一组鉴定黄河鲤遗传雄性的联合分子标记、引物及其应用

    公开(公告)号:CN116042857A

    公开(公告)日:2023-05-02

    申请号:CN202310006230.8

    申请日:2023-01-04

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一组鉴定黄河鲤遗传雄性的联合分子标记、引物及其应用,涉及鱼类遗传性别鉴定和性别控制。目标序列如SEQ ID No:1和2,引物序列如SEQ ID No:3~6,当使用引物SEQ ID No:3和4扩增出146bp片段,即待测黄河鲤具有SEQ ID No:1所示核苷酸序列,或使用引物SEQ IDNo:5和6扩增出162bp和119bp片段,即待测黄河鲤缺失SEQ ID No:2所示核苷酸序列,为遗传雄性黄河鲤;当使用引物SEQ ID No:3和4无扩增片段,且使用引物SEQ ID No:5和6扩增出一个162bp片段时,为遗传雌性黄河鲤。经验证,该组标记准确性高、对鱼体伤害小、应用范围更广泛。

    一种可控温的鱼类麻醉状态保持装置

    公开(公告)号:CN115176746A

    公开(公告)日:2022-10-14

    申请号:CN202210979669.4

    申请日:2022-08-16

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种可控温的鱼类麻醉状态保持装置,属于生物测量技术领域。包括:外水箱、内水箱、水泵、水管、加热棒、制冷机、温控仪、温度传感器。内水箱置于外水箱中,外水箱环绕内水箱以对内水箱进行水浴控温;内水箱中的水泵和水管可将含麻醉剂的灌注到鱼嘴以长时间保持被测鱼处于麻醉状态;温控仪和温度传感器控制加热棒和制冷机的启停以对外水箱的水体进行加热或制冷,进而以水浴的方式对内水箱进行控温。将多种设备的功能集合到一个装置,该装置既能控温,又能长时间保持鱼类处于麻醉状态,简化操作流程,提高便携性,本采用水浴的方式进行控温,可使控温的过程更加均匀。

    一种大黄鱼家系构建及优良家系选育的方法

    公开(公告)号:CN110771538B

    公开(公告)日:2021-09-07

    申请号:CN201911222860.9

    申请日:2019-12-03

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种大黄鱼家系构建及优良家系选育的方法,涉及海水鱼类良种选育方法。1)亲本的选择与标记;2)亲本的强化培育;3)亲鱼催产孵化;4)鱼苗标准化培育。其技术路线清晰,目标明确,可操作性和通用性强,主要通过亲本的选择与标记、亲鱼催产孵化、鱼苗标准化培育等步骤实现定向交配的家系构建与培育,可以有效排除环境因素的影响,准确高效地筛选出目标性状家系。

    一种快速鉴定南北方花鲈群体的InDel分子标记方法

    公开(公告)号:CN110819720B

    公开(公告)日:2021-04-27

    申请号:CN201910892376.0

    申请日:2019-09-20

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种快速鉴定南北方花鲈群体的InDel分子标记方法,涉及利用分子标记种质鉴定领域。基于南北方不同种群花鲈高通量重测序数据,结合Samtools、GATK等基因分型软件分析得到全基因组InDel位点分型信息,从中挑选南北方群体具有完全不同的等位基因的两个InDel位点,根据InDel位点设计筛选两对PCR引物,通过PCR引物目的条带差异可快速准确判断待鉴定花鲈属于哪一个群体,其核苷酸序列为SEQ ID No:1‑6所示。整个鉴定过程仅需0.5~1个工作日。对南北方花鲈群体进行种质鉴定可有效进行种质资源评估,减少苗种混杂的盲目性,为花鲈在遗传育种、分子和生物信息学方面研究等奠定基础。

    一组可应用于大黄鱼抗刺激隐核虫育种的SNP标记

    公开(公告)号:CN112501317A

    公开(公告)日:2021-03-16

    申请号:CN202011578229.5

    申请日:2020-12-28

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一组可应用于大黄鱼抗刺激隐核虫育种的SNP标记,涉及分子辅助选择育种领域。公开其在大黄鱼基因组(BioProject:PRJNA505758)上的物理位置。基于全基因组关联分析,并通过全基因组选择模型优化找到一组(670个)可使模型预测准确性达到最佳的SNP分子标记集合,利用这组SNP标记培育的抗刺激隐核虫子代在攻毒验证中,表现出良好的抗虫性能。提供的与大黄鱼抗刺激隐核虫相关的分子标记,可快速将其应用到育种产业中,短时间之内就可培育高抗性的后代,减少了刺激隐核虫对大黄鱼养殖产业造成的经济损失,具有广阔的应用前景和商业价值。

    一种大黄鱼家系构建及优良家系选育的方法

    公开(公告)号:CN110771538A

    公开(公告)日:2020-02-11

    申请号:CN201911222860.9

    申请日:2019-12-03

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种大黄鱼家系构建及优良家系选育的方法,涉及海水鱼类良种选育方法。1)亲本的选择与标记;2)亲本的强化培育;3)亲鱼催产孵化;4)鱼苗标准化培育。其技术路线清晰,目标明确,可操作性和通用性强,主要通过亲本的选择与标记、亲鱼催产孵化、鱼苗标准化培育等步骤实现定向交配的家系构建与培育,可以有效排除环境因素的影响,准确高效地筛选出目标性状家系。

    一组鉴定黄河鲤遗传雄性的联合分子标记、引物及其应用

    公开(公告)号:CN116042857B

    公开(公告)日:2024-06-28

    申请号:CN202310006230.8

    申请日:2023-01-04

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一组鉴定黄河鲤遗传雄性的联合分子标记、引物及其应用,涉及鱼类遗传性别鉴定和性别控制。目标序列如SEQ ID No:1和2,引物序列如SEQ ID No:3~6,当使用引物SEQ ID No:3和4扩增出146bp片段,即待测黄河鲤具有SEQ ID No:1所示核苷酸序列,或使用引物SEQ IDNo:5和6扩增出162bp和119bp片段,即待测黄河鲤缺失SEQ ID No:2所示核苷酸序列,为遗传雄性黄河鲤;当使用引物SEQ ID No:3和4无扩增片段,且使用引物SEQ ID No:5和6扩增出一个162bp片段时,为遗传雌性黄河鲤。经验证,该组标记准确性高、对鱼体伤害小、应用范围更广泛。

    基于机器学习大黄鱼脾脏白点感染程度量化分析方法

    公开(公告)号:CN117218150A

    公开(公告)日:2023-12-12

    申请号:CN202311173307.7

    申请日:2023-09-12

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 基于机器学习大黄鱼脾脏白点感染程度量化分析方法,涉及机器学习的阈值分割技术。1)数据获取:将感染内脏白点病的大黄鱼进行解剖,使用高清摄像机对脾脏进行拍摄,获取待量化分析的脾脏白点图片;2)创建交互式分割GUI界面:用于读取拍摄的大黄鱼脾脏白点图片且自动将其转化为二值图像;3)运行主程序:主程序由python代码编写,用于GUI界面,将选中的图片显示在交互式分割GUI界面上,供下一步的对比分割;4)图片处理:选择图片,画框选中待分割区域,调整分割阈值获取相对准确的分割结果,实现脾脏白点可视化交互分割;5)量化分析:通过白点脾脏占比,实现客观标准的量化大黄鱼脾脏白点感染程度。

    一种荷包红鲤CRISPR/Cas9基因编辑方法

    公开(公告)号:CN114703232A

    公开(公告)日:2022-07-05

    申请号:CN202210545915.5

    申请日:2022-05-18

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种荷包红鲤CRISPR/Cas9基因编辑方法,涉及生物技术。具体步骤:通过序列比对在荷包红鲤基因组中鉴定目的基因,设计sgRNA靶点序列及验证引物,靶点验证后通过体外转录合成靶基因sgRNA并进行纯化;将sgRNA与Cas9蛋白等体积混合后,对人工授精后的荷包红鲤胚胎进行显微注射,进行靶基因的敲除,胚胎孵化后2个月进行剪尾提取DNA,经一代测序验证得到F0代突变杂合子。为实现荷包红鲤的快速性状改良和遗传选育提供了新途径,有利于进一步开发荷包红鲤的经济价值,增加养殖收益。

    一种快速鉴定南北方花鲈群体的InDel分子标记方法

    公开(公告)号:CN110819720A

    公开(公告)日:2020-02-21

    申请号:CN201910892376.0

    申请日:2019-09-20

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种快速鉴定南北方花鲈群体的InDel分子标记方法,涉及利用分子标记种质鉴定领域。基于南北方不同种群花鲈高通量重测序数据,结合Samtools、GATK等基因分型软件分析得到全基因组InDel位点分型信息,从中挑选南北方群体具有完全不同的等位基因的两个InDel位点,根据InDel位点设计筛选两对PCR引物,通过PCR引物目的条带差异可快速准确判断待鉴定花鲈属于哪一个群体,其核苷酸序列为SEQ ID No:1-6所示。整个鉴定过程仅需0.5~1个工作日。对南北方花鲈群体进行种质鉴定可有效进行种质资源评估,减少苗种混杂的盲目性,为花鲈在遗传育种、分子和生物信息学方面研究等奠定基础。

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