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公开(公告)号:CN115786519A
公开(公告)日:2023-03-14
申请号:CN202211538948.3
申请日:2022-12-01
Applicant: 中国计量科学研究院 , 深圳中国计量科学研究院技术创新研究院
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种用于检测泛实体瘤多基因启动子甲基化的定量数字PCR检测试剂及应用,该试剂包括用于检测CDKN2A、RASSF1A、RARβ2和SHOX2基因的甲基化特异性引物探针对和未甲基化特异性引物探针对。本发明采用数字PCR技术针对泛实体瘤多基因(CDKN2A、RASSF1A、RARβ2和SHOX2)进行检测,具有更大的肿瘤鉴别力,对肿瘤的筛查和风险评估、早期诊断、分期分型、预后判断及治疗检测具有重要的意义。本发明的方法具有更高灵敏度、更高准确性和绝对定量,且不受扩增效率的影响,可以更高效地检测极低丰度(0.1%)的启动子甲基化,适用于临床上大量样本的筛选。
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公开(公告)号:CN116024303A
公开(公告)日:2023-04-28
申请号:CN202211387144.8
申请日:2022-11-07
Applicant: 中国计量科学研究院 , 深圳中国计量科学研究院技术创新研究院
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种EML4‑ALK融合基因定量基因组RNA标准物质及其制备方法,该方法提取获得了含有EML4‑ALK融合基因V1和V3a/b两种突变体的基因组RNA,配置酵母RNA储存缓冲液及定量标准品溶液,并设计了相应的引物及探针,采用一步法逆转录数字PCR方法,以所述的EML4‑ALK V1和V3a/b融合突变基因组RNA为模板进行PCR扩增,采集荧光信号来检测EML4‑ALK融合基因V1和V3a/b的表达,从而获得EML4‑ALK融合基因V1、V3a/b和ALK‑ref拷贝数含量和突变基因丰度作为其量值。
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公开(公告)号:CN116334180A
公开(公告)日:2023-06-27
申请号:CN202211387155.6
申请日:2022-11-07
Applicant: 中国计量科学研究院 , 深圳中国计量科学研究院技术创新研究院
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6858 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明公开了一种BCR‑ABL1融合基因定量基因组RNA标准物质及其制备方法,该方法提取获得了含有BCR‑ABL1P210型融合基因b2a2和b3a2两种突变形式的基因组RNA,配置RNA储存缓冲液及定量标准品溶液,并设计了相应的引物及探针,采用一步法逆转录数字PCR方法,以BCR‑ABL1P210型融合突变基因组RNA为模板进行PCR扩增,采集荧光信号来检测BCR‑ABL1P210型融合基因b2a2和b3a2的表达,从而获得BCR‑ABL1P210型融合基因b2a2、b3a2和ABL‑WT拷贝数含量和突变基因丰度作为其量值。
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公开(公告)号:CN115651968A
公开(公告)日:2023-01-31
申请号:CN202211001239.1
申请日:2022-08-19
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12N5/0781
Abstract: 本发明公开了一种同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系全转录组RNA标准物质及制备方法和应用,该标准物质包括从同卵双胞胎家系中父、母、子代双胞胎共4个人源B淋巴细胞系中提取的全转录组RNA,其量值为父亲、母亲、一个子代分别与另一个子代中差异基因表达的比值。该标准物质来自健康人的血液中永生化的B淋巴细胞系,与真实样本具有极高的相似度,可体现真实样本的质量结果。该标准物质一套有4个样本,标准数据集有一套3个样本对比值,可通过多个样本实现对转录组测序数据的评估;该标准数据集是基于两种不同测序技术原理获得的9,000‑11,000个基因表达水平的比值,更适用于转录组测序中对多基因的表达结果的评估。
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公开(公告)号:CN114657235A
公开(公告)日:2022-06-24
申请号:CN202210372220.1
申请日:2022-04-11
Applicant: 中国计量科学研究院
Abstract: 本发明提供了一种用于评估逆转录效率的方法。对所建立的或所使用的逆转录‑PCR定量方法的逆转录效率,提出一套基于同位素稀释质谱法的高准确度逆转录效率评估方案。首先通过逆转录数字PCR对目的基因的RNA进行拷贝数浓度的测定,再进一步通过同位素稀释质谱法来测定该目的基因的RNA拷贝数浓度,计算获得的两种RNA拷贝数浓度的比值,从而获得相应的逆转录体系的逆转录效率。通过对逆转录效率准确评估,修正逆转录PCR结果,从而获得目标RNA分子的准确含量,满足不同领域对RNA分子准确定值的需求。
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公开(公告)号:CN110616251A
公开(公告)日:2019-12-27
申请号:CN201910933145.X
申请日:2019-09-29
Applicant: 中国计量科学研究院
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种用于检测乳腺癌HER2拷贝数变异的数字PCR方法及检测试剂盒,所述试剂盒包括用于检测HER2基因拷贝数变异的至少一对引物及其相配套的一条探针,和用于检测的内参基因的一对引物及其相配套的一条探针。本发明的方法采用三组HER2基因的特异性引物探针和一组内参基因的方式进行,从而有效地排除了单一引物探针扩增导致的假阴性结果,因此相较于现有技术中具有更高的准确性,而且将现有方法的不确定区间1.8-2.2降低至1.0-1.2,具有更高的灵敏度。
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公开(公告)号:CN115786477A
公开(公告)日:2023-03-14
申请号:CN202211552335.5
申请日:2022-12-05
Applicant: 中国计量科学研究院
IPC: C12Q1/686 , C12Q1/6876 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于数字PCR仪拷贝数浓度校准的标准物质及试剂盒,通过提取酶切纯化获得了含有至少1个目标基因片段的质粒DNA,添加TE0.1缓冲液稀释配置标准物质溶液;还设计了用于检测目标基因片段的引物和探针。本发明的用于数字PCR仪拷贝数浓度校准的标准物质及试剂盒,可用于数字PCR仪拷贝数浓度的校准,实现数字PCR仪器的测量结果的准确可靠和可溯源性。
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公开(公告)号:CN110616251B
公开(公告)日:2022-08-05
申请号:CN201910933145.X
申请日:2019-09-29
Applicant: 中国计量科学研究院
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种用于检测乳腺癌HER2拷贝数变异的数字PCR方法及检测试剂盒,所述试剂盒包括用于检测HER2基因拷贝数变异的至少一对引物及其相配套的一条探针,和用于检测的内参基因的一对引物及其相配套的一条探针。本发明的方法采用三组HER2基因的特异性引物探针和一组内参基因的方式进行,从而有效地排除了单一引物探针扩增导致的假阴性结果,因此相较于现有技术中具有更高的准确性,而且将现有方法的不确定区间1.8‑2.2降低至1.0‑1.2,具有更高的灵敏度。
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公开(公告)号:CN114245074A
公开(公告)日:2022-03-25
申请号:CN202111531494.2
申请日:2021-12-14
Applicant: 中国计量科学研究院
Abstract: 本发明公开了一种实验成像系统,用于生物芯片成像,该实验成像系统包括:图像采集模块、USB接口转换模块和第一无线通信模块;所述图像采集模块与所述USB接口转换模块电连接,用于采集生物芯片图像,并将所述生物芯片图像传输至所述USB接口转换模块;所述USB接口转换模块与所述第一无线通信模块电连接,用于实现USB接口的转换,并将所述生物芯片图像传输至所述第一无线通信模块;所述第一无线通信模块与终端通信连接,用于接收所述USB接口转换模块传输的生物芯片图像,并将所述生物芯片图像发送至所述终端,以使所述终端接收所述生物芯片图像并进行展示,通过该实验成像系统对生物芯片进行远程观测,用户可远离生物芯片,可以防止生物污染。
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公开(公告)号:CN115831226A
公开(公告)日:2023-03-21
申请号:CN202211001242.3
申请日:2022-08-19
IPC: G16B20/50 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系全基因DNA标准物质及制备方法和应用,包括同卵双胞胎家系中父、母、子代双胞胎共4个人源B淋巴细胞系全基因DNA,其标准参考数据集为:1)四个标准物质的高置信简单变异集合;2)高置信结构变异SV信息以及对应的高置信参考基因组区域;3)高置信的5’‑甲基胞嘧啶信息,包括5mC的标称特性及丰度参考数据集。本方法制备的标准物质可以用于评估基因组测序的性能;还可用于评估测序和数据分析过程中对SNV、Indel、SV和5mC检出的真阳性、假阳性、真阴性和假阴性水平,为基因组测序技术平台、实验室、相关产品的质量控制与性能验证提供标准物质和标准参考数据。
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