公开(公告)号：CN115655816A

公开(公告)日：2023-01-31

申请号：CN202210999916.7

申请日：2022-08-19

Applicant: 中国计量科学研究院 ,  复旦大学

Inventor： 董莲华 ,  郑媛婷 ,  戴新华 ,  张乃心 ,  方向 ,  龚晓云 ,  杨竞成 ,  郁颖 ,  石乐明

IPC: G01N1/28 ,  G01N33/68

Abstract: 本发明公开了一种同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系代谢物标准物质及制备方法和应用，包括从同卵双胞胎家系中父、母、子代双胞胎共4个人源B淋巴细胞系中提取的代谢物，其量值为父亲、母亲、一个子代分别与另一个子代中代谢物表达的比值。本发明的同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系代谢物标准物质可用于对代谢组检测进行质量控制和性能评价，也可用于评估和消除多批次检测中的技术噪音，为多中心、长期大队列研究的数据整合提供质量保证。

公开(公告)号：CN115651968A

公开(公告)日：2023-01-31

申请号：CN202211001239.1

申请日：2022-08-19

Applicant: 中国计量科学研究院 ,  复旦大学

Inventor： 郑媛婷 ,  董莲华 ,  郁颖 ,  方向 ,  侯湾湾 ,  王霞 ,  杨竞成 ,  刘雅晴 ,  石乐明

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869 ,  C12N5/0781

Abstract: 本发明公开了一种同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系全转录组RNA标准物质及制备方法和应用，该标准物质包括从同卵双胞胎家系中父、母、子代双胞胎共4个人源B淋巴细胞系中提取的全转录组RNA，其量值为父亲、母亲、一个子代分别与另一个子代中差异基因表达的比值。该标准物质来自健康人的血液中永生化的B淋巴细胞系，与真实样本具有极高的相似度，可体现真实样本的质量结果。该标准物质一套有4个样本，标准数据集有一套3个样本对比值，可通过多个样本实现对转录组测序数据的评估；该标准数据集是基于两种不同测序技术原理获得的9,000‑11,000个基因表达水平的比值，更适用于转录组测序中对多基因的表达结果的评估。

公开(公告)号：CN115831226A

公开(公告)日：2023-03-21

申请号：CN202211001242.3

申请日：2022-08-19

Applicant: 中国计量科学研究院 ,  复旦大学

Inventor： 董莲华 ,  郑媛婷 ,  任路瑶 ,  方向 ,  张雨菁 ,  杨竞成 ,  王霞 ,  石乐明

IPC: G16B20/50 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6806

Abstract: 本发明公开了一种同卵双胞胎家系人源B淋巴细胞系全基因DNA标准物质及制备方法和应用，包括同卵双胞胎家系中父、母、子代双胞胎共4个人源B淋巴细胞系全基因DNA，其标准参考数据集为：1)四个标准物质的高置信简单变异集合；2)高置信结构变异SV信息以及对应的高置信参考基因组区域；3)高置信的5’‑甲基胞嘧啶信息，包括5mC的标称特性及丰度参考数据集。本方法制备的标准物质可以用于评估基因组测序的性能；还可用于评估测序和数据分析过程中对SNV、Indel、SV和5mC检出的真阳性、假阳性、真阴性和假阴性水平，为基因组测序技术平台、实验室、相关产品的质量控制与性能验证提供标准物质和标准参考数据。

公开(公告)号：CN114807301A

公开(公告)日：2022-07-29

申请号：CN202111000539.3

申请日：2021-08-27

Applicant: 复旦大学

Inventor： 郑媛婷 ,  幺欣彤 ,  孙善月 ,  杨竞成 ,  任路瑶 ,  王海燕 ,  侯湾湾 ,  郁颖 ,  石乐明

IPC: C12Q1/6806 ,  C12N15/10 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明提供了一种高通量自动化血浆小RNA文库构建方法及其应用，具体地涉及高通量自动化血浆小RNA文库的构建，所述高通量自动化血浆小RNA文库构建方法可用作血浆小RNA表达水平定量研究、挖掘与疾病相关的潜在生物标志物。应用本发明的优化方法，可以在一天之内对96个起始量小于5ng的微量小RNA样本完成文库构建，通过高通量测序后，可以获得质量良好的数据。经性能评估分析，本发明的技术具有良好的跨批次稳定性，对于不同生物样本小RNA表达水平的内在生物学差异具有良好的区分能力，可用于超大型队列的小RNA文库构建实验。