用于鉴定桉树无性系的STR引物及其应用

    公开(公告)号:CN107385052A

    公开(公告)日:2017-11-24

    申请号:CN201710671363.1

    申请日:2017-08-08

    Abstract: 本发明公开了用于鉴定桉树无性系的STR引物及其应用。本发明通过大量的STR标记分型检测,筛选出了8对多态性高、扩增条带清晰的桉树STR引物用于鉴定桉树无性系,并建立了多重荧光检测体系。将该STR引物组用于鉴定桉树无性系,具有效率高、检测准确、操作方便等优势。本发明可有效甄别假冒和错乱的无性系,切实保障良种培育人和营林种植者的权益;并可为今后快速进行桉树种质资源遗传评价、遗传图谱构建、分子标记辅助育种、无性系指纹图谱构建和鉴定提供重要的技术支撑。

    一种基于荧光dUTP的自动检测SSR分子标记的方法

    公开(公告)号:CN101899520B

    公开(公告)日:2013-01-02

    申请号:CN201010239919.8

    申请日:2010-07-28

    Abstract: 本发明提供了一种基于荧光dUTP的自动检测SSR分子标记的方法,包括以下步骤:(1)配制PCR反应体系:取1.0μL 10×buffer、dNTP 25~50μM、MgCl22.0mM、前向引物0.5μM、后向引物0.5μM、Taq酶1个单位、荧光dUTP10pmol和基因组DNA 5ng混合,加超纯水补至10μL;(2)进行降落PCR:94℃4min;20个循环:94℃30s、70~60℃或者66~56℃30s且每个循环降低0.5℃、72℃1min;再26个循环:94℃30s、60或者56℃30s、72℃1min;最后72℃10min,得PCR产物;(3)取PCR产物1.0μL加入9.34μL超纯甲酰胺、0.16μL分子量内标,95℃5min后放置冰上快速冷却,在测序仪上进行标记检测。

    一种基于双酶切的简化基因组测序文库的构建方法

    公开(公告)号:CN110343741A

    公开(公告)日:2019-10-18

    申请号:CN201910665025.6

    申请日:2019-07-23

    Abstract: 本发明提供了一种基于双酶切的简化基因组测序文库的构建方法,属于全基因组重测序技术领域,包括利用限制性内切酶MspI和MseI对基因组DNA进行酶切,将接头序列分别连接到酶切产物上,得到连接产物;将连接产物进行等质量混合,将得到的混合物进行双轮磁珠分选,得到350bp的片段;以得到的片段为模板,用引物对进行PCR扩增,将得到的扩增产物纯化后,构建得到基于双酶切的简化基因组测序文库;所述引物对的上游引物的序列如SEQ ID No.1所示,下游引物的序列如SEQ ID No.2所示。采用本发明提供的构建方法最终开发的SNP位点有225,744个,提高了SNP位点的开发。

    鉴别蛇皮果性别的DNA片段、引物和方法

    公开(公告)号:CN102433389B

    公开(公告)日:2013-06-19

    申请号:CN201210004925.4

    申请日:2012-01-06

    Abstract: 本发明公开了一种鉴别蛇皮果性别的DNA片段、引物和方法。鉴定蛇皮果性别的DNA特异性片段,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。鉴别引物如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。鉴定方法是用鉴别引物作为扩增引物,以样品的基因组DNA作为模板进行PCR反应,将PCR产物进行电泳检测,电泳结果中出现一段1579bp条带的样品为雄株,而相同部位没有出现条带的样品为雌株。本发明的引物和鉴定方法能够准确的鉴别出蛇皮果的雌雄性别,相比于传统的肉眼鉴定蛇皮果植株性别,本发明具有简单,方便,随时都可以鉴定的优点,为更有效、合理的种植蛇皮果创造了条件。

    鉴别蛇皮果性别的DNA片段、引物和方法

    公开(公告)号:CN102433389A

    公开(公告)日:2012-05-02

    申请号:CN201210004925.4

    申请日:2012-01-06

    Abstract: 本发明公开了一种鉴别蛇皮果性别的DNA片段、引物和方法。鉴定蛇皮果性别的DNA特异性片段,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。鉴别引物如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。鉴定方法是用鉴别引物作为扩增引物,以样品的基因组DNA作为模板进行PCR反应,将PCR产物进行电泳检测,电泳结果中出现一段1579bp条带的样品为雄株,而相同部位没有出现条带的样品为雌株。本发明的引物和鉴定方法能够准确的鉴别出蛇皮果的雌雄性别,相比于传统的肉眼鉴定蛇皮果植株性别,本发明具有简单,方便,随时都可以鉴定的优点,为更有效、合理的种植蛇皮果创造了条件。

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