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公开(公告)号:CN111781343B
公开(公告)日:2023-03-21
申请号:CN202010690993.5
申请日:2020-07-17
Applicant: 北京林业大学
IPC: G01N33/53 , C12Q1/6827
Abstract: 本发明提供了一种检测DNA甲基化修饰影响转录因子与DNA序列结合的方法,涉及分子生物学技术领域。本发明所述方法中可排除杂蛋白对结合反应的影响,降低了实验假阳性,还可以快速精准的检测DNA甲基化修饰对转录因子结合的影响。以杨树OM47基因启动子区域DNA甲基化修饰对BPC2转录因子结合的影响为例,OM47基因启动子区域未被DNA甲基化修饰的DNA序列与BPC2蛋白具有明显的结合条带,并随着冷探针竞争浓度的增加逐渐变浅,而被DNA甲基化修饰的启动子序列与BPC2蛋白没有明显的结合条带,证明启动子区域的DNA甲基化修饰会抑制与转录因子蛋白的结合效率。
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公开(公告)号:CN109487001B
公开(公告)日:2021-07-09
申请号:CN201910005388.7
申请日:2019-01-03
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种基于多位点联合评价杨树木材纤维长短的方法、引物组、试剂盒及其应用,属于植物分子育种技术领域,包括以下步骤:1)测定杨树样品基因组DNA中编码lncRNA LNC‑033373的基因内的第189位碱基,编码lncRNA LNC‑228084基因内的第346位碱基,Pto‑PO46基因内的第171位碱基和Pto‑COMT24基因内的第613位碱基;2)根据4个位点基因型的组合判断杨树样品纤维的长短;当所述基因型组合为CT‑AG‑GT‑AA时,杨树样品木材的纤维长度最长,当所述基因型组合为CT‑AA‑GT‑AC时,杨树样品木材的纤维长度最短。所述方法能够应用于杨树育种,缩短育种周期。
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公开(公告)号:CN109545278A
公开(公告)日:2019-03-29
申请号:CN201811549079.8
申请日:2018-12-18
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B20/00 , G16B30/00 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明提供了一种鉴定植物lncRNA与基因互作的方法,涉及分子遗传学技术领域,包括获得lncRNA与基因的群体SNP基因型数据;获得基因在所研究组织的群体表达量数据;获得目标性状群体表型数据;将群体SNP基因型数据与目标性状群体表型数据关联分析;将群体SNP基因型数据与群体表达量数据关联分析;计算群体SNP基因型数据与所述目标性状群体表型数据的相关性系数r;当同时满足3个限定条件时,表明lncRNA与基因有相互作用,共同影响植物目标性状的表型变异。采用该方法准确检测毛白杨lncRNA LNC-0052611与基因Pto-COMT25之间存在互作关系,且该互作关系影响了毛白杨胸径的表型变异。
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公开(公告)号:CN108467898A
公开(公告)日:2018-08-31
申请号:CN201710099761.0
申请日:2017-02-23
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , A01H1/04 , C12M1/34
Abstract: 本发明提出了预测杨树木材品质性状的方法、杨树选育方法、用于预测杨树木材品质性状的试剂盒、用于预测杨树木材品质性状的设备、杨树选育系统以及预定位点的基因型在预测杨树的木材品质性状中的用途。所述方法包括:(1)确定所述杨树下列预定位点的基因型:Pto-MIR475b基因的第1929位、Pto-RPF3-1基因的第1828位以及Pto-EMP16基因的第365位;以及(2)基于所述预定位点的基因型,预测所述杨树的木材品质性状,其中,所述Pto-MIR475b基因的第1929位基因型为GG、Pto-RPF3-1基因的第1828位基因型为GG和Pto-EMP16基因的第365位基因型为GG,是所述杨树的木材品质性状优的指示。利用本发明的方法能够预测出杨树的木材品质性状,选育出优质杨树,缩短育种周期。
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公开(公告)号:CN119979748A
公开(公告)日:2025-05-13
申请号:CN202411802881.9
申请日:2024-12-09
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种Pto‑C3H35基因单倍型在评价杨树木质素含量中的应用,属于分子标记技术领域。本发明所述Pto‑C3H35基因单倍型根据SNP1、InDel1、InDel2、InDel3和SNP2的核苷酸确定。本发明提供了测定所述基因单倍型的引物组、试剂盒,以及测定所述基因单倍型的方法,通过测定上述五个位点的基因型组合能够准确地判断杨树的木质素含量,在杨树生长早期准确、高效筛选低木质素含量的优株,应用于工业用材杨树人工林新品种选育,有效缩短育种周期。
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公开(公告)号:CN118638804B
公开(公告)日:2025-03-21
申请号:CN202410658846.8
申请日:2024-05-27
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12N15/29 , C07K14/415 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/00
Abstract: 本发明提供了PopRAP2.3基因在调控植株木质素中的应用,属于植物基因工程技术领域。本发明所述PopRAP2.3基因核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明构建了PopRAP2.3过表达转基因84K银腺杨(Populus alba×P.glandulosa cv.),揭示了该基因对杨树木质素含量与木质素积累的正调控功能及其对杨树木材品质性状的影响,提供了通过构建PopRAP2.3过表达杨树转基因植株,以获取具有优良木材品质性状的杨树材料的应用。
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公开(公告)号:CN118703561A
公开(公告)日:2024-09-27
申请号:CN202410388241.1
申请日:2024-04-01
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了一种优质抗旱杨树的基因工程育种方法。通过将含PtobZIP18的RNAi植物载体导入84K杨树中,获得了PtobZIP18‑RNAi转基因植株。本发明通过比较分析干旱胁迫下转基因与野生型84K杨的木材组分、导管密度以及茎水势等指标变化,发现在干旱胁迫下转基因杨树植株能有效优化木材品质同时提高植株抗旱能力,可为建筑、造纸和生物能源方面提供更多的优质木材原材料。
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公开(公告)号:CN117133354B
公开(公告)日:2024-06-14
申请号:CN202311097273.8
申请日:2023-08-29
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B20/20 , C12Q1/6895 , G16B20/30 , G16B50/10
Abstract: 本发明提供了一种高效鉴定林木关键育种基因模块的方法,涉及分子遗传学技术领域。本发明所述方法,可精准、高效地鉴定林木重要性状的关键育种基因模块,系统评价育种模块内各个基因型组合对表型变异的遗传效应,以此确定最优的关键育种基因模块的基因型组合,广泛应用于林木重要性状苗期精准选育以及林木分子遗传改良进程。
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公开(公告)号:CN117133354A
公开(公告)日:2023-11-28
申请号:CN202311097273.8
申请日:2023-08-29
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B20/20 , C12Q1/6895 , G16B20/30 , G16B50/10
Abstract: 本发明提供了一种高效鉴定林木关键育种基因模块的方法,涉及分子遗传学技术领域。本发明所述方法,可精准、高效地鉴定林木重要性状的关键育种基因模块,系统评价育种模块内各个基因型组合对表型变异的遗传效应,以此确定最优的关键育种基因模块的基因型组合,广泛应用于林木重要性状苗期精准选育以及林木分子遗传改良进程。
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公开(公告)号:CN111863127B
公开(公告)日:2023-06-16
申请号:CN202010690681.4
申请日:2020-07-17
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明涉及一种构建植物转录因子对靶基因遗传调控网络的方法,属于分子遗传学技术领域。获得植物待测转录因子在群体中每一个体的SNP基因型数据、植物待测转录因子在群体中每一个体的特定组织的表达量数据和植物待测候选靶基因在群体中每一个体的相同组织的表达量数据后;确定与候选靶基因表达量显著关联的SNP;确定与待测转录因子表达量高度相关的候选靶基因;当同时满足确定条件时,表明待测转录因子调控了候选靶基因表达,可依此构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。本发明所述方法可高通量、精准鉴定植物转录因子与下游靶基因的调控关系,构建转录因子对靶基因的遗传调控网络。
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