公开(公告)号：CN116741278A

公开(公告)日：2023-09-12

申请号：CN202310720162.1

申请日：2023-06-18

Applicant: 湖南农业大学

Inventor： 黄建安 ,  王仲 ,  金琦芳 ,  李勤 ,  欧行畅 ,  李适 ,  刘仲华

IPC: G16B30/10 ,  G16B25/20 ,  C12Q1/6895 ,  C12N15/11 ,  C12R1/66

Abstract: 本发明公开了一种用于鉴别六堡茶中近缘微生物的特异性核酸序列筛选方法，该方法采用目标微生物及其近缘微生物的基因组序列文件进行比对，再经过在线NCBI数据库比对，进一步删除非特异序列后，得到特异蛋白序列集；并设计鉴别PCR引物，将得到备选引物集中引物通过扩增，根据扩增结果删除其中存在非特异扩增的引物；提取目标微生物及其近缘微生物的基因组DNA分别作为模板，进行PCR扩增，删除备选引物集中无法有效扩增的引物，删除备选引物集中存在非特异扩增的引物对。本发明的筛选方法采用多次生物信息学比对和虚拟筛选技术，减少了PCR等实验筛选过程所需资源，高效地获得大量目标微生物的特异性核酸序列，缩短特异性核酸序列筛选时间。