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公开(公告)号:CN102634586A
公开(公告)日:2012-08-15
申请号:CN201210128597.9
申请日:2012-04-27
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/122
Abstract: 一种两核苷酸实时合成DNA解码测序方法,单个测序反应由X、Y两个不同的核苷酸同时进行,依据合成核苷酸数目与实时产生的检测分子数的定量关系,得到一个碱基序列片段编码XYn。整个测序包括对同一模板进行二组测序反应:每组测序由包含四个核苷酸dATP、dCTP、dGTP、dTTP,按照每个核苷酸在一个循环中只使用一次的方式,进行由两个不同核苷酸同时合成测序反应的循环,若干次测序反应后得到由一组按照测序顺序排列的若干XYn信息;当该组测序反应完成后,变性将测序引物延伸链清除,重新杂交测序引物,进行第二组测序反应,得到第二测序反应排列的若干XYn信息,最后通过解码二组按照测序顺序排列的若干XYn信息,组装出待测核酸片段的具体碱基序列。
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公开(公告)号:CN102634586B
公开(公告)日:2013-10-30
申请号:CN201210128597.9
申请日:2012-04-27
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/122
Abstract: 一种两核苷酸实时合成DNA解码测序方法,单个测序反应由X、Y两个不同的核苷酸同时进行,依据合成核苷酸数目与实时产生的检测分子数的定量关系,得到一个碱基序列片段编码XYn。整个测序包括对同一模板进行二组测序反应:每组测序由包含四个核苷酸dATP、dCTP、dGTP、dTTP,按照每个核苷酸在一个循环中只使用一次的方式,进行由两个不同核苷酸同时合成测序反应的循环,若干次测序反应后得到由一组按照测序顺序排列的若干XYn信息;当该组测序反应完成后,变性将测序引物延伸链清除,重新杂交测序引物,进行第二组测序反应,得到第二测序反应排列的若干XYn信息,最后通过解码二组按照测序顺序排列的若干XYn信息,组装出待测核酸片段的具体碱基序列。
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公开(公告)号:CN103484458A
公开(公告)日:2014-01-01
申请号:CN201310469720.8
申请日:2013-10-10
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明公开了一种含通用碱基寡核苷酸序列及其在DNA杂交分析中的应用。所述含通用碱基寡核苷酸序列包括基本碱基和通用碱基,所述基本碱基与目标序列完全互补,其中包括与目标序列SNV位点对应的基本碱基;所述通用碱基不能对应目标序列SNV位点,位于与目标序列SNV位点对应的基本碱基的一侧或两侧;所述基本碱基为A、G、C、T,所述通用碱基是与A、G、C、T都能形成氢键配对的核苷。本发明的最大优点是实现了DNA序列中单碱基错配的有效分析。
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