公开(公告)号：CN119753194A

公开(公告)日：2025-04-04

申请号：CN202411395216.2

申请日：2024-10-08

Applicant: 云南省农业科学院经济作物研究所

Inventor： 潘哲超 ,  隋启君 ,  白建明 ,  杨琼芬 ,  李先平 ,  赵志坚 ,  卢丽丽 ,  王颖 ,  包丽仙 ,  蒋伟 ,  姚春光 ,  李燕山 ,  梁淑敏 ,  杨妍 ,  霍超 ,  王兰 ,  尹自友 ,  曹继芬 ,  张磊 ,  周进华 ,  徐宁生 ,  杨万林

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6837 ,  C40B40/06

Abstract: 本发明属于作物分子育种领域，公开了一种马铃薯50K SNP液相基因芯片与应用，利用778份马铃薯品种简化测序结果，鉴定出16,531,339个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点，根据完整度>0.8，次要基因型频率>0.05过滤，共得到353,753个高一致性的群体SNP，最终筛选得到50167个SNP制作芯片，并设计了相应的探针引物，芯片命名为“薯芯一号”，该芯片共包含50167个全基因组均匀分布、验证优选的多态性SNP标记，性状连锁或功能标记探针。本发明提出的马铃薯50K液相基因芯片SNP具有国内外778份不同地区材料的丰富遗传多样性基础，经过群体结构分析、关联分析、核心种质和核心SNP的筛选，在马铃薯育种中具有应用价值。