公开(公告)号：CN119776537A

公开(公告)日：2025-04-08

申请号：CN202411900829.7

申请日：2024-12-23

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 杨金城 ,  张乐 ,  周雨珂 ,  于梦佳 ,  管箫 ,  褚佳宁 ,  邹奥 ,  张琦 ,  王文慧 ,  杨淑慧 ,  徐艳春

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6869 ,  G16B20/20 ,  G16B30/10

Abstract: 本发明提出了一种遗传标记及其在华南虎个体识别中的应用，属于分子鉴定技术领域。本发明提供了一种遗传标记包括解决了300个SNP分子标记，其可应用华南虎个体识别中，并提供了个体识别的方法。本发明解决了传统RFID芯片在个体身份识别上的不足的问题。同时，也解决了现有分子鉴定主要依赖STR和SNP位点扩增、前期需设计大量特异性引物并反复优化、过程繁琐且费时的问题。建立了一个便捷、可靠且成本低的华南虎个体身份识别方法，为遗传管理和种群保护提供了强有力的技术支持。

公开(公告)号：CN117721219A

公开(公告)日：2024-03-19

申请号：CN202311778967.8

申请日：2023-12-22

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 徐艳春 ,  于梦佳 ,  庞坤杰 ,  高昀露 ,  郭小森 ,  杨淑慧 ,  朱兆章 ,  王文慧

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/12 ,  C12N15/53 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及野生动物物种鉴定领域，尤其涉及指基于线粒体DNA多区段扩增子高通量测序的通用性鉴定鸟类物种的分子标记、引物及其应用通用性鉴定鸟类物种的分子标记、引物及其应用，并评估该方法在单一鸟类样本和混合鸟类样本中的灵敏度和适用性；本发明在线粒体多个DNA条形码标记上设计引物，这些引物在鸟类中具有普遍适用性，并有助于在降解样本中识别鸟类，相较于现有的鉴定方法，该方法不仅可以对单一鸟类样本进行物种鉴定，并且可解决鸟类混合样本鉴定的问题，实现了高灵敏度、高通量、节省试剂和珍贵样本等特点。

公开(公告)号：CN117144021A

公开(公告)日：2023-12-01

申请号：CN202311187311.9

申请日：2023-09-14

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 徐艳春 ,  王文慧 ,  张琦 ,  于梦佳 ,  陈晓琳

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6851 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一种鉴别环颈雉来源的方法，其包括如下步骤：提取野生环颈雉和圈养环颈雉不同骨骼肌差异显著的基因位点；针对所述基因位点进行甲基化敏感性高分辨率熔解检测，并验证甲基化位点；设计相应的引物进行PCR扩增；构建不同引物的甲基化率标准曲线，以及样本甲基化Tm值得到差异甲基化位点，获得各位点的单点判别力和联合判别力；通过野生和圈养之间的差异达到鉴别环颈雉的来源；本发明提供一种利用甲基化敏感性高分辨率熔解技术定量检测环颈雉不同骨骼肌差异基因位点的甲基化率，通过在野生和圈养两组之间的差异达到鉴别环颈雉来源的方法，可应用于更多动物甲基化差异位点的筛选。

公开(公告)号：CN119479791A

公开(公告)日：2025-02-18

申请号：CN202411497928.5

申请日：2024-10-25

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 周永恒 ,  徐艳春 ,  崔靓玉 ,  杨金城 ,  于梦佳

IPC: G16B20/30 ,  G16B20/20

Abstract: 一种片段化DNA重测序数据中变异位点的筛选方法，属于生物技术领域。本发明为解决现有技术中缺少高效、准确筛选片段化DNA重测序数据中变异位点的方法，提供了一种片段化DNA重测序数据中变异位点的筛选方法，所述筛选方法在序列比对中‑fq转.sai文件时，选择‑l min‑size‑n 0.04为参数；在序列比对中‑.sai转.sam文件时，选择‑o＝1000为参数；在变异位点筛选时，选择参数MQ阈值为36。本发明提供的筛选方法，与传统变异位点筛选方法相比，在保证高效比对率的同时，显著缩短了差异位点筛选的运行时间，提高了少选结果的准确度，所述方法可应用于片段化DNA重测序数据中变异位点的筛选。

公开(公告)号：CN119446288A

公开(公告)日：2025-02-14

申请号：CN202411467387.1

申请日：2024-10-21

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 徐艳春 ,  王文慧 ,  杨淑慧 ,  崔靓玉 ,  刘博洋 ,  褚佳宁 ,  邹奥 ,  于梦佳 ,  刘丹 ,  徐海涛

IPC: G16B40/20 ,  G16B20/30 ,  G16B30/10

Abstract: 一种基于粪便DNA计算年龄的模型及构建方法，属于生物信息学技术领域。本发明通过以粪便为材料解决了现有技术中所需材料不宜获的问题，并且本发明首次公开了一种mtDNA异质性位获得的方法，可以更精准捕捉目标mtDNA异质性位点。基于目标mtDNA异质性位点和机器学习构建了一套筛选与年龄相关的检测位点的方法学流程，并构建了一种基于粪便DNA中的mtDNA异质性位点计算年龄的模型，该模型主要应用于计算大型动物或野生动物年龄，该模型解决了现有技术中成本较高的问题。