跨断点进行染色体微缺失分析的方法、装置、设备及存储介质

    公开(公告)号:CN114220482B

    公开(公告)日:2024-11-15

    申请号:CN202111461943.0

    申请日:2021-12-02

    Abstract: 本发明涉及一种跨断点进行染色体微缺失分析的方法、装置、设备及存储介质。上述染色体微缺失分析的方法和装置,对父方和母方的基因测序结果进行分析,获得染色体缺失信息,根据该缺失信息分析断点位置,将参考胚胎样本测序信息与该缺失信息进行比对,选取携带型胚胎。根据父方、母方和携带型胚胎在断点位置的上游和下游预设范围内的含有多个SNP位点的区域,进行家系连锁分析,确定正常单体型,再将待测胚胎与之比对,则能准确选取出正常胚胎。该染色体微缺失的分析方法能够精确分析出染色体断点,在此基础上结合断点上游和下游的SNP位点能够准确判断胚胎的染色体缺失情况,该分析方法操作简便,结果判断准确。

    一种构建CNV检测文库的方法及CNV检测方法

    公开(公告)号:CN114457143B

    公开(公告)日:2024-07-09

    申请号:CN202210258037.9

    申请日:2022-03-16

    Abstract: 本发明公开了一种构建CNV检测文库的方法及CNV检测方法。所述方法包括:采用双核酸内切酶组合对样本基因组DNA进行切割得到酶切产物,将所述酶切产物与测序接头连接,得到连接产物;对所述连接产物进行PCR扩增,得到测序文库,所述双核酸内切酶组合包括MboI、MseI、BfaI或ApoI‑HF中任意2种的组合。本发明的文库构建方法,能够用较少的数据量(测序成本)对全基因组部分代表性区域进行高深度测序,获得高密度和覆盖均一的足量能进行CNV分析的SNP位点。通过CNV组合分析策略实现同时对多种CNV变异类型的检测,包括染色体非整倍体、重复缺失、单倍体、三倍体、多倍体、LOH、UPD等。

    检测α-珠蛋白基因型的方法和装置

    公开(公告)号:CN117976059B

    公开(公告)日:2024-06-21

    申请号:CN202410392065.9

    申请日:2024-04-02

    Abstract: 本申请涉及一种检测α‑珠蛋白基因型的方法和装置,方法包括:获取检测样本集中各样本的测序数据和参考基因组的比对数据;根据第一目标检测样本集的比对数据确定第一目标检测样本集中各检测样本的α‑珠蛋白基因各特征区域的拷贝数,根据第一目标检测样本集中各检测样本的α‑珠蛋白基因各特征区域的拷贝数确定待分析样本的α‑珠蛋白第一预测基因型;根据第二目标检测样本集的比对数据确定待分析样本α‑珠蛋白基因的融合断点,根据待分析样本α‑珠蛋白基因的融合断点和待分析样本的α‑珠蛋白第一预测基因型确定待分析样本的α‑珠蛋白第二预测基因型。本申请借助于融合断点的检测,可更精确的解读α‑珠蛋白的基因型。

    一种一体化文库构建的方法及其应用

    公开(公告)号:CN117683853A

    公开(公告)日:2024-03-12

    申请号:CN202311681283.6

    申请日:2023-12-08

    Abstract: 本发明公开了一种一体化文库构建的方法及其应用。所述方法包括:使用第一核酸内切酶和第二核酸内切酶对基因组DNA进行酶切得到酶切产物,将酶切产物与测序接头连接,得到连接产物,将筛选后的连接产物与多重PCR扩增得到的扩增子库混合,使用引物进行文库PCR反应,即得所述一体化核酸文库;所述第一核酸内切酶包括BfaI;所述第二核酸内切酶包括MboI;所述多重PCR扩增子库由一端含有BfaI酶切位点识别序列,另一端含有MboI酶切位点识别序列的DNA片段组成。本发明方法实现了在均匀覆盖全基因组CNV和SNP的同时,对漏检遗传病区域进行针对性的捕获富集,提供了一种更完善和准确的一体化高通量测序检测方法。

    一种基于二代测序数据对HLA-DRB基因进行分型的方法及应用

    公开(公告)号:CN117542412A

    公开(公告)日:2024-02-09

    申请号:CN202311495522.9

    申请日:2023-11-10

    Abstract: 本发明公开了一种基于二代测序数据对HLA‑DRB基因进行分型的方法及应用。所述方法包括:测序数据质控,初步分型和校正分型;所述数据质控包括测序reads统计和目标区域统计;所述初步分型包括构建参考基因组,reads比对和权重打分,HLA‑DRB基因拷贝数评估,单个等位基因的筛选和等位基因对的筛选;所述校正分型包括组装consensus序列,序列比对,校正分型结果和提示变异;所述HLA‑DRB基因包括HLA‑DRB3基因、HLA‑DRB4基因和HLA‑DRB5基因中的任意一种或至少两种的组合。本发明能够准确判断包括DRB3/4/5在内的15个基因的拷贝数,与已知分型结果100%一致,再结合等位基因对的打分和筛选规则,DRB3/4/5六位分型结果的准确率分别从85%,98%,96%提升至100%。

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