微量蛋白质样本的蛋白组分析方法

    公开(公告)号:CN116794179A

    公开(公告)日:2023-09-22

    申请号:CN202310708767.9

    申请日:2023-06-15

    Inventor: 张珅 雷姣 林戈

    Abstract: 本申请涉及一种微量蛋白质样本的蛋白组分析方法。该微量蛋白质样本的蛋白组分析方法包括如下步骤:在数据依赖模式的无动态排除功能下对微量蛋白质样本进行质谱分析,并采集同一肽段不同价态的一级质谱母离子的各二级质谱,所述质谱分析中,二级质谱累积时间为30ms~60ms,二级质谱扫描次数为50次~100次,二级谱扫描的母离子强度阈值为10cps~30cps。该微量蛋白质样本的质谱数据的采集方法可以对同一肽段相同和不同价态的母离子多次碎裂和扫描,提高了微量蛋白质样本的蛋白质和肽段的鉴定数目。且避免了由于扫描的随机性和不重现性而影响定量准确度和重现性,提高多重定量标记样本的谱图纯度和定量准确度。

    构建目标蛋白质组谱图库的方法和应用

    公开(公告)号:CN116844640A

    公开(公告)日:2023-10-03

    申请号:CN202310806229.3

    申请日:2023-07-03

    Abstract: 本申请涉及一种构建目标蛋白质组谱图库的方法和在微量目标蛋白质组分析上的应用,方法包括:通过不同扫描范围对目标蛋白质组进行多次无动态排除的数据依赖采集模式的质谱扫描,以得到目标蛋白质组的质谱数据,目标蛋白质组的质谱数据包括目标蛋白质组多个扫描范围的一级谱,以及每个扫描范围中母离子强度满足预设阈值的二级谱;基于目标蛋白质组的质谱数据进行搜库以构建目标蛋白质组谱图库。本申请通过多个扫描范围无动态排除的数据依赖采集的质谱数据构建谱图库,对微量蛋白质组的DIA数据进行搜库分析,提高了DIA数据匹配的成功率,进而提高DIA数据分析的准确性和灵敏度,提高了微量蛋白鉴定的准确性和灵敏度。

    单细胞蛋白组样品的处理方法及单细胞蛋白组分析方法

    公开(公告)号:CN116660544A

    公开(公告)日:2023-08-29

    申请号:CN202310503705.4

    申请日:2023-05-06

    Abstract: 本申请涉及一种单细胞蛋白组样品的处理方法,包括如下步骤:取单细胞样品,加入0.01w%~0.2w%非离子型表面活性剂进行超声裂解,得到前处理样品;将所述前处理样品进行变性还原烷基化处理,得到烷基化样品;向所述烷基化样品中加入固定化酶反应器进行酶解0.5h~4h,离心取上清液,获得处理后样品;所述固定化酶反应器的制备方法,包括如下步骤:向氨基聚合物微球中加入聚乙烯亚胺反应后,得到亲水性氨基聚合物微球;向所述亲水性氨基聚合物微球中加入氧化石墨烯反应后,得到氧化石墨烯‑聚合物微球;将含有苯甲脒的蛋白酶溶液加入到所述氧化石墨烯‑聚合物微球中,反应后,得到所述固定化酶反应器。

    富集内源性磷酸化肽的材料及其制备方法和应用

    公开(公告)号:CN117899821A

    公开(公告)日:2024-04-19

    申请号:CN202410035769.0

    申请日:2024-01-10

    Abstract: 本申请涉及一种富集内源性磷酸化肽的材料及其制备方法和应用。该用于富集内源性磷酸化肽的材料,包括:固相载体,所述固相载体修饰有硅羟基;经连接基团接枝于所述固相载体之上的磷酸基团;所述连接基团包含第一连接基团和第二连接基团,所述第一连接基团经所述硅羟基接枝于所述固相载体,所述第二连接基团的一端经烷基接枝于所述第一连接基团,所述第二连接基团的另一端与所述磷酸基团接枝;以及螯合在所述磷酸基团的锆离子。上述用于富集内源性磷酸化肽的材料不仅对不同种类的磷酸化肽段表现出独特的亲和力,还可以高灵敏度和高选择性富集内源性磷酸化肽,提高内源性磷酸肽鉴定数目。

    蛋白样品的处理方法及蛋白组分析方法

    公开(公告)号:CN117030899A

    公开(公告)日:2023-11-10

    申请号:CN202311089573.1

    申请日:2023-08-28

    Abstract: 本申请涉及一种蛋白样品的处理方法,包括如下步骤:将蛋白样品与烷基化试剂混合,封闭游离的半胱氨酸,得到封闭后样品;将所述封闭后样品通过超滤膜后进行离心处理,得到膜上样品;所述超滤膜的孔径范围为10kDa~30kDa;对所述膜上样品进行第一次还原,得到第一还原后样品;向所述第一还原后样品中加入生物素标记试剂,得到标记后样品;酶解所述标记后样品,得到酶解后样品;向所述酶解后样品中加入亲和素微珠状琼脂糖吸附生物素标记的蛋白,得到富集后样品;对所述富集后样品进行还原及烷基化处理,获得处理后样品。

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