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公开(公告)号：CN117912562A
公开(公告)日：2024-04-19
申请号：CN202311872916.1
申请日：2023-12-29
Applicant: 南京大学人工智能生物医药技术研究院 , 南京碳硅人工智能生物医药技术研究院有限公司
Abstract: 本发明涉及生物信息技术领域，公开了一种酶基因簇预测方法、装置、计算机设备及存储介质，该方法包括：获取DNA文件，识别DNA文件中的开放阅读框；从开放阅读框中提取目标酶及预设位置的碱基信息；按照预设基序和判定阈值基于碱基信息识别前体肽基因序列；对目标酶进行序列相似性网络分析，基于分析得到的相似度对目标酶进行聚类；基于聚类结果得到目标酶的家族分布结果。通过实施本发明，结合前体肽基因预测可以快速高效的实现目标酶基因周边潜在短肽基因的预测，解决由于很多核心修饰基因并不具有相似性，使得软件工具无法识别核心修饰基因，从而影响前体肽基因识别预测结果的问题。
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公开(公告)号：CN117756597A
公开(公告)日：2024-03-26
申请号：CN202311608816.8
申请日：2023-11-28
Applicant: 南京大学人工智能生物医药技术研究院 , 南京碳硅人工智能生物医药技术研究院有限公司
IPC: C07C13/72 , C12N15/81 , C12N1/19 , C12N15/53 , C12N15/54 , C12N15/60 , C12N15/61 , C12P5/00 , C07C13/54 , C12R1/865
Abstract: 本发明属于基因工程及生物合成技术领域，具体涉及一种细菌及真菌螺环二萜骨架，并进一步公开了可用于高效合成所述二萜骨架的酿酒酵母平台，以及基于所述酿酒酵母平台生物合成所述二萜骨架的方法及应用。本发明所述高效合成所述螺环二萜骨架的酿酒酵母平台，通过表达酿酒酵盘MVA途径中的限速酶IDI和tHMG，同时加入GGPP合成酶SdnC，形成新的高产二萜骨架的酿酒酵母底盘，然后将细菌和真菌的萜合成酶基因转入酿酒酵母底盘，筛选新型细菌和真菌二萜骨架，并通过投喂13C标记的醋酸钠探究新型细菌和真菌二萜骨架的合成机制，可以实现利用酿酒酵母平台生产细菌和真菌中二萜骨架产物。
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公开(公告)号：CN117736249A
公开(公告)日：2024-03-22
申请号：CN202311602431.0
申请日：2023-11-27
Applicant: 南京大学人工智能生物医药技术研究院 , 南京碳硅人工智能生物医药技术研究院有限公司
Abstract: 本发明属于天然药物技术领域，具体涉及一种咔唑生物碱，并进一步公开其制备方法和应用。本发明首次从放线菌Saccharopolyspora phattalungensis DSM 45584菌株的液体发酵产物中，发现了一种咔唑生物碱carbazomycin I和carbazomycin J，通过生物信息学等手段鉴定了其生物合成基因簇cabz，并鉴定了其生物合成过程，该发现可为新型抗生素的合成生物学创制提供一种范例，作为新型抗生素的先导药物。
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公开(公告)号：CN104055762B
公开(公告)日：2017-03-08
申请号：CN201410032146.4
申请日：2014-01-23
Applicant: 南京大学医学院附属鼓楼医院
IPC: A61K31/343 , A61P9/10 , A61P29/00
Abstract: 本发明涉及马里巴特酚A作为制备治疗缺血性脑损伤药物的应用。本发明将马里巴特酚A制备注射制剂，所述马里巴特酚A的分子式C28H2007，分子量468KD。本发明克服了现有溶栓药物、抗血小板聚集、脱水降颅压药物、营养神经药物在治疗缺血性脑损伤疾病时各自存在的缺陷。本发明是一种小分子化合物，注射用药，可透过血脑屏障，作用于缺血性脑损伤的病理过程，符合当今研制治疗缺血性脑损伤药物的决策，即首先改善缺血后脑功能，其次，促进小胶质细胞向替代型分化从而减轻缺血后炎症反应，通过作用于PPARγ调控小胶质细胞分化。
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公开(公告)号：CN1155621C
公开(公告)日：2004-06-30
申请号：CN02148422.8
申请日：2002-12-03
Applicant: 南京大学
IPC: C08B37/00
Abstract: 一种芦荟多糖的提取精制方法，其特征是包括以下步骤：将芦荟鲜叶切成小块状，在40～80℃用水提取，滤取提取液；将提取液离心，取上清液，在上清液中加入95%乙醇，使得溶液中乙醇含量达到50-80%，沉淀出粗芦荟多糖；将粗芦荟多糖溶于水，加入20～50%三氯乙酸或三氟乙酸，使得三氯乙酸或三氟乙酸的最终浓度达到2-6%，静置后离心去除沉淀得二次上清液；将二次上清液上大孔树脂柱床，并用水洗脱至流出液无色透明；合并流出液，并浓缩，加入95%乙醇，使溶液中乙醇含量达到55-85%，沉淀出多糖，冷冻干燥，即得精制的芦荟多糖。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN119708096A
公开(公告)日：2025-03-28
申请号：CN202411522822.6
申请日：2024-10-29
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种二型聚酮化合物及其制备方法。通过过表达放线菌Amycolatopsis xylanica KCTC 19581中沉默基因簇xyl中的链霉菌抗生素调控因子(SARP)，实现了Xylanmycin的发现和分离鉴定，其分子式为C31H36O15，化学结构如式(I)所示：#imgabs0#本发明发现并鉴定了一种新型二型聚酮化合物xylanmycin，这一化合物具有独特的化学结构，分子式为C31H36O15，为医药领域提供了一种新的活性物质。
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公开(公告)号：CN118852341A
公开(公告)日：2024-10-29
申请号：CN202410914131.4
申请日：2024-07-09
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种具有吡嗪酮环的环二肽化合物及其制备方法和应用，所述具有吡嗪酮环的环二肽化合物的结构式如式(I)所示：#imgabs0#本发明从中国普通微生物菌种保藏管理中心(China General Microbiological Culture Collection Center,CGMCC)保藏编号为CGMCC 4.1901的链霉菌Streptomyces thermolineatus的液体发酵产物中分离纯化得到一类具有吡嗪酮环的环二肽化合物。
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公开(公告)号：CN117903265B
公开(公告)日：2024-10-01
申请号：CN202311018682.4
申请日：2023-08-13
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种大环肽类化合物acalitide及其制备方法和应用。本发明所述的一种大环肽类化合物acalitide的化学结构式如式(I)所示：#imgabs0#生物学活性数据结果表明，本发明的大环肽类化合物acalitide(Aca)能够修复多巴胺神经元的损伤其效果显著，可进一步开发作为治疗帕金森等神经损伤类疾病的先导药物。
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公开(公告)号：CN117903265A
公开(公告)日：2024-04-19
申请号：CN202311018682.4
申请日：2023-08-13
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种大环肽类化合物acalitide及其制备方法和应用。本发明所述的一种大环肽类化合物acalitide的化学结构式如式(I)所示：#imgabs0#生物学活性数据结果表明，本发明的大环肽类化合物acalitide(Aca)能够修复多巴胺神经元的损伤其效果显著，可进一步开发作为治疗帕金森等神经损伤类疾病的先导药物。
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公开(公告)号：CN114591286A
公开(公告)日：2022-06-07
申请号：CN202110388794.3
申请日：2021-04-12
Applicant: 南京大学
IPC: C07D321/00 , A61P25/16 , A61P25/00 , C12P17/08 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了新型大环内酯化合物acautalides A‑C及其制备方法和应用。三者都是真菌Acaulium sp.H‑JQSF(CCTCC No：M2021342H‑JQSF)合成的，其化学结构如式(I)所示：生物学活性测试表明，这些新型大环内酯能修复多巴胺神经元的损伤，其中acautalides A和B效果更为显著，可作为研发新药的先导化合物，用于帕金森等神经损伤类疾病的治疗。
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