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公开(公告)号：CN118366547A
公开(公告)日：2024-07-19
申请号：CN202410791117.X
申请日：2024-06-19
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司
Abstract: 本发明涉及一种基因标志物在多癌种早筛中的应用、早筛模型构建方法以及检测装置。本发明对血浆样本cfDNA进行WGS低深度测序，使用高通量测序结果分析各癌种cfDNA片段六种差异特征，包括基因组范围片段长度覆盖分布，染色体各长短臂上片段长度分布，1MB窗口片段拷贝数变化，核小体覆盖模式,片段甲基化模式和突变频谱，利用卷积神经网络进行训练建模，实现在低测序深度下对多个癌肿的高特异性高敏感性的精准早期检测，再利用广义线性模型，梯度提升，随机森林，深度学习，和极端梯度提升五种算法分别进行训练建模，广义线性模型进行二次集合训练构建多特征算法整合，实现对多癌种的组织溯源检测的目的。
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公开(公告)号：CN117265116A
公开(公告)日：2023-12-22
申请号：CN202311339578.5
申请日：2023-10-16
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医学检验有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6813 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种TFE3融合基因的检测方法、试剂盒以及探针库，属于基因检测技术领域。本发明开发了基于杂交捕获特定TFE3融合基因序列的方法，采用该方法可以获得成几千倍富集的TFE3融合基因DNA片段，富集后的TFE3融合基因片段样本可以选择性地应用于各种基因检测技术，特别是可以应用下一代测序技术进行基因突变检测，以取得高效且准确的结果。
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公开(公告)号：CN112779338B
公开(公告)日：2023-05-26
申请号：CN202110235630.7
申请日：2021-03-03
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医学检验有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6858
Abstract: 本发明涉及用于食管癌预后评估的基因标志物，属于医学分子生物学技术领域。本发明通过大量样本的筛选和分析，找到了一种用于食管癌预后评估的基因标志物，包括以下基因：YAP1、MYC、BAP1、BRIP1、WRN以及RB1；并且构建了可以用于对食管癌患者的总生存期（OS）进行评估的联合标志物，能够有效地对高危/低危的食管癌患者进行预测。
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公开(公告)号：CN110592212B
公开(公告)日：2023-05-26
申请号：CN201910751795.2
申请日：2019-08-15
Applicant: 吴一龙 , 南京世和基因生物技术股份有限公司
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 本发明涉及一种肺癌检测联合标志物方法及其用途，属于分子医学技术领域。肺癌检测联合标志物，包括如下所示的基因组合：RB1、NKX2‑1、CDK4、TP53、MYC。本发明具有以下优势：本发明能够将EGFR敏感突变阳性的可手术非小细胞肺癌术后辅助化疗或辅助靶向获益情况加以区分，使用严谨的统计学方法筛选出单个预测因子之后，采用多个基因标记物联用的评分模型来提高预测的敏感性与特异性，应用该评分可以用于指导早中期肺癌术后辅助治疗方案的选择。
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公开(公告)号：CN115678999A
公开(公告)日：2023-02-03
申请号：CN202211718841.7
申请日：2022-12-30
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B20/50 , G16B30/10 , G16H50/30
Abstract: 本发明公开了一种基因标志物在非小细胞肺癌复发预测中的应用、微小残留病灶的检测方法和预测装置,属于分子生物医学技术领域，通过对血浆样本cfDNA进行液体活检全基因组WGS低深度测序，通过对非小细胞肺癌癌细胞切除术后病人在术后的血液样本进行低通量测序，利用测序结果中的DNA碎片化片段长短比例，进行正则化比例风险模型（Regularized Cox Regression）构建，检测术后病人在术后肿瘤微小残留病灶（minimal residual disease,MRD），实现对非小细胞肺癌切除术后复发风险的早期无创精准预测，对术后辅助治疗提供指导性作用。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN115595372A
公开(公告)日：2023-01-13
申请号：CN202211619587.5
申请日：2022-12-16
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司(CN) , 南京世和医疗器械有限公司(CN)
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明涉及一种血浆游离DNA来源的甲基化检测方法、肺癌诊断标志物以及试剂盒，属于基因检测技术领域。使用一种优化的MBD‑seq技术，通过对低进入量的肺癌血浆cfDNA进行MBD蛋白甲基化富集，将富集到的高甲基化DNA构建文库进行酶促法转化，并进行甲基化测序。这种优化的MBD富集的方法在富集甲基化DNA和检测灵敏度、准确度方面都高于原始MBD‑seq方法，减少了非特异性DNA富集，同时，使用较低进入量的cfDNA，节省样本材料，提高灵敏度。本发明还提供了一种由上述检测方法进行分析得到的甲基化诊断标志物，由20个DMR区域构成，具有较好的检测准确性。
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公开(公告)号：CN113373524B
公开(公告)日：2022-10-25
申请号：CN202110458794.6
申请日：2021-04-27
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C40B70/00 , C40B80/00 , C40B40/06 , C12Q1/6869 , G16B30/00
Abstract: 本发明公开一种利用NGS技术检测血浆ctDNA超低频突变的测序方法及分子标签接头。标签接头包括含有11个碱基的样本标签和含有4个碱基的单分子及双链DNA共用标签序列。样本标签实现了超过300种i7/i5“双端唯一”index组合，分子标签可同时用作单分子和双链分子index。采用本发明提供的标签接头，可以有效去除文库富集过程中DNA氧化应激损伤、PCR扩增以及测序引入的随机错误突变；同时能够有效识别发生“标签跳跃”的分子，避免因标签跳跃造成样本间交叉污染引入的假性突变。本发明在保证100%特异性的前提下实现了检测灵敏度的大力提升，ctDNA中丰度0.1%突变的检测敏感性达到95%以上。
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公开(公告)号：CN114561473B
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202210455413.3
申请日：2022-04-28
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种PML‑RARA融合基因突变的检测方法，本发明中通过下一代测序技术（NGS）方法能够准确地检测出PML和RARA的融合基因发生的变化情况，本发明的方法能够同步检测基因突变、缺失、增加、和颠换等多种基因变异类型，全面指导临床急性早幼粒细胞白血病（acute promyelocytic leukemia,APL）的诊断，指导后续砷剂或全反式维甲酸（ATRA）治疗和耐药选择。
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公开(公告)号：CN113403395A
公开(公告)日：2021-09-17
申请号：CN202110620700.0
申请日：2021-06-03
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明涉及使用房水cfDNA进行基因检测来辅助临床诊断，属于基因检测技术领域。本发明发现利用房水中的cfDNA进行检测，并比对于参考基因组上，获得的突变信息能够有效地对原发性玻璃体视网膜淋巴瘤(PVRL)进行诊断，检测结果显著优于从血浆中对cfDNA的检测准确性，能够实现早期诊断。
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公开(公告)号：CN113355421A
公开(公告)日：2021-09-07
申请号：CN202110753782.6
申请日：2021-07-03
Applicant: 南京世和基因生物技术股份有限公司 , 南京世和医疗器械有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B20/30 , G16B40/00 , G16B30/10
Abstract: 本发明涉及肺癌早筛标志物、检测方法、检测装置以及计算机可读取介质，本发明提对血浆样本cfDNA进行WGS低深度测序，通过对高通量测序结果进行肺癌健康人差异DNA片段末端断点处序列8mer(Motif end8mer)分析，构建模型，实现了对肺癌无创精准诊断的目的。
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