基于冬瓜转录组序列开发的EST-SSR引物及其应用

    公开(公告)号:CN111304358B

    公开(公告)日:2022-09-09

    申请号:CN202010320212.3

    申请日:2020-04-22

    Abstract: 本发明公开了提供一种基于冬瓜转录组序列开发的EST‑SSR引物及其应用。该方法通过筛选冬瓜转录组序列的SSR位点,根据SSR位点两侧的核苷酸序列设计引物得到EST‑SSR引物。利用本发明所述的3对EST‑SSR引物对冬瓜资源进行扩增,全自动核酸蛋白分析仪验证的标记结果,能够应用于人工绘制冬瓜品种鉴别示意图的构建。根据SSR扩增结果可以快速、准确地将冬瓜资源区分开来,有效地鉴定了各个资源,可用于我国冬瓜属植物品种的种质鉴定、种质资源管理、品种权鉴定及保护等方面。

    中国南瓜转录组SSR分子标记引物及其应用

    公开(公告)号:CN109280722B

    公开(公告)日:2021-09-21

    申请号:CN201811382143.8

    申请日:2018-11-20

    Abstract: 本发明提供中国南瓜转录组SSR分子标记引物及其应用,所述分子标记引物包含18对引物,其序列分别如SEQ ID NO.1‑36所示。利用Primer 3.0共设计出6489对SSR引物。从92对有效扩增引物中随机选择30对引物,对30个中国南瓜种质进行多态性验证分析,其中18对(占60%)引物表现稳定可重复的多态性。利用UPGMA作图,将30份供试材料分为2类。利用中国南瓜转录组数据进行SSR标记开发能获得较高频率的SSR位点,且类型丰富,为中国南瓜遗传多样性分析和遗传图谱构建提供更丰富可靠的标记选择。

    一种丝瓜内参基因UBQ的引物及应用

    公开(公告)号:CN111575401A

    公开(公告)日:2020-08-25

    申请号:CN202010643115.8

    申请日:2020-07-07

    Abstract: 本发明属于分子生物学领域,具体涉及一种丝瓜内参基因UBQ的引物及应用。本发明以内参基因UBQ的核苷酸序列为基础,设计出一对荧光定量特异引物如SEQ ID No.1、SEQ ID No.2所示。利用BestKeeper,GeNorm,NormFinder和RefFinder分析软件和Delta Ct法对UBQ基因的稳定性进行评价,内参基因UBQ在盐胁迫条件下最稳定。本发明所设计的实时荧光定量PCR引物特异性强,具有很高稳定性、可靠性和重复性,为丝瓜盐胁迫下相关功能基因的精确定量提供有力支持,提高了研究的稳定性、重复性和可靠性。

    基于冬瓜转录组序列开发的EST-SSR引物及其应用

    公开(公告)号:CN111304358A

    公开(公告)日:2020-06-19

    申请号:CN202010320212.3

    申请日:2020-04-22

    Abstract: 本发明公开了提供一种基于冬瓜转录组序列开发的EST-SSR引物及其应用。该方法通过筛选冬瓜转录组序列的SSR位点,根据SSR位点两侧的核苷酸序列设计引物得到EST-SSR引物。利用本发明所述的3对EST-SSR引物对冬瓜资源进行扩增,全自动核酸蛋白分析仪验证的标记结果,能够应用于人工绘制冬瓜品种鉴别示意图的构建。根据SSR扩增结果可以快速、准确地将冬瓜资源区分开来,有效地鉴定了各个资源,可用于我国冬瓜属植物品种的种质鉴定、种质资源管理、品种权鉴定及保护等方面。

    一种丝瓜内参基因TUB及其引物和应用

    公开(公告)号:CN111676231A

    公开(公告)日:2020-09-18

    申请号:CN202010643156.7

    申请日:2020-07-07

    Abstract: 本发明属于分子生物学领域,具体涉及一种丝瓜内参基因TUB及其引物和应用。丝瓜内参基因TUB核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。利用该基因序列设计的丝瓜实时荧光定量PCR引物如SEQ ID No.2-3所示。本发明利用BestKeeper,GeNorm,NormFinder和RefFinder分析软件和Delta Ct法对TUB基因的稳定性进行评价,内参基因TUB在过氧化氢和干旱胁迫条件下最稳定。本发明所设计的实时荧光定量PCR引物特异性强,具有很高稳定性、可靠性和重复性,为丝瓜过氧化氢和干旱胁迫等逆境胁迫下相关功能基因的精确定量提供有力支持,提高了研究的稳定性、重复性和可靠性。

    一种花椰菜内参基因及其应用

    公开(公告)号:CN108504665A

    公开(公告)日:2018-09-07

    申请号:CN201810614138.9

    申请日:2018-06-14

    Abstract: 本发明提供一种花椰菜内参基因及其应用,属于分子生物学领域,所述基因序列如SEQ ID NO.1所示。用于制备所述基因的克隆引物为:BoACT-F:CCAATCATACTCAAAAGAAGAGTT;BoACT-R:AGGATTCAATCCAGCCACAGGTT。该基因可作为花椰菜的内参基因用于荧光定量 PCR 中标定其他新基因。寻找合适稳定的花椰菜内参基因,对提高荧光定量PCR实验的重复性、稳定性和实验数据的可靠性意义重大,对锚定花椰菜新基因,相关基因功能的表达分析将起到不可估量的作用。

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