自动测量离体植物软腐病斑面积的方法及装置

    公开(公告)号:CN111862190B

    公开(公告)日:2024-04-05

    申请号:CN202010664458.2

    申请日:2020-07-10

    Abstract: 本发明涉及农业技术领域,具体涉及自动测量离体植物软腐病斑面积的方法及装置。所述方法包括:获取离体植物的样本图片;对所述样本图片中的分辨率进行标定;对所述样本图片中的病斑区域进行提取,在进行所述提取时,采用深度学习中的全卷积神经网络(FCN,Fully Convolutional Networks)对所述病斑区域进行语义分割,自动提取病变区域;所述全卷积神经网络经过人工标注的样本集进行训练;统计所述病斑区域中的像素点总数,计算得到病斑面积。本发明实现了对软腐病斑面积自动、高效、准确测量的目的,可为当前软腐病研究中离体病斑面积测量的实际需求提供支持。

    一种特异性引物及其检测方法

    公开(公告)号:CN109868324B

    公开(公告)日:2022-06-24

    申请号:CN201811593856.9

    申请日:2018-12-25

    Abstract: 本发明公开一对用于检测胡萝卜果胶杆菌Pco亚种的引物及其检测方法,所述引物对包括上游引物srlE‑F1:5’‑TGACTGTGGTGGAACACTTCG‑3’和下游引物,srlE‑R1:5’‑CAGCCAGTGATAAACCAACCG‑3’,在所述引物基础上建立胡萝卜果胶杆菌种内P.carotovorum subsp.odoriferum亚种的检测方法。本发明所提供的引物及方法对胡萝卜果胶杆菌P.carotovorum subsp.odoriferum亚种进行检测具有准确性高、特异性强、灵敏度高、检测过程操作简便快速等优点,为田间蔬菜软腐病的早期诊断和病菌的监测技术发展奠定基础。

    一种检测蔬菜软腐果胶杆菌的特异性PCR引物和qPCR引物及方法和应用

    公开(公告)号:CN112111589A

    公开(公告)日:2020-12-22

    申请号:CN202011061923.X

    申请日:2020-09-30

    Inventor: 陈昌龙 谢华 田宇

    Abstract: 本发明涉及一种检测蔬菜软腐果胶杆菌Pectobacterium polaris的特异性PCR引物和qPCR引物及方法和应用。本发明通过对蔬菜软腐果胶杆菌P.polaris及其近缘种和其他病原菌等138个细菌菌株进行了基因聚类分析,得到四个P.polaris特异基因。本发明基于得到的P.polaris特异基因设计了PCR和qPCR引物,并且经实验验证,PCR和qPCR引物均具备高度的灵敏度和特异性,最低可以检测1pg的样品。本发明提供的PCR和qPCR引物可以准确鉴别出早期蔬菜软腐病样是否携带P.polaris,在蔬菜软腐病的早期诊断中具有重要意义。

    自动测量离体植物软腐病斑面积的方法及装置

    公开(公告)号:CN111862190A

    公开(公告)日:2020-10-30

    申请号:CN202010664458.2

    申请日:2020-07-10

    Abstract: 本发明涉及农业技术领域,具体涉及自动测量离体植物软腐病斑面积的方法及装置。所述方法包括:获取离体植物的样本图片;对所述样本图片中的分辨率进行标定;对所述样本图片中的病斑区域进行提取,在进行所述提取时,采用深度学习中的全卷积神经网络(FCN,Fully Convolutional Networks)对所述病斑区域进行语义分割,自动提取病变区域;所述全卷积神经网络经过人工标注的样本集进行训练;统计所述病斑区域中的像素点总数,计算得到病斑面积。本发明实现了对软腐病斑面积自动、高效、准确测量的目的,可为当前软腐病研究中离体病斑面积测量的实际需求提供支持。

    一株广谱抗病的贝莱斯芽孢杆菌及其应用

    公开(公告)号:CN110283742A

    公开(公告)日:2019-09-27

    申请号:CN201910519896.7

    申请日:2019-06-17

    Abstract: 本发明涉及一株广谱抗病的生防贝莱斯芽孢杆菌及其应用。所述贝莱斯芽孢杆菌菌株BCP6(Bacillus velezensis)已于2019年5月15日保藏于中国普通微生物菌种保藏管理中心,保藏编号为CGMCC No.17805。本发明的贝莱斯芽孢杆菌对生菜细菌性软腐病和菌核病具有显著抑制效果,同时对灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)、腐皮镰孢菌(Fusarium solani)、尖孢镰刀菌(F.oxysporum)、青霉菌(Penicillium sp.)和立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)等植物病原真菌以及西瓜嗜酸菌(Acidovorax citrulli)、丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)、水稻黄单胞菌(Xanthomonas oryzae)、青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)和边缘假单胞菌(P.marginalis)等植物病原细菌也表现出广谱的抑菌活性。同时该贝莱斯芽孢杆菌表现出耐盐碱性,具有重要的生防应用前景。

    一种特异性引物及其检测方法

    公开(公告)号:CN109868324A

    公开(公告)日:2019-06-11

    申请号:CN201811593856.9

    申请日:2018-12-25

    Abstract: 本发明公开一对用于检测胡萝卜果胶杆菌Pco亚种的引物及其检测方法,所述引物对包括上游引物srlE-F1:5’-TGACTGTGGTGGAACACTTCG-3’和下游引物,srlE-R1:5’-CAGCCAGTGATAAACCAACCG-3’,在所述引物基础上建立胡萝卜果胶杆菌种内P.carotovorum subsp.odoriferum亚种的检测方法。本发明所提供的引物及方法对胡萝卜果胶杆菌P.carotovorum subsp.odoriferum亚种进行检测具有准确性高、特异性强、灵敏度高、检测过程操作简便快速等优点,为田间蔬菜软腐病的早期诊断和病菌的监测技术发展奠定基础。

    一种检测蔬菜软腐果胶杆菌的特异性PCR引物和qPCR引物及方法和应用

    公开(公告)号:CN112111589B

    公开(公告)日:2022-09-06

    申请号:CN202011061923.X

    申请日:2020-09-30

    Inventor: 陈昌龙 谢华 田宇

    Abstract: 本发明涉及一种检测蔬菜软腐果胶杆菌Pectobacterium polaris的特异性PCR引物和qPCR引物及方法和应用。本发明通过对蔬菜软腐果胶杆菌P.polaris及其近缘种和其他病原菌等138个细菌菌株进行了基因聚类分析,得到四个P.polaris特异基因。本发明基于得到的P.polaris特异基因设计了PCR和qPCR引物,并且经实验验证,PCR和qPCR引物均具备高度的灵敏度和特异性,最低可以检测1pg的样品。本发明提供的PCR和qPCR引物可以准确鉴别出早期蔬菜软腐病样是否携带P.polaris,在蔬菜软腐病的早期诊断中具有重要意义。

    一株广谱抗病的贝莱斯芽孢杆菌及其应用

    公开(公告)号:CN110283742B

    公开(公告)日:2020-12-15

    申请号:CN201910519896.7

    申请日:2019-06-17

    Abstract: 本发明涉及一株广谱抗病的生防贝莱斯芽孢杆菌及其应用。所述贝莱斯芽孢杆菌菌株BCP6(Bacillus velezensis)已于2019年5月15日保藏于中国普通微生物菌种保藏管理中心,保藏编号为CGMCC No.17805。本发明的贝莱斯芽孢杆菌对生菜细菌性软腐病和菌核病具有显著抑制效果,同时对灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea)、腐皮镰孢菌(Fusarium solani)、尖孢镰刀菌(F.oxysporum)、青霉菌(Penicillium sp.)和立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)等植物病原真菌以及西瓜嗜酸菌(Acidovorax citrulli)、丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)、水稻黄单胞菌(Xanthomonas oryzae)、青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)和边缘假单胞菌(P.marginalis)等植物病原细菌也表现出广谱的抑菌活性。同时该贝莱斯芽孢杆菌表现出耐盐碱性,具有重要的生防应用前景。

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