检测黄牛lncFAM200B基因5’侧翼区单核苷酸多态性的方法及其应用

    公开(公告)号:CN110172516A

    公开(公告)日:2019-08-27

    申请号:CN201910218571.5

    申请日:2019-03-21

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区单核苷酸多态性的方法及其应用,以中国地方黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区序列,再对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳和DNA测序;根据测序结果鉴定黄牛lncFAM200B基因5'侧翼区的2个单核苷酸变异;关联分析发现lncFAM200B基因5'侧翼区的这2个单核苷酸位点对生长性状具有重要调控,可作为分子标记。本发明提供的检测方法为建立lncFAM200B基因SNP与生长性状关系提供简单、快速的途径,检测结果可用于生长性状的标记辅助选择,加快建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种检测小尾寒羊ORMDL1基因CNV标记的方法及其应用

    公开(公告)号:CN110093425A

    公开(公告)日:2019-08-06

    申请号:CN201910355325.4

    申请日:2019-04-29

    Abstract: 本发明公开了一种检测小尾寒羊ORMDL1基因CNV标记的方法及其应用:基于实时荧光定量PCR技术,以小尾寒羊耳组织全基因组DNA为模板,扩增小尾寒羊ORMDL1基因的拷贝数变异区域,并以扩增小尾寒羊ANKRD1基因片段作为内参,然后利用2*2-ΔΔCt的方法计算个体的拷贝数变异类型。通过对拷贝数变异与生长性状进行关联分析,本发明提供的检测小尾寒羊ORMDL1基因CNV标记的方法为建立小尾寒羊ORMDL1基因拷贝数变异与生长性状之间的关联奠定了基础,以用于加快小尾寒羊品种改良的选育进程,该方法简单、快速,便于推广应用。

    一种山羊ATBF1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用

    公开(公告)号:CN108441566A

    公开(公告)日:2018-08-24

    申请号:CN201810301992.X

    申请日:2018-04-04

    Abstract: 本发明公开了一种山羊ATBF1基因插入/缺失多态性的检测方法及其应用。以待测山羊全基因组DNA为模板,以引物对P1和P2为引物,通过PCR技术扩增山羊ATBF1基因部分片段,再进行琼脂糖凝胶电泳,鉴定山羊ATBF1基因indel位点多态性。相关分析结果揭示,ATBF1基因的indel位点的不同基因型与陕北白绒山羊、关中奶山羊和海南黑山羊的体高、胸围存在显著相关,揭示ATBF1基因indel位点的基因型可作为提高山羊体高和胸围性状的DNA标记。本发明可应用在山羊标记辅助选择育种中,有利于快速建立优良体尺性状的山羊遗传资源群体。

    秦川牛microRNA-320a-1基因单核苷酸多态性的检测方法及其应用

    公开(公告)号:CN106521001A

    公开(公告)日:2017-03-22

    申请号:CN201611193760.4

    申请日:2016-12-21

    Abstract: 本发明公开了一种秦川牛microRNA-320a-1基因单核苷酸多态性的检测方法及其应用,以待测秦川牛全基因组DNA为模板,以引物对P2为引物,PCR扩增秦川牛microRNA-320a-1基因片段;用限制性内切酶PvuII消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定秦川牛microRNA-320a-1基因rs518926539:C>T的单核苷酸多态性。本发明提供的检测方法为利用microRNA-320a-1基因SNP与生长性状的关系进行秦川牛肉用生长性状的标记辅助选择奠定了基础,有利于快速建立遗传资源优良的秦川牛种群。

    一种检测牛PCAF基因单核苷酸多态性的RFLP方法及试剂盒

    公开(公告)号:CN106498083A

    公开(公告)日:2017-03-15

    申请号:CN201611193789.2

    申请日:2016-12-21

    Abstract: 本发明公开了一种检测牛PCAF基因单核苷酸多态性的RFLP方法及试剂盒,以牛基因组DNA为模板,PCR扩增牛PCAF基因片段,用限制性内切酶消化PCR扩增产物,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定牛PCAF基因内含子13和3’UTR区单核苷酸多态性。以GenBank Accession No.AC_000158.1为参考,检测到的PCAF基因第61908位、第62131位和第73406位3个SNPs与牛多种重要生长性状相关。本发明提供的在DNA水平上检测PCAF基因SNP的RFLP方法可用于中国肉牛生长性状的标记辅助选择,以便快速建立遗传资源优良的肉牛种群。

    一种黄牛TMEM18基因的单核苷酸多态性检测方法

    公开(公告)号:CN102251038B

    公开(公告)日:2016-08-03

    申请号:CN201110201229.8

    申请日:2011-07-18

    Abstract: 本发明公开了一种检测黄牛TMEM18(transmembrane protein 18)基因单核苷酸多态性的方法,其基因多态性包括:在黄牛TMEM18基因第3843位为A或G的碱基多态性;在黄牛TMEM18基因第3873位为G或A的碱基多态性。上述黄牛TMEM18基因的单核苷酸多态性为:以包含TMEM18基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,以引物对1F和2F为引物,PCR扩增黄牛TMEM18基因;分别用限制性内切酶XspI和MluI消化PCR扩增产物之后,再对酶切后的扩增片段进行琼脂糖凝胶电泳;根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛TMEM18基因第3843位和第3873位的单核苷酸多态性;该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生产性状密切相关的分子遗传标记,以便于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择(MAS),快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种快速检测黄牛FLII基因SNP的RFLP方法及其应用

    公开(公告)号:CN105349673A

    公开(公告)日:2016-02-24

    申请号:CN201510866870.1

    申请日:2015-11-30

    Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛FLII基因SNP的RFLP方法及其应用:分别以黄牛基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增黄牛FLII基因内含子22区,用限制性内切酶Sac II消化PCR扩增产物,再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛FLII基因内含子22区单核苷酸多态性,并且该SNP位点与黄牛的生长发育性状显著相关,可作为DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记,并应用于黄牛肉用生长性状的标记辅助选择,以便快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

    一种黄牛IGF2基因单核苷酸多态性的检测方法及试剂盒

    公开(公告)号:CN103290123B

    公开(公告)日:2014-09-10

    申请号:CN201310204434.9

    申请日:2013-05-28

    Abstract: 本发明公开了一种黄牛IGF2基因单核苷酸多态性的检测方法及试剂盒,以包含IGF2基因的待测黄牛全基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛IGF2基因;通过DNA测序和限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术(PCR-RFLP)进行基因多态性的检测与快速分型,该方法是一种在DNA水平上筛查和检测与黄牛生长性状密切相关的分子遗传标记。本发明提供的检测方法可用于黄牛生长性状的分子标记辅助选择,进而快速建立遗传资源优良的黄牛种群。本发明检测方法简单、成本低,检测结果直接、可靠,适用于对黄牛IGF2基因突变位点的大规模的筛查和诊断。

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