自动测量离体植物软腐病斑面积的方法及装置

    公开(公告)号:CN111862190B

    公开(公告)日:2024-04-05

    申请号:CN202010664458.2

    申请日:2020-07-10

    Abstract: 本发明涉及农业技术领域,具体涉及自动测量离体植物软腐病斑面积的方法及装置。所述方法包括:获取离体植物的样本图片;对所述样本图片中的分辨率进行标定;对所述样本图片中的病斑区域进行提取,在进行所述提取时,采用深度学习中的全卷积神经网络(FCN,Fully Convolutional Networks)对所述病斑区域进行语义分割,自动提取病变区域;所述全卷积神经网络经过人工标注的样本集进行训练;统计所述病斑区域中的像素点总数,计算得到病斑面积。本发明实现了对软腐病斑面积自动、高效、准确测量的目的,可为当前软腐病研究中离体病斑面积测量的实际需求提供支持。

    一种特异性引物及其检测方法

    公开(公告)号:CN109868324B

    公开(公告)日:2022-06-24

    申请号:CN201811593856.9

    申请日:2018-12-25

    Abstract: 本发明公开一对用于检测胡萝卜果胶杆菌Pco亚种的引物及其检测方法,所述引物对包括上游引物srlE‑F1:5’‑TGACTGTGGTGGAACACTTCG‑3’和下游引物,srlE‑R1:5’‑CAGCCAGTGATAAACCAACCG‑3’,在所述引物基础上建立胡萝卜果胶杆菌种内P.carotovorum subsp.odoriferum亚种的检测方法。本发明所提供的引物及方法对胡萝卜果胶杆菌P.carotovorum subsp.odoriferum亚种进行检测具有准确性高、特异性强、灵敏度高、检测过程操作简便快速等优点,为田间蔬菜软腐病的早期诊断和病菌的监测技术发展奠定基础。

    一种用于预测低果糖桃的SNP分子标记及检测方法

    公开(公告)号:CN113151541A

    公开(公告)日:2021-07-23

    申请号:CN202110278213.0

    申请日:2021-03-15

    Abstract: 本发明提供一种通过SNP分子标记预测桃果糖含量水平的方法,所述标记位点桃1号染色体11,910,990bp位点的碱基。当其为GG基因型时,则待检桃品种所结果实为100%低果糖;该位点为CG时,则待检桃品种所结果实约90.9%可能性为低果糖;该位点为CC时,则待检桃品种所结果实约9.8%可能性为低果糖。本发明的方法可用于桃果糖的早期预测,杂交亲本的选择和品种资源的鉴定,可用于有目的的桃品种的选育,具有广阔的应用前景。

    基于AlcR/alcA和Cre/loxP系统的标记基因诱导删除体系

    公开(公告)号:CN102181463A

    公开(公告)日:2011-09-14

    申请号:CN201110046131.X

    申请日:2011-02-25

    Abstract: 本发明公开了一种基于AlcR/alcA和Cre/loxP系统的标记基因诱导删除体系。本发明提供了一种将选择标记基因通过诱导予以删除,培育无标记转基因植物的方法,包括如下步骤:(1)用重组质粒转化出发植物,通过所述筛选基因筛选得到同时含有所述筛选基因和所述外源目的基因的转基因植物;重组质粒包括特异DNA片段甲和特异DNA片段乙;特异DNA片段乙含有外源目的基因的表达盒;DNA片段甲中将Cre基因置于alcA-min35S嵌合启动子下游,诱导前Cre基因不表达,不发生删除,乙醇存在时,转录因子AlcR构象改变,结合到alcA-min35S上,激活下游Cre基因的表达,Cre重组酶识别2个同向loxP位点,剔除位点之间的DNA片段。本发明可以解决因标记基因可能产生的潜在安全性隐患。

    一种检测蔬菜软腐果胶杆菌的特异性PCR引物和qPCR引物及方法和应用

    公开(公告)号:CN112111589B

    公开(公告)日:2022-09-06

    申请号:CN202011061923.X

    申请日:2020-09-30

    Inventor: 陈昌龙 谢华 田宇

    Abstract: 本发明涉及一种检测蔬菜软腐果胶杆菌Pectobacterium polaris的特异性PCR引物和qPCR引物及方法和应用。本发明通过对蔬菜软腐果胶杆菌P.polaris及其近缘种和其他病原菌等138个细菌菌株进行了基因聚类分析,得到四个P.polaris特异基因。本发明基于得到的P.polaris特异基因设计了PCR和qPCR引物,并且经实验验证,PCR和qPCR引物均具备高度的灵敏度和特异性,最低可以检测1pg的样品。本发明提供的PCR和qPCR引物可以准确鉴别出早期蔬菜软腐病样是否携带P.polaris,在蔬菜软腐病的早期诊断中具有重要意义。

    一种用于预测低果糖桃的SNP分子标记及检测方法

    公开(公告)号:CN113151541B

    公开(公告)日:2022-04-26

    申请号:CN202110278213.0

    申请日:2021-03-15

    Abstract: 本发明提供一种通过SNP分子标记预测桃果糖含量水平的方法,所述标记位点桃1号染色体11,910,990bp位点的碱基。当其为GG基因型时,则待检桃品种所结果实为100%低果糖;该位点为CG时,则待检桃品种所结果实约90.9%可能性为低果糖;该位点为CC时,则待检桃品种所结果实约9.8%可能性为低果糖。本发明的方法可用于桃果糖的早期预测,杂交亲本的选择和品种资源的鉴定,可用于有目的的桃品种的选育,具有广阔的应用前景。

    一株广谱抗病的贝莱斯芽孢杆菌及其应用

    公开(公告)号:CN110283742B

    公开(公告)日:2020-12-15

    申请号:CN201910519896.7

    申请日:2019-06-17

    Abstract: 本发明涉及一株广谱抗病的生防贝莱斯芽孢杆菌及其应用。所述贝莱斯芽孢杆菌菌株BCP6(Bacillus velezensis)已于2019年5月15日保藏于中国普通微生物菌种保藏管理中心,保藏编号为CGMCC No.17805。本发明的贝莱斯芽孢杆菌对生菜细菌性软腐病和菌核病具有显著抑制效果,同时对灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)、腐皮镰孢菌(Fusarium solani)、尖孢镰刀菌(F.oxysporum)、青霉菌(Penicillium sp.)和立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)等植物病原真菌以及西瓜嗜酸菌(Acidovorax citrulli)、丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)、水稻黄单胞菌(Xanthomonas oryzae)、青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)和边缘假单胞菌(P.marginalis)等植物病原细菌也表现出广谱的抑菌活性。同时该贝莱斯芽孢杆菌表现出耐盐碱性,具有重要的生防应用前景。

    一种基于染色体结构变异的桃果实形状早期检测方法

    公开(公告)号:CN111944918A

    公开(公告)日:2020-11-17

    申请号:CN202010636253.3

    申请日:2020-07-03

    Abstract: 本发明涉及一种基于PCR技术进行栽培桃果形早期鉴定的方法。本发明PCR检测采用4对引物,包括1对用于鉴定INV56F(Flat)的引物(P1),以及3对用于鉴定INV56R(Round)的引物(P2/3/4)。鉴定方法是以待测桃基因组DNA为模板,先用P1、P2分别进行扩增,对扩增产物进行检测,如果获得1391bp及705bp两条特异扩增条带,则果形为扁;如果仅有705bp特异扩增条带,则果形为圆;如果没有获得705bp的条带,则继续用P3引物对进行扩增,如果获得981bp的特异扩增产物条带,则果形为圆,否则再继续用P4引物进行扩增;如果获得651bp的特异扩增产物条带,则果形为圆,否则果形暂时不能判断。该方法引物特异性高,设置对照引物,可有效防止假阴性的产生,具有操作简单、鉴别快速,结果准确等特点。

    一株广谱抗病的贝莱斯芽孢杆菌及其应用

    公开(公告)号:CN110283742A

    公开(公告)日:2019-09-27

    申请号:CN201910519896.7

    申请日:2019-06-17

    Abstract: 本发明涉及一株广谱抗病的生防贝莱斯芽孢杆菌及其应用。所述贝莱斯芽孢杆菌菌株BCP6(Bacillus velezensis)已于2019年5月15日保藏于中国普通微生物菌种保藏管理中心,保藏编号为CGMCC No.17805。本发明的贝莱斯芽孢杆菌对生菜细菌性软腐病和菌核病具有显著抑制效果,同时对灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)、腐皮镰孢菌(Fusarium solani)、尖孢镰刀菌(F.oxysporum)、青霉菌(Penicillium sp.)和立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)等植物病原真菌以及西瓜嗜酸菌(Acidovorax citrulli)、丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)、水稻黄单胞菌(Xanthomonas oryzae)、青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)和边缘假单胞菌(P.marginalis)等植物病原细菌也表现出广谱的抑菌活性。同时该贝莱斯芽孢杆菌表现出耐盐碱性,具有重要的生防应用前景。

    一种特异性引物及其检测方法

    公开(公告)号:CN109868324A

    公开(公告)日:2019-06-11

    申请号:CN201811593856.9

    申请日:2018-12-25

    Abstract: 本发明公开一对用于检测胡萝卜果胶杆菌Pco亚种的引物及其检测方法,所述引物对包括上游引物srlE-F1:5’-TGACTGTGGTGGAACACTTCG-3’和下游引物,srlE-R1:5’-CAGCCAGTGATAAACCAACCG-3’,在所述引物基础上建立胡萝卜果胶杆菌种内P.carotovorum subsp.odoriferum亚种的检测方法。本发明所提供的引物及方法对胡萝卜果胶杆菌P.carotovorum subsp.odoriferum亚种进行检测具有准确性高、特异性强、灵敏度高、检测过程操作简便快速等优点,为田间蔬菜软腐病的早期诊断和病菌的监测技术发展奠定基础。

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