公开(公告)号：CN119446288A

公开(公告)日：2025-02-14

申请号：CN202411467387.1

申请日：2024-10-21

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 徐艳春 ,  王文慧 ,  杨淑慧 ,  崔靓玉 ,  刘博洋 ,  褚佳宁 ,  邹奥 ,  于梦佳 ,  刘丹 ,  徐海涛

IPC: G16B40/20 ,  G16B20/30 ,  G16B30/10

Abstract: 一种基于粪便DNA计算年龄的模型及构建方法，属于生物信息学技术领域。本发明通过以粪便为材料解决了现有技术中所需材料不宜获的问题，并且本发明首次公开了一种mtDNA异质性位获得的方法，可以更精准捕捉目标mtDNA异质性位点。基于目标mtDNA异质性位点和机器学习构建了一套筛选与年龄相关的检测位点的方法学流程，并构建了一种基于粪便DNA中的mtDNA异质性位点计算年龄的模型，该模型主要应用于计算大型动物或野生动物年龄，该模型解决了现有技术中成本较高的问题。

公开(公告)号：CN119943139A

公开(公告)日：2025-05-06

申请号：CN202510028577.1

申请日：2025-01-08

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 徐艳春 ,  王文慧 ,  杨淑慧 ,  张琦 ,  高鹏 ,  杨金城 ,  刘丹 ,  徐海涛

IPC: G16B20/30 ,  G16B40/00 ,  G06N20/10 ,  G06N20/20

Abstract: 本发明提出了一种基于DNA甲基化异质性指标构建的表观遗传时钟计算模型及构建方法，属于生物信息学技术领域。本发明基于粪便中DNA甲基化异质性指标构建了一种表观遗传时钟计算模型，DNA甲基化异质性指标包括甲基化熵指标、表观多态性指标、不一致读取对比例指标和不一致读取对的定量比例指标，解决了现有技术中对野生动物或大型动物年龄估算方法存在材料获取困难、CpG位点检测困难和年龄估算方法较为复杂等问题。本发明提供的表观遗传时钟计算模型准确性更高、简便快捷。

公开(公告)号：CN119446276A

公开(公告)日：2025-02-14

申请号：CN202411473531.2

申请日：2024-10-22

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 徐艳春 ,  王文慧 ,  周永恒 ,  杨淑慧 ,  刘笑熙 ,  刘栩源 ,  李翔 ,  刘丹 ,  徐海涛 ,  任晓彤

IPC: G16B40/00 ,  G16B20/30 ,  G16B30/00 ,  G06F18/27 ,  G06N20/10 ,  G06N5/01 ,  C12Q1/6888

Abstract: 本发明提出了一种表观遗传时钟计算模型及构建方法，属于生物信息学技术领域。本发明通过以东北虎为例，以其粪便为材料搭建DNA甲基化与年龄(月龄)的数学关系，提供了一种表观遗传时钟的计算模型剂构建方法，解决了现有技术中对大型动物(包括野生动物)计算年龄所需材料不易获取的问题。本发明的表观遗传时钟的计算模型应用于计算大型动物或野生动物的年龄，本发明所选取材料为粪便是非损伤、易获得的材料，并且本发明计算年龄的准确性高于传统方法中利用血液的计算方法。

公开(公告)号：CN119943137A

公开(公告)日：2025-05-06

申请号：CN202510034870.9

申请日：2025-01-09

Applicant: 东北林业大学

Inventor： 徐艳春 ,  王文慧 ,  杨淑慧 ,  高雨薇 ,  刘丹 ,  徐海涛

IPC: G16B20/00 ,  G16B20/20 ,  G16B40/20 ,  G16B50/30

Abstract: 本发明提出了一种基于粪便mtDNA异质性指标计算年龄的模型及构建方法，属于生物信息学技术领域。本发明通过构建一种基于粪便中DNA的mtDNA异质性指标与年龄相关的计算模型，mtDNA异质性指标包括，mtDNA异质性位点不一致读数比率、mtDNA异质性位点碱基突变多样性和mtDNA异质性位点的不一致读对比率的定量，解决了现有技术中所需材料不宜获得及成本较高的问题。本发明计算年龄的模型与现有技术相比，所需材料不会对动物造成损伤并且比较容易获得，检测成本低且准确性高，可为更多动物的年龄鉴定方法提供借鉴。