公开(公告)号：CN115762643A

公开(公告)日：2023-03-07

申请号：CN202211208150.2

申请日：2022-09-30

Applicant: 辽宁大学

Inventor： 刘宏生 ,  王伟晶 ,  张力 ,  冯华炜

IPC: G16B40/00 ,  G16B30/00 ,  G16B15/30 ,  G16B5/00 ,  G06F18/22 ,  G06F18/25 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/048 ,  G06N3/047 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明是一种基于密集连接卷积网络的病毒与宿主间蛋白质相互作用预测方法，包括以下步骤：步骤1：预处理数据；步骤2：使用Word2Vec中Skip‑Gram模型和One‑Hot编码来获得氨基酸的嵌入向量；步骤3：根据蛋白质的词嵌入矩阵，构建密集连接的卷积网络进行特征提取；步骤4：通过PSSM特征矩阵，获得平均的RPM‑PSSM特征描述符；步骤5：根据特征描述符构建全连接神经网络进行特征提取；步骤6：采用concatenate操作进行特征融合，最后将训练好的模型用于预测。本发明对不同的特征进行特征提取，包含了蛋白质进化信息和理化性质，序列中局部关键信息和远程依赖关系，更好地提高了预测的准确率。