一种基于显微图像的角毛藻和非角毛藻自动分类方法

    公开(公告)号:CN102663406A

    公开(公告)日:2012-09-12

    申请号:CN201210105858.5

    申请日:2012-04-12

    Abstract: 本发明提供一种基于显微图像的角毛藻和非角毛藻自动分类方法,其中,包括以下步骤:(1)从藻类的显微图像中提取出藻类目标细胞二值化图像;(2)将二值化图像的高度即行数固定为300像素,列数则按原比例进行缩放;(3)采用半径为5像素宽度的圆形结构元素对图像进行闭运算(4)骨架提取:对二值图像采用距离变换细化算法进行骨架提取;(5)提取骨架的节点数和端点数:提取骨架的节点集合和端点集合,从而获取节点和端点的数量;(6)类判决:根据是否满足(节点数>5且端点数>5)条件作为是否为角毛藻的判据。本发明自动分类方法准确率高,显像清晰,为进一步的藻种分类识别打下基础。提高进一步藻种自动分类的识别率;也可以为广大第一线藻类监测人员、藻种研究者提供有效地指导和帮助,经济和社会效益都将十分显著。

    DGGE技术在检测浮游植物群落结构中的使用方法

    公开(公告)号:CN101892310A

    公开(公告)日:2010-11-24

    申请号:CN201010184810.9

    申请日:2010-05-28

    Abstract: 本发明公开了一种DGGE技术在检测浮游植物群落结构中的使用方法,其中,包括以下步骤:将浮游植物水样首先用200目的筛绢过滤,然后将过滤后的海水用0.45μm孔径的硝酸纤维素膜过滤,将滤膜转移至2mlEppendorf管中,置于-20℃,用于浮游植物群落多样性的分析;收集和洗涤藻细胞进行DNA的提取,进行PCR及琼脂糖电泳检测,使用DGGE进行浮游植物群落结构分析,最后进行图形处理和数据分析。本发明可精确检测浮游植物群落的结构组成,有利于浮游植物赤潮的爆发预警。

    一种赤潮藻种快速鉴定的方法

    公开(公告)号:CN101824481A

    公开(公告)日:2010-09-08

    申请号:CN201010184806.2

    申请日:2010-05-28

    Abstract: 本发明公开了一种赤潮藻种快速鉴定的方法,其特征在于,包括以下步骤:a、实验藻种f/2及其衍生培养基的配制,b、引物设计与验证,c、实验藻种18S rDNA片段的获得,d、PCR优化及扩增,e、模拟酶切和实际酶切对照实验,f、RFLP区分鉴别赤潮藻种。本发明作为一种用于鉴定的赤潮藻种的分子生态学手段,可以作为传统鉴定方法的补充和辅助手段。本发明,基于FELP建立特征性图谱,将整个流程标准化,将有利于对赤潮藻种进行快速简捷的初步鉴定,有利于浮游植物赤潮的爆发预警。

    一种定量检测塔玛亚历山大藻的方法

    公开(公告)号:CN100595585C

    公开(公告)日:2010-03-24

    申请号:CN200410067109.3

    申请日:2004-10-13

    Abstract: 公开了一种检测待测样品中塔玛亚力山大藻数量的免疫学方法,包括步骤:(a)使固定有塔玛亚力山大藻细胞裂解碎片的固相载体同时与待测样品以及抗塔玛亚力山大藻抗体接触;(b)将固相载体与待测样品和抗塔玛亚力山大藻抗体分开;(c)检测与固相载体结合的抗塔玛亚力山大藻抗体的量,所述固定在固相载体上的塔玛亚力山大藻细胞裂解碎片与待测样品中的塔玛亚力山大藻细胞竞争结合抗塔玛亚力山大藻抗体,而且存在于所述待测样品中的塔玛亚力山大藻细胞数目是根据抗塔玛亚力山大藻抗体与固定在固相载体上的塔玛亚力山大藻细胞裂解碎片结合或不结合的相对程度测定的。还公开了用于该检测方法的试剂盒及其用途。

    中肋骨条藻细胞色素b基因的RFQ-PCR检测方法

    公开(公告)号:CN101130821A

    公开(公告)日:2008-02-27

    申请号:CN200710121498.7

    申请日:2007-09-07

    Abstract: 本发明公开了一种中肋骨条藻细胞色素b基因的RFQ-PCR检测方法,包括:a.提取作为标准样品的中肋骨条藻RNA;b.分离并克隆中肋骨条藻细胞色素b基因,得到700~740bp的中肋骨条藻细胞色素b基因序列,并从GenBank上获取分类地位与中肋骨条藻相近的多个藻种的细胞色素b序列,构建系统树;c.进行RFQ-PCR;d.根据获得的700~740bp的中肋骨条藻细胞色素b基因序列构建标准曲线,通过标准曲线检测待测中肋骨条藻细胞色素b基因。本发明检测方法,可以用于中肋骨条藻的定量、或作为中肋骨条藻检测中的管家基因研究浮游藻种群变迁、构建生态动力学模型乃至赤潮预测等领域。

    一种全自动微藻分析仪
    36.
    发明公开

    公开(公告)号:CN1793920A

    公开(公告)日:2006-06-28

    申请号:CN200510045194.8

    申请日:2005-11-18

    Abstract: 本发明涉及海洋浮游植物检测的技术领域,是一种基于双特异分子探针分析方法的全自动生化分析仪,包括采样预处理模块,裂解破碎模块,探针液槽模块,升降盘模块,恒温模块,单、多吸液头模块,定量移液和加液模块,恒温震荡模块,洗板模块,酶标模块,三维机械手,气、液控制系统,电器控制系统等装置。本发明的优点是可以全自动的流程,实现近海水域的表、中、深三层水样的藻类检测与分析,可以并行测定多达20个水样,一个水样中可测定多种优势藻类的含量,克服了传统方法人力、物力上的浪费,减小了由于复杂的手工操作带来的人为误差,提高了检测的速度和精度。本发明不仅能船装载使用,也可置于岸上使用。

    赤潮异湾藻半定量检测试纸条及其制备使用方法

    公开(公告)号:CN1786714A

    公开(公告)日:2006-06-14

    申请号:CN200510109493.3

    申请日:2005-10-24

    Abstract: 本发明描述了一种基于胶体金免疫层析分析技术(gold immuno chromato graphy assay,GICA)的半定量检测赤潮异湾藻试纸条。包括塑料载体板、硝酸纤维素膜和玻璃纤维素膜。检测试纸条硝酸纤维层、玻璃纤维层分别用胶固定在塑料载体板上;检测试纸条硝酸纤维膜上设有赤潮异湾藻抗原分级标记线、质控线;吸水玻璃纤维素膜层置于硝酸纤维膜检测层右端上方;该载体中部设有硝酸纤维膜检测层,在该检测层与加样端吸水层交界处,设有载有胶体金标记的兔抗赤潮异湾藻抗体的玻璃纤维素膜抗体标记层。本发明为常规环境监测、渔业养殖水体检测、以及赤潮生效过程监测的现场实验,提供快速简便的对赤潮多发藻进行半定量的检测方法。

    圆海链藻的检测探针及检测方法

    公开(公告)号:CN1786196A

    公开(公告)日:2006-06-14

    申请号:CN200510104328.9

    申请日:2005-10-24

    Abstract: 本发明属于利用分子生物学方法检测环境微生物的技术领域。本发明公开了以圆海链藻核糖体DNA(rDNA)核苷酸序列为基础设计的寡核苷酸探针,以该核酸分子探针为一对引物进行PCR反应,通过判断相应大小PCR产物的有无可以准确、快速地检测圆海链藻。本发明还公开了用这些探针采用荧光定量PCR技术来快速、准确地检测和定量计数圆海链藻的方法。

    赤潮异弯藻的检测探针
    39.
    发明公开

    公开(公告)号:CN1635154A

    公开(公告)日:2005-07-06

    申请号:CN200410067807.3

    申请日:2004-11-04

    Abstract: 一种赤潮异弯藻的检测探针,属于核酸检测领域。用于对该藻进行S1酶保护分析和夹心杂交检测,具体包括三条相互关联的寡核苷酸探针:S1酶保护分析探针,在进行生物信息学比对分析时,仅与赤潮异弯藻核糖体小亚基150~300区域核苷酸互补,而与其它藻核糖体RNA无同源性,长度为59bp,在一定的条件下可特异性结合于赤潮异弯藻的rRNA上,序列为:5’-GGCAGAAACTTGAATGAACCATCGACCGAAGTCGATTCGCACAGTTACTATGATTCACC。本发明探针适用性好,大大方便了特异探针的寻找和实现。本发明的稳定性远远高于夹心杂交技术。

    微型原甲藻的检测探针
    40.
    发明公开

    公开(公告)号:CN1635152A

    公开(公告)日:2005-07-06

    申请号:CN200410067805.4

    申请日:2004-11-04

    Abstract: 一种微型原甲藻的检测探针,属于核酸检测领域。用于对该藻进行S1酶保护分析和夹心杂交检测,具体包括三条相互关联的寡核苷酸探针:S1酶保护分析探针,在进行生物信息学比对分析时,仅与微型原甲藻核糖体大亚基430~520区域核苷酸互补,而与其它藻核糖体RNA无同源性,长度为58bp,在一定的条件下可特异性结合于微型原甲藻的rRNA上,序列为:5’-ACAGTCCGCAAATGAGTTCTGCCAA GGCTATTCACTCACCCGTAGACGAGCTACCATGA。本发明探针适用性好,大大方便了特异探针的寻找和实现。本发明的稳定性远远高于夹心杂交技术。

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