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公开(公告)号：CN116403640A
公开(公告)日：2023-07-07
申请号：CN202310304174.6
申请日：2023-03-27
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种同一组织外泌体miRNA和单细胞核转录组数据联合分析，以获取miRNA介导的细胞群调控网络的方法。通过鉴定单细胞核转录组数据中primarymiRNA及其在mRNA细胞类群中的表达数据，可获得上游细胞和miRNA关系对；通过关联外泌体miRNA表达数据、单细胞mRNA表达数据，可获得miRNA和下游细胞类型gene(mRNA)关系对；最后基于前两种方法结果和单细胞转录组细胞通讯数据，可构建完整上游细胞‑miRNA‑下游细胞功能互作调控网络，为鉴定特定miRNA的来源细胞类型以及下游调控细胞类型，明确不同细胞类型之间的互作与调控提供了数据支持。实现从实验到生物信息分析的同一组织外泌体miRNA测序分析及单细胞核测序分析的完整技术方案。本发明还公开了实现上述方法的系统及方法的应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN112634982A
公开(公告)日：2021-04-09
申请号：CN202011320196.4
申请日：2020-11-23
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种筛选与研究目的相关的关键基因、关键蛋白集的方法，包括以下步骤：对不同组学数据内容，以差异基因/蛋白或差异基因/蛋白并集为总目标集，筛选出与研究相关的指标，根据所述指标的生物学意义进行赋值；使用一套支持自定义修改和权重设置的打分机制，对总目标集的各个指标进行综合打分；对综合打分的topN基因/蛋白，进行表达和功能上的复现和展示，根据结果返回验证筛选的准确性。本发明不仅可以通过筛选出的top目标集的表达和功能复现实现自我验证和自我完善，也可以通过目标筛选数据集的积累形成字典不断丰富和完善，从而使得整套方法更趋准确和可靠。
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公开(公告)号：CN111709219A
公开(公告)日：2020-09-25
申请号：CN202010349145.8
申请日：2020-04-28
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: G06F40/169 , G06F40/174 , G06F40/18 , G06F40/166 , G06T11/40 , G16B45/00 , G06F16/81
Abstract: 本发明提供了单组学及多组学KEGG PATHWAY map表达热图个性化展示的方法及应用，在多组学联合的KEGG PATHWAY map中，通过颜色标尺以及元素填充色、元素图形展现等方式同时批量呈现各组学元素在各KEGG PATHWAY map中的表达、差异水平及其显著性。基于此发明，可以对KEGG PATHWAY map在单组学，多组学范围内进行拓展，可批量处理、可个性化修改，可从转录、蛋白和代谢中单一组学到多组学以不同尺度不同形式清晰具体展示其中元素的表达及显著性。
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公开(公告)号：CN112634982B
公开(公告)日：2023-06-16
申请号：CN202011320196.4
申请日：2020-11-23
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种筛选与研究目的相关的关键基因、关键蛋白集的方法，包括以下步骤：对不同组学数据内容，以差异基因/蛋白或差异基因/蛋白并集为总目标集，筛选出与研究相关的指标，根据所述指标的生物学意义进行赋值；使用一套支持自定义修改和权重设置的打分机制，对总目标集的各个指标进行综合打分；对综合打分的topN基因/蛋白，进行表达和功能上的复现和展示，根据结果返回验证筛选的准确性。本发明不仅可以通过筛选出的top目标集的表达和功能复现实现自我验证和自我完善，也可以通过目标筛选数据集的积累形成字典不断丰富和完善，从而使得整套方法更趋准确和可靠。
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公开(公告)号：CN111709219B
公开(公告)日：2021-06-18
申请号：CN202010349145.8
申请日：2020-04-28
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: G06F40/169 , G06F40/174 , G06F40/18 , G06F40/166 , G06T11/40 , G16B45/00 , G06F16/81
Abstract: 本发明提供了单组学及多组学KEGG PATHWAY map表达热图个性化展示的方法及应用，在多组学联合的KEGG PATHWAY map中，通过颜色标尺以及元素填充色、元素图形展现等方式同时批量呈现各组学元素在各KEGG PATHWAY map中的表达、差异水平及其显著性。基于此发明，可以对KEGG PATHWAY map在单组学，多组学范围内进行拓展，可批量处理、可个性化修改，可从转录、蛋白和代谢中单一组学到多组学以不同尺度不同形式清晰具体展示其中元素的表达及显著性。
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公开(公告)号：CN113593645A
公开(公告)日：2021-11-02
申请号：CN202110878793.7
申请日：2021-08-02
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明提供了一种cDNA文库基因序列移码判断的方法，属于基因分析技术领域；本发明的方法能够批量获得与待比对cDNA所匹配的目标序列，根据位置数检测得出cDNA在载体中是否移码的结果，不再因开源数据库的维护、网速等的限制影响分析效率，极大的提高了基因比对分析效率。
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