公开(公告)号：CN106650313B

公开(公告)日：2019-10-18

申请号：CN201610865814.0

申请日：2016-09-29

Applicant: 哈尔滨工程大学

Inventor： 冯伟兴 ,  贺波 ,  宋艳霞 ,  徐斯文 ,  赵森 ,  陈多娇 ,  刘欢

IPC: G16B30/00 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明属于分子生物信息检测与分析领域，具体涉及一种有效提高DNase高通量测序数据的检测信息准确性的滤除DNase高通量测序数据中DNA碱基倾向性偏差的方法。本发明包括：(1)DNase‑Seq实验数据酶切位点区域DNA碱基获取；(2)DNase‑Seq实验数据DNA碱基倾向性获取；(3)DNA碱基倾向性去除。通过所发明的方法可以精确地滤除DNase高通量测序数据中含有的DNA碱基倾向性偏差，以生成更加准确的DNase‑Seq测序结果，从而为后续更高层次的应用分析提供数据保障。

公开(公告)号：CN106650313A

公开(公告)日：2017-05-10

申请号：CN201610865814.0

申请日：2016-09-29

Applicant: 哈尔滨工程大学

Inventor： 冯伟兴 ,  贺波 ,  宋艳霞 ,  徐斯文 ,  赵森 ,  陈多娇 ,  刘欢

IPC: G06F19/22 ,  C12Q1/68

Abstract: 本发明属于分子生物信息检测与分析领域，具体涉及一种有效提高DNase高通量测序数据的检测信息准确性的滤除DNase高通量测序数据中DNA碱基倾向性偏差的方法。本发明包括：(1)DNase‑Seq实验数据酶切位点区域DNA碱基获取；(2)DNase‑Seq实验数据DNA碱基倾向性获取；(3)DNA碱基倾向性去除。通过所发明的方法可以精确地滤除DNase高通量测序数据中含有的DNA碱基倾向性偏差，以生成更加准确的DNase‑Seq测序结果，从而为后续更高层次的应用分析提供数据保障。

公开(公告)号：CN102622534B

公开(公告)日：2015-09-30

申请号：CN201210104293.9

申请日：2012-04-11

Applicant: 哈尔滨工程大学

Inventor： 冯伟兴 ,  宋艳霞 ,  贺波 ,  栾兴桃 ,  王科俊 ,  刘晓龙 ,  赵拓 ,  李双林

IPC: G06F19/20

Abstract: 本发明属于分子生物信息检测领域。具体是一种提高DNA高通测序获取基因表达检测数据准确性的校正方法。该发明包括下列步骤：(1)采集基因表达DNA测序检测数据，建立基因表达DNA高通测序检测数据校正模型；(2)采集基因芯片测量的基因表达值；(3)采用相关分析确定基因表达高通测序校正模型中的模型参数；(4)确定模型参数值后的基因表达DNA高通测序检测数据校正模型生成校正后的基因表达值。本发明利用校正模型对DNA测序值存在的序列比对映射误差进行估算和补偿，减小了检测误差，在充分发挥DNA高通测序检测数据高分辨率、高精度的基础上，有效提高检测的准确性。