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公开(公告)号：CN104293775A
公开(公告)日：2015-01-21
申请号：CN201310298867.5
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明公开了一种筛选抗逆杨树的分子标记、筛选方法、试剂盒及应用。其中，该分子标记为采用MSAP法检测的分子标记，分子标记包括MS1，MS2，MS3，MS4，MS5，MS6，MS7，MS8，MS9，MS10。应用本发明确定的筛选抗逆杨树的分子标记，可以在杨树生长的早期进行筛选出逆境胁迫适应性强、生活力高的植株，极大地缩短林木育种选择周期，对发展杨树速生丰产纸浆林、确保我国林业持续稳定地提供高得率工业纸浆原料具有重要的战略意义。
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公开(公告)号：CN118703530A
公开(公告)日：2024-09-27
申请号：CN202411012552.4
申请日：2024-07-26
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12N15/29 , C12N15/82 , A01H5/00 , A01H6/00 , C12Q1/6895 , C12N15/113 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于分子生物技术领域，具体涉及一种杨树抗盐胁迫基因及其应用。本发明提供的杨树抗盐胁迫基因为N‑ALPHA‑ACETYLTRANSFERASE 20基因，核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；该基因的表达量与植物抗盐特性显著正相关，经实施例验证，N‑ALPHA‑ACETYLTRANSFERASE 20基因在杨树中过表达后可以显著提升植株的抗盐特性，并且不会抑制植株的生长特性，因此能够用于培育高产、优质、抗盐新品种，为林木抗盐性遗传改良提供了新的分子工具。
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公开(公告)号：CN109338011B
公开(公告)日：2021-09-24
申请号：CN201811563126.4
申请日：2018-12-20
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种高通量筛选植物基因组等位不平衡表达的杂合变异位点的方法，属于遗传学研究领域，包括以下步骤：1)外源调控因素处理植物材料获得处理样品；2)提取处理样品和对照样品的总RNA，构建链特异性测序文库并进行高通量测序；3)过滤所述原始测序数据获得clean reads；4)将所述clean reads分别与参考基因组进行比对获得比对结果；5)删除比对结果中多余复制读段，将出现INDEL位点周围的序列进行重新比对获得最终比对结果数据；6)将所述最终比对结果数据进行等位位点变异筛选获得等位不平衡表达的杂合变异位点。所述方法解决了在等位水平上解析基因组对外界环境响应的分析难题。
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公开(公告)号：CN111808935A
公开(公告)日：2020-10-23
申请号：CN202010709376.5
申请日：2020-07-22
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6869 , G16B30/10
Abstract: 本发明提供了一种植物内源siRNA转录调控关系的鉴定方法，涉及分子遗传学技术领域。本发明所述鉴定方法利用miRNA测序和降解组测序数据系统批量挖掘植物内源siRNA的靶基因，进而为小干扰RNA的功能研究提供重要信息。本发明所述鉴定方法充分利用了第二代高通量测序技术，可以对siRNA及其靶基因进行高通量的筛选，克服了遗传转化手段的繁琐；能更精确地鉴定siRNA转录调控的靶基因，并且对siRNA功能研究具有重要的理论意义和实用价值。
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公开(公告)号：CN106755408B
公开(公告)日：2020-10-13
申请号：CN201611200502.4
申请日：2016-12-22
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明提供了一种植物等位基因不平衡表达检测方法，包括以下步骤：1)比较候选基因序列，筛选标记等位基因的SNPs位点；2)根据筛选到的SNPs位点设计qPCR特异引物和简并引物；3)用qPCR特异引物和简并引物分别对待测样本的cDNA进行PCR扩增，获得扩增产物；4)若扩增产物的熔解曲线为单峰，根据PCR扩增的Ct值计算待测样本等位基因表达特异性；所述qPCR特异引物包括正向引物和反向引物，对引物3'末端与SNP位点3'末端互补的核苷酸进行LNA修饰。所述方法增加了检测结果的精确性和可靠性，并且简化了实验配套条件，显著地降低了实验成本。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109214591B
公开(公告)日：2020-07-24
申请号：CN201811187160.6
申请日：2018-10-12
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明公开了一种木本植物地上生物量预测方法及系统。所述方法首先获取BP神经网络的输入向量(木本植物的茎长、叶片数和根数)和输出向量(木本植物的茎叶鲜重和茎叶干重)；根据所述输入向量和输出向量构建地上生物量预测的BP神经网络模型；然后根据多个训练样本对BP神经网络模型进行循环往复训练，生成训练后的BP神经网络模型，即可直接采用训练后的BP神经网络模型预测木本植物的地上生物量(茎叶鲜重和茎叶干重)。所述训练后的BP神经网络模型选用木本植物表型特征(茎长、叶片数和根数)作为自变量，降低了样本数据获取的复杂度和获取时间，无需耗费大量人力物力；由于表型特征和地上生物量联系紧密，因此预测结果具有很高的准确率。
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公开(公告)号：CN111406465A
公开(公告)日：2020-07-14
申请号：CN202010362641.7
申请日：2020-04-30
Applicant: 北京林业大学
IPC: A01C1/02 , A01C1/00 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明涉及一种林木种子脱落酸含量的快速生物鉴定方法及其应用，属于林木遗传育种以及分子生物学技术领域。本发明所述方法通过林木种子水溶液制备、林木种子梯度浓度水溶液制备、梯度浓度的脱落酸(ABA)溶液制备、林木种子水溶液及ABA溶液处理拟南芥种子、记录拟南芥种子萌发情况并绘制萌发曲线的操作，能够实现难繁林木种子的脱落酸(ABA)的鉴定及相对定量。应用本发明技术方案，可低成本、快速、准确完成难繁林木种子ABA的鉴定与相对定量。
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公开(公告)号：CN108319984B
公开(公告)日：2019-07-02
申请号：CN201810120969.0
申请日：2018-02-06
Applicant: 北京林业大学
Abstract: 本发明提供了基于DNA甲基化水平的木本植物叶片性状和光合特性模型的构建方法及预测方法，属于生物分析技术领域。本发明基于随机森林选取体现地理位置差异的重要特征变量，筛选得到7个叶片特征变量，确定最优聚类数目，利用改进的FCM聚类算法得到每组聚类叶片样本；根据变量间相关性和梯度提升树得的酶切组合重要性，获得对每组聚类叶片样本中重要酶切组合；以所述酶切组合的DNA甲基化水平作为回归变量，基于高斯径向基函数构建LS‑SVM回归预测模型；输入重要酶切组合的DNA甲基化水平来准确地预测叶形状因子，叶面积和净光合速率。本方法用于预测木本植物表型特征和光合特性，同时筛选优良性状木本植物个体。
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公开(公告)号：CN106919809B
公开(公告)日：2019-03-01
申请号：CN201710120768.6
申请日：2017-03-02
Applicant: 北京林业大学
IPC: G16B25/00
Abstract: 本发明提供了一种植物响应逆境胁迫的lncRNAs二级结构功能注释方法，包括筛选植物响应逆境胁迫的lncRNAs与筛选对植物响应逆境胁迫的lncRNAs的候选靶基因；对植物响应逆境胁迫的lncRNAs的靶基因的功能注释；以及对响应逆境胁迫的lncRNAs二级结构富集分析与功能预测。本发明二级结构功能注释的方法，结合生物信息学与差异表达分析对植物逆境胁迫响应lncRNAs的二级结构进行注释，不但极大地提高了实验的效率、精准性以及灵活性并显著地降低了实验成本。
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公开(公告)号：CN104293889B
公开(公告)日：2016-08-10
申请号：CN201310298603.X
申请日：2013-07-16
Applicant: 北京林业大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种雌雄异株植物中雌雄花器官差异表达的microRNA的筛选方法，该方法包括：S101，选取具有相同基因型的雌性花器官和雄性花器官；S102，分别从雌性花器官和雄性花器官中提取总RNA，得到雌花总RNA和雄花总RNA；S103，根据提取出总RNA建立cDNA；S104，对建立的cDNA文库进行测序；S105，根据测序结果及microRNA评估标准，判断雌花和雌花cDNA文库所对应的microRNA种类及数量;以及S106，根据microRNA种类及数量，筛选出雌性花器官与雄性花器官差异表达的microRNA。本发明的方法快速高效，易于自动化，具有实用价值和广泛的应用前景。
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