公开(公告)号：CN110055337B

公开(公告)日：2021-02-02

申请号：CN201910185048.7

申请日：2019-03-12

Applicant: 西安交通大学

Inventor： 张虎勤 ,  赵静 ,  吴晓明 ,  刘晓刚 ,  杜建强 ,  林松 ,  胡曦

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6879 ,  C12Q1/6851

Abstract: 一种针对DNA含量极低的古代人类遗骸性别鉴定方法，先对提取的DNA进行含量的鉴定；再分别设定两对性别鉴定位点，并标记为性别位点A和B，性别位点A是牙釉质蛋白基因，性别位点B是X和Y染色体上的一段保守区域，借助实时荧光定量PCR MGB探针法分别对性别位点A和B进行扩增和鉴定；本发明设定两种性别扩增基因相结合，两种性别基因鉴定结果可以互相补充和验证，大大增加了古代人类遗骸性别鉴定结果的可靠性；本发明方法所用的古DNA模板量较少，只要1.5μl就可以完成模板定量两种性别基因鉴定整个过程；实时荧光定量PCR技术的应用，相对于传统PCR扩增和凝胶电泳验证步骤，缩短了实验时间和减少了操作步骤，提高了检测灵敏性和效率。

公开(公告)号：CN103740699B

公开(公告)日：2016-04-06

申请号：CN201310675886.5

申请日：2013-12-11

Applicant: 西安交通大学

Inventor： 张虎勤 ,  赵静 ,  刘芳娥 ,  吴晓明 ,  刘晓刚 ,  杜建强 ,  陈雪梅

IPC: C12N15/10

Abstract: 一种担载SiO2磁珠快速提取古DNA的方法，将处理好的骨骼样品放置在等离子体处理反应器中，对骨骼样品处理，液氮处理骨骼样品，把骨骼样品研磨成粉末，并加入其10倍体积的提取缓冲液振荡；在离心机中吸出上清液浓缩；再加入结合缓冲液和磁珠悬浮液混匀；加入洗涤缓冲液洗涤，取下离心管，加入TE洗脱液离心使磁珠被吸附，将洗脱液移至干净离心管中，即得到古DNA提取溶液；本发明在整个纯化过程不需要离心、不需要加入多种试剂，简化了古DNA提取步骤，缩短了提取时间，操作简单，成本低廉，大大提高了古DNA提取效率，降低了提取成本和对设备的依赖性。

公开(公告)号：CN110055337A

公开(公告)日：2019-07-26

申请号：CN201910185048.7

申请日：2019-03-12

Applicant: 西安交通大学

Inventor： 张虎勤 ,  赵静 ,  吴晓明 ,  刘晓刚 ,  杜建强 ,  林松 ,  胡曦

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6879 ,  C12Q1/6851

Abstract: 一种针对DNA含量极低的古代人类遗骸性别鉴定方法，先对提取的DNA进行含量的鉴定；再分别设定两对性别鉴定位点，并标记为性别位点A和B，性别位点A是牙釉质蛋白基因，性别位点B是X和Y染色体上的一段保守区域，借助实时荧光定量PCR MGB探针法分别对性别位点A和B进行扩增和鉴定；本发明设定两种性别扩增基因相结合，两种性别基因鉴定结果可以互相补充和验证，大大增加了古代人类遗骸性别鉴定结果的可靠性；本发明方法所用的古DNA模板量较少，只要1.5μl就可以完成模板定量两种性别基因鉴定整个过程；实时荧光定量PCR技术的应用，相对于传统PCR扩增和凝胶电泳验证步骤，缩短了实验时间和减少了操作步骤，提高了检测灵敏性和效率。

公开(公告)号：CN103740699A

公开(公告)日：2014-04-23

申请号：CN201310675886.5

申请日：2013-12-11

Applicant: 西安交通大学

Inventor： 张虎勤 ,  赵静 ,  刘芳娥 ,  吴晓明 ,  刘晓刚 ,  杜建强 ,  陈雪梅

IPC: C12N15/10

Abstract: 一种担载SiO2磁珠快速提取古DNA的方法，将处理好的骨骼样品放置在等离子体处理反应器中，对骨骼样品处理，液氮处理骨骼样品，把骨骼样品研磨成粉末，并加入其10倍体积的提取缓冲液振荡；在离心机中吸出上清液浓缩；再加入结合缓冲液和磁珠悬浮液混匀；加入洗涤缓冲液洗涤，取下离心管，加入TE洗脱液离心使磁珠被吸附，将洗脱液移至干净离心管中，即得到古DNA提取溶液；本发明在整个纯化过程不需要离心、不需要加入多种试剂，简化了古DNA提取步骤，缩短了提取时间，操作简单，成本低廉，大大提高了古DNA提取效率，降低了提取成本和对设备的依赖性。

公开(公告)号：CN102629255A

公开(公告)日：2012-08-08

申请号：CN201210049757.0

申请日：2012-02-29

Applicant: 西安交通大学

Inventor： 张虎勤 ,  刘芳娥 ,  吴晓明 ,  杜建强 ,  夏娟娟 ,  刘晓刚 ,  郭燕

IPC: G06F17/30 ,  G06N3/12

Abstract: 一种基于mtDNA遗传信息聚类分析的区域人口结构分析方法，采用遗传算法和k-modes模型嵌合的聚类算法对区域人群mtDNA遗传序列信息进行聚类分析，通过研究类群分布规律及各聚类中心之间的距离，统计在各个类群的样本数，计算出各个类群中的人口分布密度；从而对所选区域的人口结构特征作出分析；利用数据库中区域人群mtDNA序列数据，采用遗传算法嵌合K-modes的分析方法，给出定量的mtDNA分子标识的类群结构划分方法，从而分析研究区域人群结构特征，具有较好的聚类效果和稳定性，适用于区域群体大规模mtDNA数据聚类分析。