公开(公告)号：CN118389730A

公开(公告)日：2024-07-26

申请号：CN202410542354.2

申请日：2024-04-30

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 张文利 ,  彭宇潋 ,  赵鹏涛 ,  李兆国 ,  陶申童 ,  冯逸龙 ,  程雪姣

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明公开了一种在全基因组水平鉴定植物单链DNA位点的方法，该方法利用S1核酸酶切割完整的基因组DNA，在末端脱氧核苷酸转移酶环境下使用生物素标记的dCTP/dATP进行原位标记，然后用链霉亲和素富集生物素标记的ssDNA用于文库制备和测序。本发明方法不依赖于抗体，能够在全基因组水平鉴定各种类型的ssDNA位点；本发明方法所需细胞初始量少，250ngDNA即可获得有效数据；本发明的方法置于原位体系，能够准确检测研究对象的动态变化过程。本发明的整个方法流程简单，所需DNA用量范围广(250ng‑5μg)，可视化效果强，理论上该方法适应于多种植物。