公开(公告)号：CN113241114A

公开(公告)日：2021-08-10

申请号：CN202110313020.4

申请日：2021-03-24

Applicant: 辽宁大学

Inventor： 刘宏生 ,  张力 ,  衣利威 ,  周威

IPC: G16B5/00 ,  G16B30/10 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00 ,  G06N3/06

Abstract: 本发明涉及一种基于图卷积神经网络的lncRNA‑蛋白质相互作用预测方法，包括以下步骤：步骤1：对数据进行预处理；步骤2：使用Smith‑Waterman算法计算各lncRNA之间的相似性，生成lncRNA的相似性矩阵；步骤3：使用高斯算法计算各lncRNA之间的高斯相似性，最终的相似性为SW相似性与高斯相似性加和取平均；步骤4：计算各蛋白质之间的相似性，得到蛋白质的相似性矩阵；步骤5：根据得到的相似性矩阵，利用图卷积神经网络提取序列的相似性特征，得到预测结果。本发明考虑到了序列间不同的相似性，利用图卷积模型对序列的相似性特征建模，有效地提取了序列间的相似性特征，更好地利用序列相似性提高了lncRNA‑蛋白质相互作用预测的正确率。