一种检测黄牛PRDM16基因单核苷酸多态性的方法

    公开(公告)号:CN101671726B

    公开(公告)日:2012-02-22

    申请号:CN200910024139.9

    申请日:2009-09-29

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛PRDM16基因单核苷酸多态性的方法,以包含PRDM16基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛PRDM16基因;用限制性内切酶MspI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酰胺凝胶电泳;根据聚丙烯酰胺凝胶电泳结果鉴定黄牛PRDM16基因第212237位的单核苷酸多态性;由于PRDM16基因功能涉及初生重、日增重、体重生长性状,本发明提供的检测方法为PRDM16基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种中国地方黄牛Pax7基因的单核苷酸多态性的PCR-RFLP检测方法

    公开(公告)号:CN101921857A

    公开(公告)日:2010-12-22

    申请号:CN201010255967.6

    申请日:2010-08-18

    Abstract: 本发明公开了一种快速检测中国地方黄牛Pax7基因的单核苷酸多态性的PCR-RFLP方法。首先,以包含Pax7基因的黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P(包括P1(F1,R1)和P2(F2,R2))为引物,在Taq DNA聚合酶、Buffer(缓冲环境)、Mg2+、dNTPs存在的情况下,PCR扩增黄牛Pax7基因;用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛Pax7基因编码区第3531位G或A的单核苷酸多态性与第56626位G或A的单核苷酸多态性。Pax7基因与家畜的早期骨骼肌发育有关,该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记,为黄牛的标记辅助选育(MAS)提供基础资料,进而可推广至黄牛分子育种领域。

    一种快速检测山羊Lhx3基因单核苷酸多态性的PCR-RFLP方法

    公开(公告)号:CN101921853A

    公开(公告)日:2010-12-22

    申请号:CN201010255628.8

    申请日:2010-08-18

    Abstract: 本发明公开了一种快速检测山羊Lhx3基因单核苷酸多态性(SNP)的PCR-RFLP方法,其基因多态性为:在山羊Lhx3基因第5557位T或C的碱基多态性。上述山羊Lhx3基因的单核苷酸多态性的检测方法为:以包含Lhx3基因的待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增山羊Lhx3基因;用限制性内切酶消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定山羊第5557位的单核苷酸多态性。该方法操作简单,快速,成本低,而且检测的精确度高,便于推广应用。

    一种检测黄牛PRDM16基因单核苷酸多态性的方法

    公开(公告)号:CN101671726A

    公开(公告)日:2010-03-17

    申请号:CN200910024139.9

    申请日:2009-09-29

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛PRDM16基因单核苦酸多态性的方法,以包含PRDM16基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛PRDM16基因;用限制性内切酶Mspl消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行聚丙烯酸胺凝胶电泳;根据聚丙烯酸胺凝胶电泳结果鉴定黄牛PRDM16基因第212237位的单核苷酸多态性;由于PRDM16基因功能涉及初生重、日增重、体重生长性状,本发明提供的检测方法为PRDM16基因的SNP与生长性状关系的建立奠定了基础,以便用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种检测牛成肌细胞HMGA2基因增强子的方法

    公开(公告)号:CN111676273B

    公开(公告)日:2023-08-11

    申请号:CN202010599560.9

    申请日:2020-06-28

    Abstract: 本发明公开了一种检测牛成肌细胞HMGA2基因增强子的方法。根据染色质开放性高通量测序数据分析和序列保守性,并结合双荧光素酶载体报告系统,筛选具备增强子活性的牛HMGA2基因序列片段,根据Hi‑C数据分析确定筛选片段中与HMGA2基因启动子产生远距互作的序列,利用CRISPRi系统和实时荧光定量PCR技术验证序列片段功能。本发明从分子和细胞两个水平鉴定出可以促进牛成肌细胞HMGA2基因表达的增强子,可以用于肉牛的基因编辑和转基因育种,从而加快优良肉牛群体选育进程。

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