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公开(公告)号：CN113817707A
公开(公告)日：2021-12-21
申请号：CN202111394888.8
申请日：2021-11-23
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州优思达生物技术有限公司
Abstract: 本发明公开了一种突变重组逆转录酶及其制备方法和应用，具体突变位点为：将野生型逆转录酶M‑MLV的第67位氨基酸从S突变为T，第303位氨基酸从F突变为R，第312位氨基酸从L突变为S，第432位氨基酸从L突变为G，第479位氨基酸从N突变为F，第524位氨基酸从D突变为Q。该酶是通过人工合成表达载体，利用优选的宿主细胞，经IPTG诱导表达获得。经改造后的一种重组突变型逆转录酶的活性温度为37‑65℃，逆转录效率是野生型逆转录酶的41.9倍，对常见干扰物的耐受能力明显提高。其性能明显优于野生型M‑MLV，并在与市场化M‑MLV的性能比较中显示出优势。
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公开(公告)号：CN113151598A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110423087.3
申请日：2021-04-20
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种呼吸道RNA病原体(甲流、乙流、合胞病毒、新冠)NGS引物组及试剂盒，所述引物组由594条引物序列组成。本发明针对甲流、乙流、合胞病毒和新型冠状病毒基因组特定设计了594个引物，覆盖整个病毒基因组，提高了病毒的检测并大大提高了病毒基因组序列全长检测的可能，无需PCR扩增即可快速实现病毒基因组全覆盖。
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公开(公告)号：CN113151557A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110457838.3
申请日：2021-04-27
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 北京博奥晶典生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明“用于检测荚膜组织胞浆菌的LAMP引物组、试剂盒及方法”属于生物技术领域。用于检测荚膜组织胞浆菌的LAMP引物组包括如下引物：外引物Hca‑F3：5’‑CGATTTTGCTGCTCTGGATC‑3’，外引物Hca‑B3：5’‑CCAATTCAGCAGCATGGTTG‑3’；内引物Hca‑FIP：5’‑ACGTTTTGCTGGCCCAACTCAGAAAGGCGTTGGTACCGA‑3’，内引物Hca‑BIP：5’‑TGGTTATGCGATGGAATTCGCGTCTCTGGTTGCTTCTTCGG‑3’；环引物Hca‑LF：5’‑GCCAGGGGATCTAAAGAG‑3’，环引物Hca‑LB：5’‑CGAGTACCACAATCTATACC‑3’。本发明的引物组、试剂盒和方法能够准确、快速、有效鉴定荚膜组织胞浆菌。
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公开(公告)号：CN112538542A
公开(公告)日：2021-03-23
申请号：CN202011356499.1
申请日：2020-11-26
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本公开涉及一种用于龟分枝杆菌检测的试剂盒及系统，该试剂盒包括用于检测分子标志物的试剂，其中，所述分子标志物包括yjcH基因、mpr基因、rrl C2638T位点和rrl G2654A位点中的至少一种。通过识别上述分子标志物，本公开能够实现龟分枝杆菌的精确检测。
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公开(公告)号：CN112538539A
公开(公告)日：2021-03-23
申请号：CN202011349925.9
申请日：2020-11-26
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本公开涉及一种用于鸟分枝杆菌检测的试剂盒及系统，该试剂盒包括用于检测分子标志物的试剂，其中，所述分子标志物包括nikA基因、ddpC基因、yejF基因、rrl G2368T位点、rrl T3066A位点、acpM C177T位点中的至少一种。通过识别上述分子标志物，本公开能够实现鸟分枝杆菌的精确检测。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118212987B
公开(公告)日：2024-08-20
申请号：CN202410628294.6
申请日：2024-05-21
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
Abstract: 本发明提供了一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备，涉及基因技术领域，该方法包括：获取待测样本的测序数据；对测序数据进行预处理，获得目标测序数据；将目标测序数据与物种数据库进行比对，获得目标物种序列数据集，对目标物种序列数据集进行序列组装，获得组装结果；对组装结果进行基因预测，获得基因预测结果；对各个基因预测结果进行去冗余处理，得到各个非冗余基因序列；将每个非冗余基因序列与耐药基因数据库进行比对，获得每个非冗余基因序列对应的注释结果；基于每个非冗余基因序列对应的注释结果在各个非冗余基因序列中确定出耐药基因序列。应用本发明实施例提供的方法，能够准确地确定出耐药基因序列。
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公开(公告)号：CN115798576B
公开(公告)日：2023-06-02
申请号：CN202310065262.5
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对亚胺培南敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为bleomycin resistance determinant、ramA、mphA、KPC‑1、catI基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对亚胺培南敏感性的预测的准确率约99.4%。
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公开(公告)号：CN116042600A
公开(公告)日：2023-05-02
申请号：CN202211012812.9
申请日：2022-08-23
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明涉及生物技术领域，尤其涉及核酸提取试剂、试剂盒及其应用，以及核酸提取方法。本发明提供了核酸提取试剂，包括：抗凝剂、CSB、LMP、红细胞裂解液、白细胞裂解液、溶菌酶、蛋白酶K、RNase、溶胶酶和透析缓冲液。本发明提供了一种针对血流感染病原菌的长短片段共提取试剂或试剂盒，该试剂或试剂盒的效果可以达到：短至100bp左右的cfDNA，直到长至大于2Mb的病原菌gDNA在同一提取管中共同提取，实现了长度跨度极大的长短片段共同提取，比现有只能分相提取的方案节省一半的时间及样本量，且因操作简便而可减少污染的可能。
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公开(公告)号：CN115798577B
公开(公告)日：2023-04-21
申请号：CN202310065354.3
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对左氧氟沙星敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；所述计算机程序被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；所述Exp(‑k)幂值计算方法按下述计算步骤计算：S1：按下述公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为TEM‑1、OmpA、AAC(6')‑Ib‑cr6、KPC‑1、QnrS1基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对左氧氟沙星敏感性的预测的准确率约89.5%。
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公开(公告)号：CN115881213A
公开(公告)日：2023-03-31
申请号：CN202310065171.1
申请日：2023-02-06
Applicant: 中国医学科学院北京协和医院 , 杭州杰毅生物技术有限公司
Abstract: 本发明一种预测克雷伯氏菌属对哌拉西林‑他唑巴坦敏感性的系统及方法属于生物信息技术领域。所述系统包括计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序；其被处理器执行时实现一种Exp(‑k)幂值计算方法；按下述计算步骤计算：S1：按公式I计算k值：公式I：；S2：求取以自然常数e为底数、以‑k为指数的Exp(‑k)幂值；其中，C1‑C5分别为dfrA12、KPC‑1、determinant of bleomycin resistance、mphA、sul2基因分别在待预测的克雷伯氏菌属菌株中的拷贝数。采用本发明的预测方法和预测系统进行克雷伯氏菌属对哌拉西林‑他唑巴坦敏感性的预测的准确率约98.3%。
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