公开(公告)号：CN113308470A

公开(公告)日：2021-08-27

申请号：CN202110572641.4

申请日：2021-05-25

Applicant: 西安交通大学医学院第一附属医院

Inventor： 刘希 ,  廉洁 ,  汪园园 ,  邓元 ,  李晓锋 ,  张冠军

IPC: C12N15/113 ,  C12N15/867 ,  C12N5/10 ,  A61K31/7105 ,  A61P35/00

Abstract: 本发明公开了靶向敲除ARID1A基因的sgRNA、构建ARID1A基因缺失细胞株的方法及应用，属于生物医药技术领域。通过构建重组慢病毒质粒ARID1A sgRNA‑lentiCRISPR v2、将CRISPR/Cas9慢病毒系统通过293T细胞进行包装获得慢病毒颗粒、将慢病毒颗粒感染目的细胞株、有限稀释法传代筛选，可获得稳定的ARID1A基因敲除的细胞株。Western blot蛋白表达检测显示，基因敲除的细胞株ARID1A蛋白表达完全缺失。另外，ARID1A基因敲除的细胞株增殖能力明显增强。结果表明，利用CRISPR/Cas9慢病毒系统成功敲除ARID1A基因后，可促使胃上皮细胞的恶性转化。

公开(公告)号：CN119810254A

公开(公告)日：2025-04-11

申请号：CN202411876678.6

申请日：2024-12-19

Applicant: 西安交通大学医学院第一附属医院

Inventor： 刘希 ,  王亚健 ,  张新娟 ,  樊杨阳 ,  马瑞宁 ,  汪园园 ,  潘雨瑶 ,  张冠军

IPC: G06T11/40 ,  G06T7/13 ,  G06T7/90 ,  G06T7/66 ,  G06N3/0455 ,  G06N3/0464

Abstract: 一种基于扩散模型的病理切片虚拟染色的图像生成方法，属于医疗图像处理技术领域。首先将经过H&E染色作为源图像数据集，将经过IHC染色的病理切片图像作为目标图像数据集；对源图像进行预处理，将源图像转换到对应的YUV颜色空间；提取源图像的显著图和梯度图，生成加权注意力图；利用神经网络搭建扩散模型，输入预处理后的源图像进行微调；反复迭代直到损失函数收敛后，结束训练；输入加权注意力图进行虚拟染色的推理。本发明在推理部分加入病理切片图像的加权注意力作为图像提示输入网络，以控制最终生成图像的细胞结构不被改变，同时保留和强调目标染色图像的颜色特征；提高生成的虚拟染色图像准确率和重建效果。