公开(公告)号：CN117431294B

公开(公告)日：2025-01-28

申请号：CN202311372980.3

申请日：2023-10-23

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 赵伦 ,  章清 ,  钟文莹 ,  沈金雄

IPC: C12Q1/6804 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  G01N33/53 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明涉及一种针对植物经济器官的ChIP‑seq染色质免疫共沉淀方法，针对现有方法难以在种子、果实和块茎等材料中产出合格DNA‑蛋白质互作数据问题提供aChIP实验新技术。在确保染色质分离效率的基础上，利用离心沉淀和改进缓冲液配方等方式去除材料中复杂的细胞内含物，并对染色质进行浓缩以高效获得干净、高浓度的片段化染色质，最终在植物经济器官中获得高质量ChIP‑seq数据。该方法快速高效、灵敏高质、适用性广，不仅适用于常规植物组织，更适用于富含油脂、淀粉、糖、有机酸和酚等物质的植物经济器官，拓展了植物种子发育、休眠和萌发，果实成熟和营养物质积累等领域的表观遗传学、功能基因组学和基因转录调控的研究。

公开(公告)号：CN117431294A

公开(公告)日：2024-01-23

申请号：CN202311372980.3

申请日：2023-10-23

Applicant: 华中农业大学

Inventor： 赵伦 ,  章清 ,  钟文莹 ,  沈金雄

IPC: C12Q1/6804 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  G01N33/53 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明涉及一种针对植物经济器官的ChIP‑seq染色质免疫共沉淀方法，针对现有方法难以在种子、果实和块茎等材料中产出合格DNA‑蛋白质互作数据问题提供aChIP实验新技术。在确保染色质分离效率的基础上，利用离心沉淀和改进缓冲液配方等方式去除材料中复杂的细胞内含物，并对染色质进行浓缩以高效获得干净、高浓度的片段化染色质，最终在植物经济器官中获得高质量ChIP‑seq数据。该方法快速高效、灵敏高质、适用性广，不仅适用于常规植物组织，更适用于富含油脂、淀粉、糖、有机酸和酚等物质的植物经济器官，拓展了植物种子发育、休眠和萌发，果实成熟和营养物质积累等领域的表观遗传学、功能基因组学和基因转录调控的研究。