-26

    申请号:CN201710603544.0

    申请日:2017-07-23

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,具体为一种来源于GSDMD蛋白的抗菌肽及其应用。本发明提供的抗菌肽,其为人源GSDMD蛋白序列M‑N位的多肽,或该多肽序列中除FHFYDAMDGQI序列外的其他氨基酸进行各种取代、添加和/或缺失氨基酸后具有至少90%以上同源性的衍生多肽;其中,M选自60‑80间的整数,N选自为90‑110间的整数。本发明公开的抗菌肽具有高效的抗菌作用,对各类细菌,包括但不限于革兰氏阴性菌(大肠杆菌、耻垢分枝杆菌)、革兰氏阳性菌(金黄色葡萄球菌)具有很强的抗菌活性,且其分子量小,合成简单,具有较好的应用价值。

    蛋白酯酶E8及其表达纯化、晶体结构和应用

    公开(公告)号:CN106754820B

    公开(公告)日:2020-07-28

    申请号:CN201611154309.1

    申请日:2016-12-14

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,具体为来源于深海细菌E4A9T的的蛋白酯酶E8及其表达纯化、晶体结构和应用。所述酯酶E8有241个氨基酸,分子量为26.28kDa;在表达菌株中高度可溶性表达,可获得高表达量和高酶活的酯酶E8;底物为对硝基苯酚丁酸酯(C4)时催化活性最高,酯酶E8在有机溶剂中仍保持较高活性。酯酶E8的晶体结构分辨率达到1.5Å,该结构由6个β折叠和15个α螺旋组成,其中,第77位丝氨酸,第101位天冬氨酸与第222位组氨酸所构成的催化三连体组成酶学活性中心。该酯酶酶学活性高,成本低廉,可用于食品加工及食品风味改良、油脂水解、皮革绢纺原料脱脂、废水处理、洗涤工业等领域,E8的三维结构可在工业酶制剂中底物改造及提高酶活方面具有广泛的应用前景。

    一种提高蛋白表达的融合标签蛋白及其应用

    公开(公告)号:CN111378047A

    公开(公告)日:2020-07-07

    申请号:CN201811625148.9

    申请日:2018-12-28

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及一种提高蛋白表达的融合标签蛋白及其应用,属于基因工程领域。本发明的融合标签蛋白FJ1来自于Gramella forsetii,本发明还提供了基于本发明的融合标签蛋白构建的融合蛋白表达系统,并选择了Lysyl-tRNA synthetase(mycobacterium tuberculosis)作为应用实例,构建融合蛋白表达系统,并将表达载体导入大肠杆菌表达宿主中,验证本发明融合标签蛋白的效果。本发明通过融合标签蛋白与目的蛋白的连接,能够有效提高目的蛋白的表达及目的蛋白折叠,可以提高目的蛋白的可溶性。本发明所述融合标签蛋白可广泛运用于目的基因的表达和目的蛋白的可溶性研究,以及应用于工业化生产蛋白质药物以及分子生物学、生物化学和遗传学等基础研究领域。

    一种嘧啶类衍生物或其药学上可接受的盐在制备治疗结核病药物中的应用

    公开(公告)号:CN115737650B

    公开(公告)日:2024-06-28

    申请号:CN202111032048.7

    申请日:2021-09-03

    Applicant: 复旦大学

    Inventor: 李继喜 战博闻

    Abstract: 本发明公开一种嘧啶类衍生物或其药学上可接受的盐在制备治疗结核病药物中的应用,结构式如下:G选自4,5,6,7‑四氢吡唑并[1,2]吡啶‑3‑基、1H‑吲哚‑3‑基、1‑甲基‑1H‑吲哚‑3‑基以及吡唑并[1,5‑a]吡啶‑3‑基,R1选自氢、氟、氯、甲基以及氰基,R2选自甲氧基和甲基,R3选自(3R)‑3‑(二甲氨基)吡咯烷‑1‑基、(3S)‑3‑(二甲基‑氨基)吡咯烷‑1‑基、3‑(二甲氨基)氮杂环丁烷‑1‑基、[2‑(二甲氨基)乙基]‑(甲基)氨基、[2‑(甲氨基)乙基](甲基)氨基、5‑甲基‑2,5‑二氮杂螺环[3.4]辛‑2‑基、(3aR,6aR)‑5‑甲基六氢‑吡咯并[3,4‑b]吡咯‑1(2H)‑基、1‑甲基‑1,2,3,6‑四氢吡啶‑4‑基、4‑甲基哌嗪‑1‑基、4‑[2‑(二甲氨基)‑2‑氧代乙基]哌嗪‑1‑基、甲基[2‑(4‑甲基哌嗪‑1‑基)乙基]氨基、甲基[2‑(吗啉‑4‑基)乙基]氨基、1‑氨基‑1,2,3,6‑四氢吡啶‑4‑基、4‑[(2S)‑2‑氨基丙酰基]哌嗪‑1‑基。

    非洲猪流感病毒DNA连接酶的晶体及其制备方法和应用

    公开(公告)号:CN109810955A

    公开(公告)日:2019-05-28

    申请号:CN201910060493.0

    申请日:2019-01-22

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,具体为一种非洲猪流感病毒DNA连接酶的晶体及其制备方法和应用。本发明DNA连接酶AsfvLIG含419个氨基酸,分子量约为45kDa;在表达菌株Escherichia coli BL21(DE3)中具有高度可溶性表达。通过X射线衍射的方法获得了其三维结构,分辨率达到2.5Å。一个晶体学不对称单位中有一个蛋白分子,由9个α螺旋以及17个β折叠组成;同时结合其催化反应底物DNA。该结构中第153位天冬酰胺、第211位亮氨酸、第402亮氨酸和第403谷氨酰胺具有与人源DNA连接酶不同的构象。该DNA连接酶AsfvLIG的晶体结构可在针对非洲猪瘟病毒药物设计或药物筛选中具有广泛的用途。

    一种深海沉积物蛋白酯酶的表达纯化、晶体结构及其应用

    公开(公告)号:CN105132392B

    公开(公告)日:2018-08-24

    申请号:CN201510576927.4

    申请日:2015-09-12

    Applicant: 复旦大学

    Inventor: 李继喜 黄静

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,具体为一种深海沉积物蛋白酯酶的表达纯化、晶体结构及其应用。所述酯酶EST22含344个氨基酸,分子量为36.75kDa;在表达菌株中高度可溶性表达,并且表现出良好的耐盐、耐碱性质。所述酯酶EST22的晶体结构分辨率达到1.4Å。该结构由8个β折叠和15个α螺旋组成,其中,第188位丝氨酸,第287位天冬氨酸与第317位组氨酸所构成的催化三连体组成酶学活性中心。晶体结构中包含两个特异性产物分子对硝基苯酚(NPO),一个位于活性中心,另一个位于结构表面。该酯酶EST22的三维结构可在手性药物前体筛选、工业酶制剂中底物改造及提高酶活方面具有广泛的应用前景。

    蛋白酯酶E8及其表达纯化、晶体结构和应用

    公开(公告)号:CN106754820A

    公开(公告)日:2017-05-31

    申请号:CN201611154309.1

    申请日:2016-12-14

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,具体为来源于深海细菌E4A9T的蛋白酯酶E8及其表达纯化、晶体结构和应用。所述酯酶E8有241个氨基酸,分子量为26.28kDa;在表达菌株中高度可溶性表达,可获得高表达量和高酶活的酯酶E8;底物为对硝基苯酚丁酸酯(C4)时催化活性最高,酯酶E8在有机溶剂中仍保持较高活性。酯酶E8的晶体结构分辨率达到1.5Å,该结构由6个β折叠和15个α螺旋组成,其中,第77位丝氨酸,第101位天冬氨酸与第222位组氨酸所构成的催化三连体组成酶学活性中心。该酯酶酶学活性高,成本低廉,可用于食品加工及食品风味改良、油脂水解、皮革绢纺原料脱脂、废水处理、洗涤工业等领域,E8的三维结构可在工业酶制剂中底物改造及提高酶活方面具有广泛的应用前景。

    一种具有抑制阿尔兹海默症Aβ蛋白聚集的多肽及其用途

    公开(公告)号:CN105175494A

    公开(公告)日:2015-12-23

    申请号:CN201510579527.9

    申请日:2015-09-12

    Applicant: 复旦大学

    Inventor: 李继喜 黄静

    Abstract: 本发明属于医药技术领域,具体为一种具有抑制阿尔兹海默症Aβ蛋白聚集的多肽及其用途。本发明的多肽包含下式所示氨基酸序列:Xaa1-Xaa2-Xaa3-Xaa4,其中,Xaa1和Xaa3为相同的氨基酸,选自V或L;Xaa2选自Q或N; Xaa4选自A,C,D,E,F,G,H,K,M,P,R,S,T,V,W或Y。该多肽具有抑制阿尔茨海默症相关蛋白Aβ的聚集活性,能有效的抑制Aβ40,Aβ42的聚集,可用于制备Aβ聚集抑制剂,并用于制备阿尔茨海默症以及其他神经退行性疾病的治疗药物。本发明为治疗阿尔茨海默症提供了新的途径,因此具有广阔的医学应用前景。

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