公开(公告)号：CN117659147A

公开(公告)日：2024-03-08

申请号：CN202311554770.6

申请日：2023-11-21

Applicant: 中国农业科学院作物科学研究所 ,  中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)

Inventor： 张帆 ,  徐建龙 ,  姜静 ,  纳威德 ,  王文生 ,  赵秀琴

IPC: C07K14/415 ,  C12N15/29 ,  C12N15/84 ,  A01H5/10 ,  A01H5/00 ,  A01H6/46

Abstract: 本发明公开了水稻qST5蛋白在调控植物苗期耐盐性中的应用，涉及生物领域。该蛋白质为下述任一种：A1)氨基酸序列是SEQ ID No.1的蛋白质，A2)将SEQ ID No.1所示的氨基酸序列经过氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的与A1)所示的蛋白质具有80％以上的同一性且具有相同功能的蛋白质；A3)在A1)或A2)的N端和/或C端连接标签得到的具有相同功能的融合蛋白质。本发明的OsCHX11过表达株系的在盐胁迫下的存活率显著提高，由此可见OsCHX11正向调控水稻耐盐性。

公开(公告)号：CN117116350B

公开(公告)日：2024-02-27

申请号：CN202311388051.1

申请日：2023-10-25

Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)

Inventor： 钱坤 ,  李若男 ,  刘万飞 ,  林强 ,  崔鹏

IPC: G16B30/00 ,  G16B40/20 ,  G16B40/30 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/08 ,  G06F18/23 ,  G06F18/24

Abstract: 本申请提供一种RNA测序数据的校正方法、装置、电子设备及存储介质，RNA测序数据的校正方法，包括：利用预先构建的校正模型，对RNA测序数据进行校正处理，获得校正后的RNA测序数据；校正模型基于对变分自编码器的训练获得；变分自编码器包括校正模型，变分自编码器用于提取RNA测序样本中的噪声信息分布和校正后的RNA测序样本中的生物学信息分布，并结合噪声信息分布和生物学信息分布，对RNA测序样本进行解码还原处理，获得还原后的RNA测序样本；变分自编码器，至少基于还原后的RNA测序样本和(56)对比文件钱坤 等.基于 ＲＮＡ－ｓｅｑ技术对不同品种猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释《.西北农林科技大学学报（自然科学版）》.2016,第44卷(第6期),第1-8页.刘腾 等.基于变分自编码器的空间转录组细胞聚类研究 《.生物信息学》.2023,第1-10页.Luca Alessandri et al.Sparsely-connected autoencoder (SCA) for singlecell RNAseq data mining《.npj SystemsBiology and Applications》.2021,第1-10页.Lucas Seninge ET AL.VEGA is aninterpretable generative model forinferring biological network activity insingle-cell transcriptomics《.NATURECOMMUNICATIONS》.2021,第1-9页.Wolfgang Kopp ET AL.Simultaneousdimensionality reduction and integrationfor single-cell ATAC-seq data using deeplearning《.NATURE MACHINE INTELLIGENCE》.2022,第4卷第162-168页.

公开(公告)号：CN120026095A

公开(公告)日：2025-05-23

申请号：CN202510149957.0

申请日：2025-02-11

Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)

Inventor： 周永锋 ,  许延帅 ,  陈程 ,  金仲鑫 ,  刘文文 ,  徐小东 ,  王文睿 ,  肖华

IPC: C12Q1/6809 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本发明公开了基于全基因组变异图谱的高精准度葡萄品种鉴定DNA条形码方法，本发明涉及葡萄栽培技术领域，本发明包括：步骤一：从全球不同葡萄栽培区选取涵盖酿酒、制干、鲜食的主要代表性的葡萄栽培品种，获取多个个体作为样本；步骤二：使用CTAB法从葡萄叶片中提取基因组DNA，并采用高通量测序技术对提取的DNA进行重测序；步骤三：将重测序数据比对至参考基因组中，筛选出具有品种特异性的SNP和InDel变异位点，并对其进行注释，挑选出合适的变异位点作为DNA条形码；步骤四：针对筛选出的DNA条形码，提取其变异位点上下游150bp对应序列，使用primer3软件设计引物。

公开(公告)号：CN120005895A

公开(公告)日：2025-05-16

申请号：CN202311525475.8

申请日：2023-11-15

Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心) ,  中国农业科学院农业基因组研究所

Inventor： 黄三文 ,  董莎萌 ,  柯宇航 ,  张春芝 ,  王路遥 ,  王培

IPC: C12N15/29 ,  C07K14/415 ,  C12N15/113 ,  C12N15/84 ,  A01H5/10 ,  A01H5/00 ,  A01H6/82 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本申请涉及基因分离和植物改良技术领域，具体涉及晚疫病抗性基因、生物材料及应用。本发明提供的Rpi‑HMA13核酸分子包含：SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列；SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列；编码SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列的核苷酸序列。本发明为马铃薯抗晚疫病育种提供了重要的基因资源，克服马铃薯品种抗病性丧失问题，为马铃薯持久抗病提供新的保障。

公开(公告)号：CN120005894A

公开(公告)日：2025-05-16

申请号：CN202311524783.9

申请日：2023-11-15

Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心) ,  中国农业科学院农业基因组研究所

Inventor： 黄三文 ,  董莎萌 ,  王路遥 ,  张春芝 ,  李玉营 ,  王培

IPC: C12N15/29 ,  C07K14/415 ,  C12N15/113 ,  C12N15/84 ,  A01H5/10 ,  A01H5/00 ,  A01H6/82 ,  C12Q1/6895

Abstract: 本申请涉及基因分离和植物改良技术领域，具体涉及晚疫病抗性基因、生物材料及应用。本发明Rpi‑caj1核酸分子包含：SEQ ID NO:1～6中任一所示的核苷酸序列；编码SEQ ID NO:7～12中任一所示的氨基酸序列的核苷酸序列；SEQ ID NO:13～18中任一所示的核苷酸序列；与上述核苷酸序列具有至少75％序列同一性的核苷酸序列。本发明为马铃薯抗晚疫病育种提供了重要的基因资源，克服马铃薯品种抗病性丧失问题，为马铃薯持久抗病提供新的保障。

公开(公告)号：CN119842733A

公开(公告)日：2025-04-18

申请号：CN202510032878.1

申请日：2025-01-09

Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)

Inventor： 周绍群 ,  黄三文 ,  王志清 ,  余胜 ,  王燕姿

IPC: C12N15/29 ,  C07K14/415 ,  C12N15/82 ,  A01H5/00 ,  A01H6/82

Abstract: 本发明属于分子生物学育种技术领域，具体涉及RIN4家族基因在提高番茄对致病疫霉抗性中的应用。本发明在番茄中发现并验证了两个致病疫霉感病相关的基因，其基因组核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示，这两个基因均属于RIN4基因家族成员。通过基因编辑技术敲除或沉默上述基因，发现敲除或沉默上述基因的番茄品系相较于野生型具有更高的致病疫霉抗性。同时，这些基因编辑的番茄品系在生长和发育方面未受到明显影响。因此，本发明不仅丰富了番茄中致病疫霉感病相关基因的研究，更是利用上述基因的特性开发出致病疫霉抗性增强的番茄品系，为番茄育种提供了新的技术策略和基因资源。

公开(公告)号：CN119824003A

公开(公告)日：2025-04-15

申请号：CN202510032756.2

申请日：2025-01-09

Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)

Inventor： 周绍群 ,  黄三文 ,  王志清 ,  余胜 ,  王燕姿

IPC: C12N15/29 ,  C07K14/415 ,  C12N15/82 ,  A01H5/00 ,  A01H6/82

Abstract: 本发明属于分子生物学育种技术领域，具体涉及PP2C家族基因在提高番茄对致病疫霉抗性中的应用。本发明在番茄中发现并验证了两个致病疫霉感病相关的基因，其基因组核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示，这两个基因均属于PP2C基因家族成员。通过基因编辑技术敲除或沉默上述基因，发现敲除或沉默上述基因的番茄品系相较于野生型具有更高的致病疫霉抗性。同时，这些基因编辑的番茄品系在生长和发育方面未受到明显影响。因此，本发明不仅丰富了番茄中致病疫霉感病相关基因的研究，更是利用上述基因的特性开发出致病疫霉抗性增强的番茄品系，为番茄育种提供了新的技术策略和基因资源。

公开(公告)号：CN115747257B

公开(公告)日：2025-04-11

申请号：CN202211518677.5

申请日：2022-11-29

Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心) ,  中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心 ,  中国科学院上海营养与健康研究所

Inventor： 左二伟 ,  孙怡迪 ,  魏武 ,  闫娜娜 ,  冯虎

IPC: C12N15/85 ,  C12N15/113 ,  C12N15/65 ,  C12N15/864 ,  A01K67/0278

Abstract: 本发明公开了一种使用转基因小鼠对基因编辑技术进行安全性评价的方法，将携带碱基编辑器元件的转座子载体和PBase mRNA注射到C57BL/6J小鼠受精卵中，然后移植到ICR假孕雌性小鼠受体。将成功整合相应碱基编辑器元件的F0小鼠自交，建立转基因小鼠父母本。再由整合有相应碱基编辑器元件的父母本交配，分别获得了整合有BE3、YE1‑BE3‑FNLS、ABE7.10F148A编辑器的转基因小鼠系，利用这些转基因小鼠系进行了基因编辑技术的安全性评价，保证了评价的全面性、完整性、准确性。

公开(公告)号：CN119776298A

公开(公告)日：2025-04-08

申请号：CN202510020362.5

申请日：2025-01-07

Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心) ,  江苏开放大学(江苏城市职业学院)

Inventor： 向勇 ,  张袁博 ,  李智强 ,  龙卫华

IPC: C12N9/02 ,  C12N15/53 ,  C12N15/82 ,  C12N5/10 ,  A01H5/00 ,  A01H6/20 ,  A01H6/82 ,  A01H6/46 ,  A01H6/54 ,  A01H6/74 ,  A01H6/02

Abstract: 本申请涉及一种HPPD突变蛋白及其应用。本申请通过基因编辑技术，获得了至少三个优良的突变体，其表达不同的HPPD突变蛋白，能赋予植物除草剂抗性或耐受性。

公开(公告)号：CN118834871B

公开(公告)日：2025-04-08

申请号：CN202410870117.9

申请日：2024-07-01

Applicant: 中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)

Inventor： 刘伟 ,  王桂荣 ,  张杰 ,  王齐

IPC: C12N15/113 ,  C12N15/89 ,  C12N15/65 ,  C12N15/85 ,  A01K67/68 ,  G16B15/30 ,  G16B25/20 ,  G16B30/10 ,  G16B35/20 ,  G16B40/00

Abstract: 本发明公开了橘小实蝇基因组转基因安全位点及其筛选方法与应用。本发明开发得到了一种Actin基因启动子，并由此进一步构建了两种不同的橘小实蝇品系，并从中发现了可行的橘小实蝇基因组转基因安全插入位点，从而为橘小实蝇的品系开发和以基因编辑手段为核心的防治工作提供了重要的技术支持。