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公开(公告)号：CN113481303A
公开(公告)日：2021-10-08
申请号：CN202110892448.9
申请日：2021-08-04
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛ACTR3基因CNV标记辅助检测生长性状的方法及其应用。基于实时荧光定量PCR技术，以黄牛个体基因组DNA为模板，以一对特异性引物扩增ACTR3基因拷贝数变异区域的部分片段，以另外一对特异性引物扩增BTF3基因的部分片段作为内参，最后利用‑ΔΔCt判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法基于ACTR3基因拷贝数变异与生长性状之间的关联，可用于快速建立黄牛遗传资源优势种群，有利于加快牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN112813175A
公开(公告)日：2021-05-18
申请号：CN202110342428.4
申请日：2021-03-30
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 黄永震 , 丁晓婷 , 贺花 , 李欣淼 , 柴亚楠 , 刘贤 , 李克丽 , 杜雪儿 , 郑中华 , 乔小玉 , 郎利敏 , 张子敬 , 施巧婷 , 王二耀 , 茹宝瑞 , 胡沈荣 , 王建钦 , 雷初朝 , 陈宏
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种黄牛CHRDL1基因CNV标记快速辅助检测生长性状的方法及其应用：以牛血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR技术，用两对引物P1、P2分别对牛CHRDL1基因CNV区域、内参基因BTF3的一段区域进行扩增，根据2*2‑ΔΔCt确定个体CHRDL1基因的拷贝数变异类型为多拷贝型、缺失型或正常型。根据CHRDL1基因拷贝数变异与生长性状的关联分析结果，本发明可以在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于牛生长性状的标记辅助选择，加速良种选育进程。
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公开(公告)号：CN112359120A
公开(公告)日：2021-02-12
申请号：CN202011296046.4
申请日：2020-11-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛MFN1基因CNV标记的方法及其应用：以云岭牛的血样基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR分别扩增MFN1基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段，根据2*log22‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定云岭牛MFN1基因的拷贝数变异类型。与云岭牛生长数据的关联分析显示，MFN1基因不同拷贝数对个体生长发育有显著影响，其中缺失型个体的胸宽低于插入型个体。本发明在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可作为生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记，快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号：CN105506111B
公开(公告)日：2020-02-07
申请号：CN201511030253.4
申请日：2015-12-31
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测南阳牛MAPK10基因CNV标记的方法及其应用：以南阳牛的血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增南阳牛MAPK10基因CNV区域和内参基因BTF3，根据log22‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型，鉴定南阳牛MAPK10基因的拷贝数变异。与南阳牛生产数据的关联分析显示，MAPK10不同拷贝数对南阳牛的生长发育有显著影响，其中正常型个体的初生重、18月龄体高和24月龄体重和日增重均显著高于插入型和缺失型个体。本发明在DNA水平上检测与南阳牛生产性状密切相关的CNV标记，可作为中国南阳牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记。
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公开(公告)号：CN105349673B
公开(公告)日：2020-01-21
申请号：CN201510866870.1
申请日：2015-11-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛FLII基因SNP的RFLP方法及其应用：分别以黄牛基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛FLII基因内含子22区，用限制性内切酶Sac II消化PCR扩增产物，再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛FLII基因内含子22区单核苷酸多态性，并且该SNP位点与黄牛的生长发育性状显著相关，可作为DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记，并应用于黄牛肉用生长性状的标记辅助选择，以便快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110564829A
公开(公告)日：2019-12-13
申请号：CN201910943149.6
申请日：2019-09-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种奶牛NCAM2基因CNV标记辅助检测泌乳性状的方法及其专用试剂盒：利用实时定量PCR技术，以中国荷斯坦奶牛基因组DNA为模板，分别用两对引物P1、P2对牛NCAM2基因的CNV标记位点和内参基因BTF3的一段区域进行扩增，最后利用2*2-ΔΔCt的方法计算并判定个体的拷贝数变异类型，并将结果分为多拷贝型、缺失型和正常型。本发明可在DNA水平上检测与中国荷斯坦奶牛泌乳性状密切相关的CNV标记，可加快奶牛优良产乳性能的选育进程。该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN110079610A
公开(公告)日：2019-08-02
申请号：CN201910379625.6
申请日：2019-05-08
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊BAG4基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以茶卡羊血样全基因组DNA为模板，扩增茶卡羊BAG4基因的拷贝数变异区域，并以扩增的茶卡羊ANKDR1基因片段作为内参，利用2-ΔCt的方法计算个体的拷贝数，通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析，该拷贝数变异区域的不同基因型显著影响茶卡羊的生长性状，本发明在DNA水平上检测与茶卡羊生长性状密切相关的分子遗传标记，可用于茶卡羊生长性状的标记辅助选择，从而快速建立优良的茶卡羊种群，该方法具有简单、快速，便于推广应用的特点。
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公开(公告)号：CN109988847A
公开(公告)日：2019-07-09
申请号：CN201910308792.1
申请日：2019-04-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法及其应用：基于实时荧光定量PCR技术，以茶卡羊的血液全基因组DNA为模板，扩增茶卡羊SHE基因的拷贝数变异区域，并以扩增的茶卡羊ANKRD1基因片段作为内参，然后利用2*2‑ΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析，本发明提供的检测茶卡羊SHE基因CNV标记的方法为建立茶卡羊SHE基因拷贝数变异与体长性状之间的关联奠定了基础，可用于加快茶卡羊体长性状的选育进程，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN105349674B
公开(公告)日：2019-05-17
申请号：CN201510867756.0
申请日：2015-11-30
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6827 , C12Q1/686 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种与秦川牛生长相关的CNV标记的检测方法与应用：所述的CNV标记是指牛SHH基因候选区域Chr 4:118264951‑118267170的拷贝数变异，该检测方法是以秦川牛的基因组DNA为模板，以引物对P1和P2为引物，通过实时荧光定量PCR分别扩增秦川牛SHH基因CNV区域和内参基因BTF3，根据log22‑ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定秦川牛SHH基因的拷贝数变异。本发明可在DNA水平上检测与秦川牛生产性状密切相关的CNV标记，可作为秦川牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记。
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公开(公告)号：CN109371145A
公开(公告)日：2019-02-22
申请号：CN201811565430.2
申请日：2018-12-20
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种黄牛SPARC基因单核苷酸多态性标记的检测方法及其应用，根据黄牛SPARC基因SNP位点(g.12545 C>T)为C或T的碱基多态性，以待测黄牛基因组DNA为模板，以突变受阻扩增引物PCR扩增黄牛SPARC基因部分片段；扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定黄牛SPARC基因的基因型；本发明可以在DNA水平上检测与黄牛生长性状关联的分子标记，以加快黄牛的早期选育，培育出生长性状优良的黄牛种群。
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