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公开(公告)号：CN114182022A
公开(公告)日：2022-03-15
申请号：CN202210110195.X
申请日：2022-01-29
Applicant: 福建医科大学孟超肝胆医院(福州市传染病医院) , 西安交通大学
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公布了一种基于cfDNA碱基突变频率分布检测肝癌特异突变的方法，是对血液中的基因突变筛选策略，不需要依赖肿瘤组织取样，完全无创性的肿瘤突变检测方案，用于精确性筛选肿瘤来源突变。通过收集肿瘤患者的手术前血液样本与手术后血液样本，分别提取cfDNA进行高通量UMI测序。经过高精度的序列处理与合并后，分别对每个血液样本进行突变检测。鉴定突变后，使用所有体细胞突变在手术前后两个时间点的频率变化对不同类型基因突变进行分群。然后对筛选到的肿瘤来源突变进行整合，筛选出的肿瘤来源特异突变可以进一步用于时间序列样本的肿瘤负荷动态评估。
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公开(公告)号：CN114182022B
公开(公告)日：2024-07-09
申请号：CN202210110195.X
申请日：2022-01-29
Applicant: 福建医科大学孟超肝胆医院(福州市传染病医院) , 西安交通大学
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公布了一种基于cfDNA碱基突变频率分布检测肝癌特异突变的方法，是对血液中的基因突变筛选策略，不需要依赖肿瘤组织取样，完全无创性的肿瘤突变检测方案，用于精确性筛选肿瘤来源突变。通过收集肿瘤患者的手术前血液样本与手术后血液样本，分别提取cfDNA进行高通量UMI测序。经过高精度的序列处理与合并后，分别对每个血液样本进行突变检测。鉴定突变后，使用所有体细胞突变在手术前后两个时间点的频率变化对不同类型基因突变进行分群。然后对筛选到的肿瘤来源突变进行整合，筛选出的肿瘤来源特异突变可以进一步用于时间序列样本的肿瘤负荷动态评估。
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公开(公告)号：CN102062725B
公开(公告)日：2012-07-04
申请号：CN201010556961.2
申请日：2010-11-24
Abstract: 本发明公开了一种馆藏壁画表面颜料特征的无损分析方法，利用无损检测分析技术，包括建立容差球模型对颜色的评估分析(定量分析)、对单位表面积壁画颜料质量统计分析(定量分析)、通过表面显微特征分析(定性分析)、颜料厚度分析(定量分析)，是一种可量化、可操作、可比较和无损伤测量的评估方法。在无损分析检测的基础上，本发明通过对馆藏壁画进行划分区域，综合考虑多种因素选定多个测量点，对壁画保存现状给出科学的结论，为壁画科技保护与修复提供科学依据。本发明进行大量测量数据的统计与分析，对壁画颜料数据库建设和壁画长期保存、保护、修复、展示与管理提供了雄厚的科学检测数据资源。
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公开(公告)号：CN100365013C
公开(公告)日：2008-01-30
申请号：CN200610041952.3
申请日：2006-03-21
Applicant: 西安交通大学
IPC: C07K1/14
Abstract: 本发明公开了一种古代DNA的提取方法，该方法采用等离子体等处理骨骼样品，使骨骼样品的内表面的有机污染物质被分解，快速清除骨骼样品的表面和内表面污染，然后进行DNA的提取；包括打磨骨骼样品表面，次氯酸处理，紫外照射，70%乙醇洗涤两次，去除外源微生物DNA污染，进一步用Ar/O2(9∶1)离子体处理样品，最后在液氮中研磨成粉末作为提取样品。样品消化裂解后，通过分三步完成的酚氯仿抽提方法去除被消化掉的有机分子，通过采用二氧化硅吸附柱吸附及超滤离心管(3kDa)过滤，得到古代DNA模板。本发明的方法能极快对表面和内表面污染进行有效的清除。显著提高了古代DNA提取成功率及模板含量。
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公开(公告)号：CN114891887A
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202210521515.0
申请日：2022-05-13
Applicant: 西安交通大学
IPC: C12Q1/6886 , G16B50/00 , G16B35/20 , G16H50/30 , G06F17/18
Abstract: 本发明公开了一种三阴性乳腺癌预后基因标志物筛选的方法，运用三阴性乳腺癌的基因表达数据，获取与细胞增殖标志物互作的基因，并借助单因素Cox回归来筛选预后相关基因，本发明利用最小最大凹惩罚的Cox回归方法构建预后风险评估模型，获得了能够预测和评估三阴性乳腺癌风险的预后基因标志物和预后评估方法。本发明中提出了针对高异质性疾病三阴性乳腺癌预后标志物基因识别技术，可在临床上运用推广。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113724782A
公开(公告)日：2021-11-30
申请号：CN202110955838.6
申请日：2021-08-19
Applicant: 西安交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于可变聚腺苷酸化位点的疾病预后标志物筛选方法。本发明主要基于逐步回归模型和最小最大凹惩罚的Cox回归模型，从转录组测序数据中识别预后相关APA特征，筛选稳定的预后风险相关标志基因组，提供预后风险得分计算公式，基于数据辅助预测临床患者预后。本发明提供了构建应用于临床患者分层指标的新思路，在已有数据的实施和验证中表现出较高的准确性，并可以简便的推广到任意数据集。
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公开(公告)号：CN102175628A
公开(公告)日：2011-09-07
申请号：CN201110059094.6
申请日：2011-03-11
Abstract: 本发明公开了秦汉陶俑彩绘表面颜料特征的无损分析方法，利用无损检测分析技术，包括建立容差球模型对颜色的评估分析(定量分析)、对单位表面积陶俑颜料质量统计分析(定量分析)、通过表面显微特征分析(定性分析)、颜料厚度分析(定量分析)，是一种可量化、可操作、可比较和无损伤测量的评估方法。在无损分析检测的基础上，本发明通过对秦汉陶俑进行划分区域，综合考虑多种因素选定多个测量点，对陶俑保存现状给出科学的结论，为陶俑科技保护与修复提供科学依据。本发明进行大量测量数据的统计与分析，对陶俑颜料数据库建设和陶俑长期保存、保护、修复、展示与管理提供了雄厚的科学检测数据资源。
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公开(公告)号：CN1821265A
公开(公告)日：2006-08-23
申请号：CN200610041952.3
申请日：2006-03-21
Applicant: 西安交通大学
IPC: C07K1/14
Abstract: 本发明公开了一种古代DNA的提取方法，该方法采用等离子体等处理骨骼样品，使骨骼样品的内表面的有机污染物质被分解，快速清除骨骼样品的表面和内表面污染，然后进行DNA的提取；包括打磨骨骼样品表面，次氯酸处理，紫外照射，70％乙醇洗涤两次，去除外源微生物DNA污染，进一步用Ar/O2(9∶1)离子体处理样品，最后在液氮中研磨成粉末作为提取样品。样品消化裂解后，通过分三步完成的酚氯仿抽提方法去除被消化掉的有机分子，通过采用二氧化硅吸附柱吸附及超滤离心管(3kDa)过滤，得到古代DNA模板。本发明的方法能极快对表面和内表面污染进行有效的清除。显著提高了古代DNA提取成功率及模板含量。
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公开(公告)号：CN110055337B
公开(公告)日：2021-02-02
申请号：CN201910185048.7
申请日：2019-03-12
Applicant: 西安交通大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6879 , C12Q1/6851
Abstract: 一种针对DNA含量极低的古代人类遗骸性别鉴定方法，先对提取的DNA进行含量的鉴定；再分别设定两对性别鉴定位点，并标记为性别位点A和B，性别位点A是牙釉质蛋白基因，性别位点B是X和Y染色体上的一段保守区域，借助实时荧光定量PCR MGB探针法分别对性别位点A和B进行扩增和鉴定；本发明设定两种性别扩增基因相结合，两种性别基因鉴定结果可以互相补充和验证，大大增加了古代人类遗骸性别鉴定结果的可靠性；本发明方法所用的古DNA模板量较少，只要1.5μl就可以完成模板定量两种性别基因鉴定整个过程；实时荧光定量PCR技术的应用，相对于传统PCR扩增和凝胶电泳验证步骤，缩短了实验时间和减少了操作步骤，提高了检测灵敏性和效率。
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公开(公告)号：CN104732116B
公开(公告)日：2017-11-28
申请号：CN201510111810.9
申请日：2015-03-13
Applicant: 西安交通大学
Abstract: 一种基于生物网络的癌症驱动基因的筛选方法，包括如下步骤：(1)癌症差异表达基因筛选；(2)癌症生物分子网络构建；(3)基于癌症生物分子网络的基因癌症驱动力计算；(4)根据驱动力计算结果排序确定癌症驱动基因；本发明方法不仅和成熟可靠的现代高通量技术紧密结合，而且符合系统生物学和网络药理学理论，与生物网络的结合使癌症驱动基因的筛选更加的贴合生物体内的生物学过程，为进一步的基因靶点药物研发打下了重要基础。
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