公开(公告)号：CN119776537A

公开(公告)日：2025-04-08

申请号：CN202411900829.7

申请日：2024-12-23

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 杨金城 ,  张乐 ,  周雨珂 ,  于梦佳 ,  管箫 ,  褚佳宁 ,  邹奥 ,  张琦 ,  王文慧 ,  杨淑慧 ,  徐艳春

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6869 ,  G16B20/20 ,  G16B30/10

Abstract: 本发明提出了一种遗传标记及其在华南虎个体识别中的应用，属于分子鉴定技术领域。本发明提供了一种遗传标记包括解决了300个SNP分子标记，其可应用华南虎个体识别中，并提供了个体识别的方法。本发明解决了传统RFID芯片在个体身份识别上的不足的问题。同时，也解决了现有分子鉴定主要依赖STR和SNP位点扩增、前期需设计大量特异性引物并反复优化、过程繁琐且费时的问题。建立了一个便捷、可靠且成本低的华南虎个体身份识别方法，为遗传管理和种群保护提供了强有力的技术支持。

公开(公告)号：CN119943139A

公开(公告)日：2025-05-06

申请号：CN202510028577.1

申请日：2025-01-08

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 徐艳春 ,  王文慧 ,  杨淑慧 ,  张琦 ,  高鹏 ,  杨金城 ,  刘丹 ,  徐海涛

IPC: G16B20/30 ,  G16B40/00 ,  G06N20/10 ,  G06N20/20

Abstract: 本发明提出了一种基于DNA甲基化异质性指标构建的表观遗传时钟计算模型及构建方法，属于生物信息学技术领域。本发明基于粪便中DNA甲基化异质性指标构建了一种表观遗传时钟计算模型，DNA甲基化异质性指标包括甲基化熵指标、表观多态性指标、不一致读取对比例指标和不一致读取对的定量比例指标，解决了现有技术中对野生动物或大型动物年龄估算方法存在材料获取困难、CpG位点检测困难和年龄估算方法较为复杂等问题。本发明提供的表观遗传时钟计算模型准确性更高、简便快捷。

公开(公告)号：CN119541634A

公开(公告)日：2025-02-28

申请号：CN202411599910.6

申请日：2024-11-11

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 徐艳春 ,  瓦拉·穆罕默德 ,  杨淑慧 ,  张琦 ,  杨金城

IPC: G16B20/40 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/6888 ,  C12N15/11 ,  G16B25/00 ,  G16B30/10 ,  G16B45/00

Abstract: 一种单独使用全基因组重测序数据进行杂交检测的方法，属于分子生物学技术领域。本发明为解决现有技术中杂交检测的方法存在高成本、准确率较低、需要纯父母本参考基因组信息的技术问题，提供了一种基于核线粒体DNA重测序数据检测杂交个体的方法，所述方法基于目标个体的全基因组重测序数据与核线粒体DNA片段，根据核线粒体DNA片段与其线粒体同源片段之间的遗传距离数据集所绘制的折线图进行杂交检测结果的判断。本发明提供的杂交个体的检测方法具有较高的准确性，规避了需要设计对父母本都有效的遗传标记的技术难题，以及无需检测目标个体的纯父母本参考基因组，降低了检测成本，扩大了适用范围。

公开(公告)号：CN119479791A

公开(公告)日：2025-02-18

申请号：CN202411497928.5

申请日：2024-10-25

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 周永恒 ,  徐艳春 ,  崔靓玉 ,  杨金城 ,  于梦佳

IPC: G16B20/30 ,  G16B20/20

Abstract: 一种片段化DNA重测序数据中变异位点的筛选方法，属于生物技术领域。本发明为解决现有技术中缺少高效、准确筛选片段化DNA重测序数据中变异位点的方法，提供了一种片段化DNA重测序数据中变异位点的筛选方法，所述筛选方法在序列比对中‑fq转.sai文件时，选择‑l min‑size‑n 0.04为参数；在序列比对中‑.sai转.sam文件时，选择‑o＝1000为参数；在变异位点筛选时，选择参数MQ阈值为36。本发明提供的筛选方法，与传统变异位点筛选方法相比，在保证高效比对率的同时，显著缩短了差异位点筛选的运行时间，提高了少选结果的准确度，所述方法可应用于片段化DNA重测序数据中变异位点的筛选。