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公开(公告)号：CN119753174A
公开(公告)日：2025-04-04
申请号：CN202510184933.9
申请日：2025-02-19
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测与牛热应激适应性相关的分子标记的方法，对北方黄牛和南方黄牛样本经三代测序的方法所得基因组序列进行比对、结构变异检测及生物学功能验证，并对其中位于牛参考基因组上PADI3基因区域2:135317354‑135317410、长度57 bp的缺失突变在牛群体中的携带情况与个体间热应激适应性的差异通过关联分析进行了考察，最终揭示了该结构变异区域能够为牛热应激耐受群体选育和改良提供在DNA水平上实现有效检测的候选分子标记。
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公开(公告)号：CN111172295A
公开(公告)日：2020-05-19
申请号：CN202010117701.9
申请日：2020-02-25
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛VAMP7基因CNV标记的方法及专用试剂盒：以黄牛的血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增黄牛VAMP7基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段，根据2*2-ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定黄牛VAMP7基因的拷贝数变异类型。与云岭牛、夏南牛、皮南牛和郏县红牛生产数据的关联分析显示，正常型个体的十字部高显著高于插入型和正常型个体。本发明通过在DNA水平上检测与云岭牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN119776501A
公开(公告)日：2025-04-08
申请号：CN202510118468.9
申请日：2025-01-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种利用ASIP基因8403bp序列鉴定牛红毛色表型的方法。对不同毛色表型家牛样本基因组三代测序数据进行分析，首次鉴定出与红毛色表型显著相关的ASIP基因8403bp结构变异序列，该序列与一个LINE‑1转座子重叠，并导致ASIP基因转录本产生不同的mRNA亚型。本发明通过采用两对引物可以实现对牛ASIP基因的检测，并能准确进行基因分型，从而可以在DNA水平上对牛红色毛色性状进行标记辅助选择。
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公开(公告)号：CN110760597B
公开(公告)日：2022-08-23
申请号：CN201911159100.8
申请日：2019-11-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛NCSTN基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以云岭牛基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增牛NCSTN基因的拷贝数变异区域部分片段，同时利用另外一对特异性PCR引物扩增牛BTF3基因部分片段作为内参对照，最后利用‑ΔΔCt计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法为建立云岭牛NCSTN基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN111172295B
公开(公告)日：2022-07-05
申请号：CN202010117701.9
申请日：2020-02-25
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛VAMP7基因CNV标记的方法及专用试剂盒：以黄牛的血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增黄牛VAMP7基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段，根据2*2‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定黄牛VAMP7基因的拷贝数变异类型。与云岭牛、夏南牛、皮南牛和郏县红牛生产数据的关联分析显示，正常型个体的十字部高显著高于插入型和正常型个体。本发明通过在DNA水平上检测与云岭牛生长性状密切相关的CNV标记，可用于快速建立云岭牛等地方黄牛品种的遗传资源优势种群，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN112359120A
公开(公告)日：2021-02-12
申请号：CN202011296046.4
申请日：2020-11-18
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛MFN1基因CNV标记的方法及其应用：以云岭牛的血样基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR分别扩增MFN1基因CNV区域和参考基因BTF3的部分片段，根据2*log22‑ΔΔCt将定量结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定云岭牛MFN1基因的拷贝数变异类型。与云岭牛生长数据的关联分析显示，MFN1基因不同拷贝数对个体生长发育有显著影响，其中缺失型个体的胸宽低于插入型个体。本发明在DNA水平上检测与牛生长性状密切相关的CNV标记，可作为生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记，快速建立遗传资源优良的肉牛种群。
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公开(公告)号：CN119899891A
公开(公告)日：2025-04-29
申请号：CN202510219707.X
申请日：2025-02-26
Applicant: 西北农林科技大学
Inventor： 陈宁博 , 夏小婷 , 阎卉萱 , 陈文洁 , 雍振平 , 孙芳 , 雷初朝 , 高元鹏 , 黄必志 , 张继才 , 马伟东 , 成海建 , 李俊雅 , 黄永震 , 江晓军 , 库尔图兰·哈尼夫 , 沙希德·曼苏尔
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明公开了一种利用牛6号染色体拷贝数变异鉴定斑点瘤牛品种的方法。对选择的具有不同斑点毛色性状的瘤牛品种分别进行基因组候选区域拷贝数变异分析；根据所发现的定位于牛6号染色体上基因组区域6:70230801‑70291600的拷贝数变异区段，对个体的拷贝数变异类型进行鉴别，实现在DNA水平上对斑点瘤牛与纯色瘤牛品种的低成本、准确鉴定，从而提高遗传育种的效率。
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公开(公告)号：CN111394474B
公开(公告)日：2022-08-16
申请号：CN202010213959.9
申请日：2020-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛GAL3ST1基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以黄牛(例如，秦川牛)基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增黄牛GAL3ST1基因的拷贝数变异区域的部分片段，利用另外一对特异性PCR引物扩增黄牛通用转录因子3基因部分片段作为内参，最后利用2*2‑ΔΔCt的方法对定量结果进行计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在秦川牛GAL3ST1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN111394474A
公开(公告)日：2020-07-10
申请号：CN202010213959.9
申请日：2020-03-24
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛GAL3ST1基因拷贝数变异的方法及其应用：基于实时定量PCR，以黄牛(例如，秦川牛)基因组DNA为模板，利用一对特异性PCR引物扩增黄牛GAL3ST1基因的拷贝数变异区域的部分片段，利用另外一对特异性PCR引物扩增黄牛通用转录因子3基因部分片段作为内参，最后利用2*2-ΔΔCt的方法对定量结果进行计算并判定个体的拷贝数变异类型。本发明提供的方法建立在秦川牛GAL3ST1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联基础之上，有利于加快黄牛分子标记辅助选择育种工作，该方法简单、快速，便于推广应用。
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公开(公告)号：CN118222725A
公开(公告)日：2024-06-21
申请号：CN202410485796.8
申请日：2024-04-22
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种单核苷酸遗传标记在选育高海拔适应性黄牛中的应用。利用全基因组渗入分析方法，对藏牛的全基因组SNP进行分析，发现藏牛EGLN1基因启动子上的三个单核苷酸变异可能与藏牛高海拔适应性相关，并从中发现了作为高海拔适应性黄牛选育的分子标记，可以用于快速建立高海拔适应性牛群体，为培育适应高原环境的牛品种提供了依据。
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