一种针对植物重要经济器官的ChIP-seq染色质免疫共沉淀方法

    公开(公告)号:CN117431294B

    公开(公告)日:2025-01-28

    申请号:CN202311372980.3

    申请日:2023-10-23

    Abstract: 本发明涉及一种针对植物经济器官的ChIP‑seq染色质免疫共沉淀方法,针对现有方法难以在种子、果实和块茎等材料中产出合格DNA‑蛋白质互作数据问题提供aChIP实验新技术。在确保染色质分离效率的基础上,利用离心沉淀和改进缓冲液配方等方式去除材料中复杂的细胞内含物,并对染色质进行浓缩以高效获得干净、高浓度的片段化染色质,最终在植物经济器官中获得高质量ChIP‑seq数据。该方法快速高效、灵敏高质、适用性广,不仅适用于常规植物组织,更适用于富含油脂、淀粉、糖、有机酸和酚等物质的植物经济器官,拓展了植物种子发育、休眠和萌发,果实成熟和营养物质积累等领域的表观遗传学、功能基因组学和基因转录调控的研究。

    一种针对植物重要经济器官的ChIP-seq染色质免疫共沉淀方法

    公开(公告)号:CN117431294A

    公开(公告)日:2024-01-23

    申请号:CN202311372980.3

    申请日:2023-10-23

    Abstract: 本发明涉及一种针对植物经济器官的ChIP‑seq染色质免疫共沉淀方法,针对现有方法难以在种子、果实和块茎等材料中产出合格DNA‑蛋白质互作数据问题提供aChIP实验新技术。在确保染色质分离效率的基础上,利用离心沉淀和改进缓冲液配方等方式去除材料中复杂的细胞内含物,并对染色质进行浓缩以高效获得干净、高浓度的片段化染色质,最终在植物经济器官中获得高质量ChIP‑seq数据。该方法快速高效、灵敏高质、适用性广,不仅适用于常规植物组织,更适用于富含油脂、淀粉、糖、有机酸和酚等物质的植物经济器官,拓展了植物种子发育、休眠和萌发,果实成熟和营养物质积累等领域的表观遗传学、功能基因组学和基因转录调控的研究。

    与芥菜型油菜多室性状相关的两室基因BjMc2和三室基因Bjmc2及其应用

    公开(公告)号:CN113512552B

    公开(公告)日:2022-05-17

    申请号:CN202110718109.9

    申请日:2021-06-28

    Abstract: 本发明公开了与芥菜型油菜多室性状相关的两室基因BjMc2和三室基因Bjmc2及其应用,属于油菜育种技术领域,其中两室基因BjMc2的启动子序列如SEQ ID NO.1所示,编码区序列如SEQ ID NO.2所示;所述两室基因BjMc2的等位基因即三室基因Bjmc2的启动子相较于两室基因BjMc2缺失了914bp。本发明通过图位克隆技术,首次从芥菜型油菜中成功克隆得到了芥菜型油菜的两室基因BjMc2和三室基因Bjmc2,可将其用于油菜的基因工程改造,根据需求获得不同表型的油菜。同时本发明还提供了一个可分别特异性扩增两室基因BjMc2和三室基因Bjmc2的分子标记CM2,可将其应用于芥菜型多室油菜育种中,用于辅助选择具备三室性状的芥菜型油菜,从而减少育种工作量,缩短育种年限,加快芥菜型多室油菜育种进程。

    与芥菜型油菜多室性状相关的两室基因BjMc2和三室基因Bjmc2及其应用

    公开(公告)号:CN113512552A

    公开(公告)日:2021-10-19

    申请号:CN202110718109.9

    申请日:2021-06-28

    Abstract: 本发明公开了与芥菜型油菜多室性状相关的两室基因BjMc2和三室基因Bjmc2及其应用,属于油菜育种技术领域,其中两室基因BjMc2的启动子序列如SEQ ID NO.1所示,编码区序列如SEQ ID NO.2所示;所述两室基因BjMc2的等位基因即三室基因Bjmc2的启动子相较于两室基因BjMc2缺失了914bp。本发明通过图位克隆技术,首次从芥菜型油菜中成功克隆得到了芥菜型油菜的两室基因BjMc2和三室基因Bjmc2,可将其用于油菜的基因工程改造,根据需求获得不同表型的油菜。同时本发明还提供了一个可分别特异性扩增两室基因BjMc2和三室基因Bjmc2的分子标记CM2,可将其应用于芥菜型多室油菜育种中,用于辅助选择具备三室性状的芥菜型油菜,从而减少育种工作量,缩短育种年限,加快芥菜型多室油菜育种进程。

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