一种人结肠癌蛋白质标志物Spondin-2的检测方法及其检测试剂盒

    公开(公告)号:CN105385752A

    公开(公告)日:2016-03-09

    申请号:CN201510128247.6

    申请日:2015-03-23

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于基因工程和医学检测领域。具体而言,本发明提供一种人结肠癌标志物Spondin-2的检测方法,包括:分离提取样本中的基因组DNA或者蛋白;和/或,检测所得的基因组DNA或者蛋白中Spondin-2的含量。本发明还提供了一种人结肠癌蛋白质标志物Spondin-2的应用方法,用于制备诊断、预测、检测或筛查结肠癌的制剂;还可以用于制备诊断、预测、检测或筛查结肠癌细胞的增殖、转移、结肠癌临床分期、结肠癌病人预后的制剂。本发明为有效判断结肠癌癌变进程提供科学依据。本发明的检测试剂盒高效、灵敏、特异性强,相关的检测方法快速、简便,成本较低。

    一种N-糖链固相富集并质谱分析的方法

    公开(公告)号:CN105372356A

    公开(公告)日:2016-03-02

    申请号:CN201410428810.7

    申请日:2014-08-27

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属糖蛋白质组学和糖组学分析领域,涉及一种用氨基磷酸盐衍生N-糖链并用Ti4+修饰磁性纳米材料富集衍生后的N-糖链的方法,其包括:首先通过对N-糖链的还原端进行氨基磷酸盐的衍生在N-糖链上引入磷酸根,再将Ti4+修饰的磁性纳米材料Fe3O4@Ti4+置于衍生后的糖链溶液中,通过Ti4+和糖链中的磷酸根之间的螯合反应,将糖链固定在磁性纳米材料上,随后将未和纳米材料结合的非糖链分子(如蛋白质、多肽、无机盐等)清洗除去,最后再在碱性条件下将捕获的糖链从材料上解离下来,送入质谱分析糖链。本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,能实现N-糖链的高灵敏、高选择性质谱分析。

    棕榈酸在制备治疗肝癌和抗肝癌转移药物中的应用

    公开(公告)号:CN104173325A

    公开(公告)日:2014-12-03

    申请号:CN201310647579.6

    申请日:2013-12-04

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属药物技术领域,涉及化合物棕榈酸(Palmitic Acid)新的药用用途,具体涉及棕榈酸在制备治疗肝癌和抗肝癌转移药物中的应用。本发明通过体外CCK-8抗肿瘤活性评价,结果显示,棕榈酸对人肝癌细胞株Hep3B,LM3的生长具有显著的抑制作用;尤其对具有高转移潜能的LM3的运动和迁移能力均有显著的抑制作用;所述棕榈酸(Palmitic Acid)能用于制备抗肝癌和抗肝癌转移药物,具有良好的开发应用前景。

    用于微流控芯片上样品直接电喷雾电离的装置及质谱分析方法

    公开(公告)号:CN103033556A

    公开(公告)日:2013-04-10

    申请号:CN201210580139.9

    申请日:2012-12-28

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于微流控芯片技术领域,具体为一种用于微流控芯片上样品直接电喷雾电离的装置及质谱分析方法。本发明装置至少包括:放置微流控芯片的三维操作平台;提供喷雾电压的电极和脉冲高压电源,所述提供喷雾电压的电极与微流控芯片中的液体不发生直接接触;以及设置在电离装置旁的质谱。本发明无需在微流控芯片上制作或连接喷针或改变芯片微通道的原有设计,即可利用脉冲电压的充、放电过程,对芯片微通道内的溶液样品直接电离,进行质谱分析。此外,该装置中高压电机与溶液无直接接触,不会因电极上发生化学反应而影响微流控芯片的原有功能。该装置操作简单,方便,适用于微流控芯片上样品的直接电离、质谱分析。

    一种利用质谱靶板富集糖基化肽段的方法

    公开(公告)号:CN101943688B

    公开(公告)日:2013-01-02

    申请号:CN200910054685.7

    申请日:2009-07-10

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属生化分析领域,涉及一种利用质谱靶板富集糖基化肽段的方法。本方法采用表面修饰硼酸基团的硅片作为基底材料,选择性捕获并富集溶液中的糖基化肽段,然后直接将硅片置于MALDI靶版上进行质谱分析。本发明能够快速、简便地捕获糖基化肽段并直接用于MALDI-MS检测且无需洗脱步骤。利用该方法可以将糖肽的质谱检测限提高两个数量级。此外,碳酸氢铵是质谱预处理中最常用到的一种盐,通常在酶解过程中大量存在,容易影响后续质谱分析。采用本方法,可以在捕获糖基化肽段的过程中同时去除200mM高浓度的碳酸氢铵。与传统方法相比,减少了除盐步骤,也同时减少了样品损失。

    用于一级相同质量二级b,y碎片离子对定量方法的数据分析方法

    公开(公告)号:CN102809600A

    公开(公告)日:2012-12-05

    申请号:CN201210249904.9

    申请日:2012-07-19

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及蛋白质组学技术领域,具体为一种用于一级相同质量二级b,y碎片离子对定量方法的数据分析方法,该方法采用Matlab语言编写,在Matlab界面下运行,其基于SEQUEST搜索引擎得到的蛋白定性结果,通过提取串级质谱中b,y碎片离子对的峰强度信息,做比值后得到肽段和蛋白的定量信息。该方法还加入了一个“谱图拆分”的优化模块,减少了b,y碎片离子对共碎裂谱图对肽段正确定性的影响。本发明还构造z统计量计算定量蛋白的显著性,为确定实际样品中上下调变化蛋白提供参考依据。本发明为一级相同质量二级b,y碎片离子对的定量蛋白质组学新方法的发展和应用,提供了一个通用的、开放的、准确的定量分析手段。

    一种用于蛋白质组学研究的液滴微系统

    公开(公告)号:CN102590322A

    公开(公告)日:2012-07-18

    申请号:CN201210021440.6

    申请日:2012-01-31

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于蛋白质组学技术领域,具体为一种用于蛋白质组学研究的液滴微系统。该液滴微系统可与蛋白分离装置在线联用,将已分离的蛋白样品与蛋白酶溶液混合后,利用微体系液滴生成技术将蛋白样品和与之互不相溶的油相在微通道中形成油包水液滴。液滴反应既能短时间内达到常规蛋白质酶解的效率,又能避免记忆效应和交叉污染。微反应器末端设有喷头可直接进行电喷雾质谱检测,该反应器实现了蛋白质组学研究技术路线的快速化、自动化和集成化,从而提高效率、节省成本,为蛋白质组学研究提供更详细、更全面的蛋白信息。

    一种交流电辅助蛋白高效酶解方法

    公开(公告)号:CN101280334B

    公开(公告)日:2011-11-02

    申请号:CN200810037855.6

    申请日:2008-05-22

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属蛋白质组学技术领域,具体涉及一种交流电辅助蛋白高效酶解方法。本发明将蛋白质与蛋白水解酶如胰蛋白酶按一定比例溶解于缓冲溶液中,使溶液与一对施加有交流电压的电极接触。在电极间交变电场的作用下,带电荷的蛋白、酶以及无机离子等迅速改变在电场中的运动方向,引起蛋白和酶等分子的振动、碰撞、旋转和摩擦等运动。同时,蛋白分子中肽链中荷电基团也会在交变电场的作用下发生震动,使更多的酶切位点暴露出来,这些运动提高了蛋白和酶分子的能量水平及相互作用频率,从而大幅提高蛋白酶解效率。采用交流电辅助蛋白酶解,酶解时间从传统溶液酶解的12小时大幅缩短到5到10分钟,而酶解效率得到显著提高。

    一种提高肽段离子化效率的方法

    公开(公告)号:CN101363779B

    公开(公告)日:2011-07-27

    申请号:CN200810039698.2

    申请日:2008-06-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属生化分析领域,涉及一种提高肽段离子化效率的方法。本发明利用碱性和疏水性有机化合物对蛋白质或肽段羧基衍生,提高肽段离子化效率,并对所衍生的样品直接进行质谱分析和鉴定。本发明选用的有机化合物能高效率、高特异性地与肽段的羧基形成共价键,从而有效地提高肽段与质子的结合能力和肽段的疏水性,极大地提高肽段的离子化效率,促使低丰度、难电离的肽段得到检测。本发明具有反应特异性高、副反应少、步骤简单、经济和省时等特点,可广泛用于蛋白质组学领域,大大提高了质谱对低丰度及难电离肽段的检测能力。

    一种对痕量蛋白质或多肽靶上原位除盐和富集的方法

    公开(公告)号:CN101368890B

    公开(公告)日:2011-06-22

    申请号:CN200710045047.X

    申请日:2007-08-17

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属生化分析领域,涉及一种利用具有微观相分离结构的嵌段聚合物涂层,对多肽和蛋白质样品进行靶上无需洗脱的原位除盐和同步富集,能避免样品损失,并对所富集的样品直接进行基质辅助激光解析离子化质谱的分析和鉴定的方法。本发明无需额外的洗脱除盐步骤也无需点覆过量体积的基质溶液就可实现除盐,并可直接进行MALDI质谱分析;本发明不仅首次成功实现了样品靶上原位免洗除盐与富集的特性,而且具有灵敏度高、重现性高、通量高、耐盐能力强、经济和省时等特点。可广泛用于蛋白质组学领域,同时也大大拓展了聚合物涂层技术的应用范围。

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