一种基于三色荧光标记的核酸测序方法

    公开(公告)号:CN105219865B

    公开(公告)日:2018-08-21

    申请号:CN201510698306.3

    申请日:2015-10-22

    Applicant: 东南大学

    Inventor: 肖鹏峰 王柳

    Abstract: 本发明公开了一种基于三色荧光标记的核酸测序方法。该方法将四类测序探针或核苷酸中三类用不同荧光染料标记、而另一类未做标记。每个DNA模板每次的测序信息通过比较三类标记染料的荧光强度、以及DNA模板定位的杂交荧光强度而获得。当三类荧光强度的数值有明显不同,且其中一类荧光强度数值分别高于另外两类荧光强度数值的3倍以上时,这个高的荧光即为测序信息;而当三类的荧光强度数值相差不大、且其强度低于DNA模板定位的杂交荧光强度的1/3时,未标记的探针或核苷酸即为测序信息。

    一种基于两核苷酸合成测序的PCR产物SNP分型/突变检测方法

    公开(公告)号:CN106047990A

    公开(公告)日:2016-10-26

    申请号:CN201510691117.3

    申请日:2015-10-22

    Applicant: 东南大学

    Inventor: 肖鹏峰 王柳

    CPC classification number: C12Q1/6869 C12Q2563/149 C12Q2563/143 C12Q2565/301

    Abstract: 本发明提供了一种基于两核苷酸合成测序的PCR产物SNP分型/突变检测方法。通过循环将两核苷酸同时加入到测序反应中,每个测序反应得到的不是具体的碱基序列,而是加入的两核苷酸种类的编码及其核苷酸合成的编码数目组成的信息,根据每个分析位点的野生型、突变型、杂合型均对应唯一、独特的两类编码及其编码数目的测序信息判断出待测PCR产物的SNP分型/突变类型。利用该测序方法阅读长度的特点,可以实现只需一条测序引物即可获得多个位点的分析,避免了利用多重测序引物进行多个分析。该方法有效减少了SNP分型/突变检测的成本、降低测序所需模板量、提高检测灵敏度、缩短操作时间。

    一种基于三色荧光标记的核酸测序方法

    公开(公告)号:CN105219865A

    公开(公告)日:2016-01-06

    申请号:CN201510698306.3

    申请日:2015-10-22

    Applicant: 东南大学

    Inventor: 肖鹏峰 王柳

    CPC classification number: C12Q1/6869 C12Q2561/101

    Abstract: 本发明公开了一种基于三色荧光标记的核酸测序方法。该方法将四类测序探针或核苷酸中三类用不同荧光染料标记、而另一类未做标记。每个DNA模板每次的测序信息通过比较三类标记染料的荧光强度、以及DNA模板定位的杂交荧光强度而获得。当三类荧光强度的数值有明显不同,且其中一类荧光强度数值分别高于另外两类荧光强度数值的3倍以上时,这个高的荧光即为测序信息;而当三类的荧光强度数值相差不大、且其强度低于DNA模板定位的杂交荧光强度的1/3时,未标记的探针或核苷酸即为测序信息。

    一种含通用碱基寡核苷酸序列及其在DNA杂交分析中的应用

    公开(公告)号:CN103484458A

    公开(公告)日:2014-01-01

    申请号:CN201310469720.8

    申请日:2013-10-10

    Applicant: 东南大学

    Abstract: 本发明公开了一种含通用碱基寡核苷酸序列及其在DNA杂交分析中的应用。所述含通用碱基寡核苷酸序列包括基本碱基和通用碱基,所述基本碱基与目标序列完全互补,其中包括与目标序列SNV位点对应的基本碱基;所述通用碱基不能对应目标序列SNV位点,位于与目标序列SNV位点对应的基本碱基的一侧或两侧;所述基本碱基为A、G、C、T,所述通用碱基是与A、G、C、T都能形成氢键配对的核苷。本发明的最大优点是实现了DNA序列中单碱基错配的有效分析。

Patent Agency Ranking