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公开(公告)号：CN101805787A
公开(公告)日：2010-08-18
申请号：CN200910227401.X
申请日：2009-12-09
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及一种鸡内脂素基因9bp indel多态性检测方法及其应用，所述的检测方法包括以鸡内脂素基因9bp indel位点的位置设计引物；然后进行PCR扩增；通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测该基因9bp indel多态性，9bp缺失时为DD基因型，9bp插入时为II基因型，该位点杂合的个体为ID基因型。利用上述检测结果结合鸡经济性状进行关联分析，用于鸡的辅助选择和分子育种。本发明的检测方法无需酶切，节约成本和时间；使用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测，克服了琼脂糖电泳对小片段核苷酸差异检测的局限性；该方法不仅分辨率高，检测灵敏，判型准确，且该凝胶对染色方法也没有要求，溴化乙啶(EB)染色和银染均可。
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公开(公告)号：CN101671725A
公开(公告)日：2010-03-17
申请号：CN200910024136.5
申请日：2009-09-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68 , G01N27/447
Abstract: 本发明公开了一种黄牛NPM1基因插入突变多态性的检测方法，包括以下步骤：1)以包含NPM1基因的待测黄牛基因组为模版，以引物P为引物进行PCR扩增；2)将PCR扩增后的片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳检测，200V电压电泳50～60min后EB染色；3)根据聚丙烯酰胺凝胶电泳检测结果对NPM1基因插入突变多态性进行分型。本发明提供一种与经济性状关联的黄牛NPM1基因多态性检测方法，针对NPM1基因编码区位点上存在的12bp的插入突变导致编码蛋白构象发生变化的基因多态性，通过设定特定引物PCR扩增后，根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果对其基因型分型，为检测中国地方黄牛NPM1基因遗传变异提供了技术支持。
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公开(公告)号：CN102839170A
公开(公告)日：2012-12-26
申请号：CN201210371817.0
申请日：2012-09-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12N15/11 , C12Q1/68 , A01K67/027
Abstract: 本发明公开了奶山羊泌乳量相关microRNA-431基因的单核苷酸多态性及其检测和应用，其基因单核苷酸多态性包括：在如SEQ ID No.1所示的奶山羊microRNA-431基因序列中，其第217位为T或C的单核苷酸多态性。RFLP多态性与泌乳量关联分析证实：MluI多态位点与产奶量之间有显著相关，基因型为TT的第三胎产奶量和体长显著高于基因型为TC和CC个体的。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记，以用于奶山羊的辅助选择和分子育种，对提高奶山羊的产奶量具有重要的作用。
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公开(公告)号：CN101955996B
公开(公告)日：2012-05-23
申请号：CN201010211243.1
申请日：2010-06-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种一种单碱基Indel突变的检测方法，根据基因中已知存在的Indel位点设计引物对Pw和Pm，然后PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳检测判型；提取待测样本的全基因组，并以全基因组为模板，以Pw、Pm为引物分别进行PCR扩增；将PCR扩增获得的产物等体积混合进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳相应条带有无来判定待测样本的目的基因Indel变异发生与否。本方法能够方便、准确的对待测样本目的基因的Indel突变做出检测，有非常大的应用价值。而Indel突变在重要的复杂疾病、分子育种和遗传多样性评价等方面的研究有着重大的理论价值。
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公开(公告)号：CN101705290B
公开(公告)日：2011-12-28
申请号：CN200910219005.2
申请日：2009-11-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊SCD基因的单核苷酸多态性及其检测方法，其基因单核苷酸多态性包括：以包含SCD基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增奶山羊SCD基因；用限制性内切酶NdeI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定奶山羊SCD基因第5001bp的碱基多态性。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记，以用于奶山羊的辅助选择和分子育种，加快奶山羊良种繁育速度。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN101955996A
公开(公告)日：2011-01-26
申请号：CN201010211243.1
申请日：2010-06-29
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种单碱基Indel突变的检测方法，根据基因中已知存在的Indel位点设计引物对Pw和Pm，然后PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳检测判型；提取待测样本的全基因组，并以全基因组为模板，以Pw、Pm为引物分别进行PCR扩增；将PCR扩增获得的产物等体积混合进行琼脂糖凝胶电泳，根据电泳相应条带有无来判定待测样本的目的基因Indel变异发生与否。本方法能够方便、准确的对待测样本目的基因的Indel突变做出检测，有非常大的应用价值。而Indel突变在重要的复杂疾病、分子育种和遗传多样性评价等方面的研究有着重大的理论价值。
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公开(公告)号：CN101899500A
公开(公告)日：2010-12-01
申请号：CN201010108118.8
申请日：2010-02-09
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛KLF7基因单核苷酸多态性的方法，以包含KLF7基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P1、P2、P3等摩尔比的混合物为引物，PCR扩增黄牛KLF7基因；用限制性内切酶TaqI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛KLF7基因第41401、42025、42075位的单核苷酸多态性。本发明对KLF7基因的SNPs进行了基因分型和基因频率分析，以及与南阳牛不同生长阶段的生长性状之间进行了性状关联分析；结果表明：KLF7基因尤其是P2检测SNP位点可用作黄牛生长性状早期选择(6月龄和12月龄)的分子标记。
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公开(公告)号：CN101875977A
公开(公告)日：2010-11-03
申请号：CN201010235173.3
申请日：2010-07-23
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛SREBP1c基因单核苷酸多态性的方法，以包含SREBP1c基因的待测黄牛全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增黄牛SREBP1c基因；用限制性内切酶Bgl I消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛SREBP1c基因第10914位的单核苷酸多态性。由于SREBP1c基因功能涉及体重、日增重、体斜长和胸围4个重要的生长性状，本发明提供的检测方法为SREBP1c基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础，以便用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS)，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。
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公开(公告)号：CN101705290A
公开(公告)日：2010-05-12
申请号：CN200910219005.2
申请日：2009-11-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种奶山羊SCD基因的单核苷酸多态性及其检测方法，其基因单核苷酸多态性包括：以包含SCD基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增奶山羊SCD基因；用限制性内切酶NdeI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定奶山羊SCD基因第5001bp的碱基多态性。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记，以用于奶山羊的辅助选择和分子育种，加快奶山羊良种繁育速度。
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公开(公告)号：CN101705289A
公开(公告)日：2010-05-12
申请号：CN200910219003.3
申请日：2009-11-17
Applicant: 西北农林科技大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了奶山羊GHRHR基因的单核苷酸多态性及其检测方法，其基因单核苷酸多态性包括：在如SEQ ID NO.1所示的奶山羊的GHRHR基因序列表的第231位为C或G的碱基多态性。其检测方法为：以包含GHRHR基因的待测奶山羊全基因组DNA为模板，以引物对P为引物，PCR扩增奶山羊GHRHR基因；用限制性内切酶MspI消化PCR扩增产物之后，再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳；根据电泳结果鉴定其多态性。该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与奶山羊泌乳性状密切相关的分子遗传标记，以用于奶山羊的辅助选择和分子育种，加快奶山羊良种繁育速度。
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