一种疾病蛋白质生物标志物鉴定方法

    公开(公告)号:CN115112778B

    公开(公告)日:2023-08-04

    申请号:CN202110297187.6

    申请日:2021-03-19

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及一种疾病蛋白质生物标志物鉴定方法,包括以下步骤:S1、针对单一或复杂疾病筛选候选蛋白;S2、通过确认疾病靶蛋白,进而预测靶肽段以及其保留时间和可检出性;S3、通过预测靶肽段以及其保留时间和可检出性信息构建靶向蛋白组学方法列表;S4、进行靶向蛋白组学验证。与现有技术相比,本发明的方法可用于复杂疾病相关蛋白的独特性肽段筛选、保留时间预测以及可检出性信息获取,在大规模样本集中同时有效地精确测量大量候选蛋白质标志物。采用本发明的方法,一次PRM分析(60min)可同时采集300‑400条靶肽段,极大地缩短了时间成本与经济成本,说明该方法极其适用于复杂疾病成百上千候选标志物的验证工作,具有广泛适用性。

    一组蛋白作为肿瘤标志物在制备恶性肿瘤诊断试剂和试剂盒中的用途

    公开(公告)号:CN109425739B

    公开(公告)日:2022-03-18

    申请号:CN201710774080.X

    申请日:2017-08-31

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属生物学和医学检验领域,涉及一组肿瘤生物标志物及其应用,具体涉及一组蛋白作为新的肿瘤标志物以及用于诊断肿瘤的发生和预后的方法和制备试剂盒。本发明提供了特异的一组蛋白包括APOE、ITIH3、APOA1、APOL1作为诊断标志物以及APOE、ITIH3、APOA1、APOL1蛋白作为肿瘤标志物用于制备消化系统恶性肿瘤诊断试剂或试剂盒的用途。本发明的肿瘤标志物APOE、ITIH3、APOA1、APOL1经临床检测证实,所述蛋白标志物或者蛋白标志物与CA19‑9联合,较传统的CA19‑9具有更好的敏感性和特异性,可作为人群普查的肿瘤标志物及制备诊断试剂和试剂盒;本发明还涉及其基于质谱的检测方法。

    一种电感耦合等离子体飞行时间质谱仪

    公开(公告)号:CN112185800B

    公开(公告)日:2021-07-16

    申请号:CN202011054721.2

    申请日:2020-09-27

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明涉及一种电感耦合等离子体飞行时间质谱仪,包括位于同轴水平线上,且依次连接的电离源模块、离子冷却聚焦接口和质谱检测器模块,所述电离源模块包括进样装置、与进样装置连接的等离子体炬管以及设于等离子体炬管外部的射频发生器,所述离子冷却聚焦接口包括特殊金属材料腔体以及设于该腔体内的高温常压离子聚焦引入装置,所述质谱检测器模块包括依次连接的离子传输聚焦装置、滤质器、离子透镜和飞行时间质量分析器,所述高温常压离子聚焦引入装置通过所述离子传输聚焦装置连接所述滤质器。与现有技术相比,本发明具有简化仪器结构、对操作人员要求低、提高产业利用价值等优点。

    一种基于机器学习的生物标志物扩维筛选方法

    公开(公告)号:CN112710722A

    公开(公告)日:2021-04-27

    申请号:CN201911026970.8

    申请日:2019-10-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于生物标志物领域,涉及生物标志物扩维筛选方法,具体涉及一种基于扩维算法和机器学习的生物标志物筛选和疾病分类的方法。本发明方法中,首先对生物标志物进行质谱定量数据采集,并进行预处理,获得特征数据集,再利用自动化工具对特征数据集进行扩维计算,引入代表生物标志物表达相关性的新特征,最后利用正交偏最小二乘法判别分析算法对特征进行分类和筛选;扩维筛选后,数据集有更好的分类效果,同时扩维后的特征数据在疾病判别中灵敏度和特异性明显高于单一生物分子(ROC曲线下的面积),利用随机森林算法对疾病进行成功分类,准确率达到0.97。

    用于飞行时间质量分析器调试的可调狭缝装置

    公开(公告)号:CN111276386A

    公开(公告)日:2020-06-12

    申请号:CN202010083094.9

    申请日:2020-02-08

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于飞行时间质量分析器技术领域,具体为用于飞行时间质量分析器调试的可调狭缝装置。本可调狭缝装置由狭缝、狭缝安装座、轴承、轴承压盖、旋杆、推杆、密封筒、微分头、密封座挤压盖、碗形密封圈以及必要的螺钉配合连接组成;旋杆通过轴承与压盖链接,使轴承和旋杆进行周向旋转运动;推杆与密封筒之间的缝隙由碗形密封圈实现真空密封,实现推杆进行轴向运动的同时保持密封圈的密封性能;通过调整微分头可以调整狭缝挡板的位置和狭缝之间的相对位置关系,实现狭缝宽度的调节。本装置实现了真空腔体外部调节真空内部狭缝的位置,实时观测狭缝位置对飞行时间质量分析器性能的影响,弥补加工装配的误差;装置结构简单,调整空间大。

    一种用于质谱的脉冲延时宽度调制电路

    公开(公告)号:CN109617541A

    公开(公告)日:2019-04-12

    申请号:CN201811358386.8

    申请日:2018-11-15

    Applicant: 复旦大学

    CPC classification number: H03K7/08 H01J49/022 H03K5/133

    Abstract: 本发明属于质谱仪技术领域,具体为用于质谱的脉冲延时宽度调制电路。本发明首先提供一种信号处理电路,其包括:整形模块,用于接收波形失真的待处理信号,并还原其方形脉冲形状;脉宽调整模块,连接所述整形模块,用于对所述整形模块输出的信号进行脉宽延长;延时模块,连接所述脉宽调整模块,用于对所述脉宽调整模块输出的信号进行脉冲时间延时,并予以输出。本发明的用于质谱的脉冲延时宽度调制电路包括上述信号处理电路,可有效实现信号的波形还原、脉宽延长和脉冲时间延时,从而有助于确保质谱仪控制过程的各电路部分皆能同步地接收触发信号。

    一种基于糖蛋白非糖肽的质谱多反应监测定量糖蛋白方法

    公开(公告)号:CN107576733A

    公开(公告)日:2018-01-12

    申请号:CN201710495427.7

    申请日:2017-06-26

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属分析化学技术领域,涉及糖蛋白质谱相对/绝对定量的方法,具体涉及一种基于糖蛋白非糖肽的质谱多反应监测定量糖蛋白方法,其包括:利用肼化学法对样品中的糖蛋白进行富集,用蛋白酶释放糖蛋白的非糖肽,利用色谱-质谱鉴定技术对非糖肽进行鉴定,合成适用于MRM定量的标准肽段,然后对这些肽段的保留时间,能量,母子离子对进行质谱优化,并建立相应的数据库;并将肽段可用于样品中糖蛋白的绝对/相对定量。本发明方法步骤简单、操作方便、快速高效,可以实现糖基化的单个蛋白质/糖蛋白质组的快速、精准定量。

    三维离子淌度质谱联用仪
    10.
    发明授权

    公开(公告)号:CN106057626B

    公开(公告)日:2017-12-29

    申请号:CN201610387914.7

    申请日:2016-06-06

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于同分异构体样品分离分析技术领域,具体为一种三维离子淌度质谱联用仪。本发明包括电离源模块、离子淌度模块、质谱检测器模块;电离源模块包括离子源喷针及去溶剂化区;离子淌度模块包括第一离子聚焦透镜、离子阱、进口端挡板、缓冲气出口、环状电极、加热环、强不对称场电极、缓冲气入口、第二离子聚焦透镜;质谱检测器模块包括离子传输四级杆及所述飞行时间质谱。三个模块中心在同一条中轴线上,电离源模块连接于所述离子淌度模块中第一离子聚焦透镜上;离子淌度模块通过第二离子聚焦透镜连接质谱检测模块的离子传输聚焦装置。本发明利用环状叠电极带动离子飞行,缓冲气从反方向进入;同时在第三维度上进一步添加一维电场,增加缓冲气与离子碰撞机会,大大提高了分离效率。

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