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公开(公告)号：CN113912532A
公开(公告)日：2022-01-11
申请号：CN202111241384.2
申请日：2021-10-25
Applicant: 深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心 , 北京大学深圳研究生院 , 深圳湾实验室
IPC: C07D213/68 , C07D213/70 , C07K1/107 , C09K11/06
Abstract: 本发明提供了一种可用于蛋白质赖氨酸残基化学修饰的探针，具有如式VI所示的结构通式：本发明还提供了一种蛋白质的修饰方法，加入需要修饰的蛋白质，所述的化学修饰位点为蛋白质赖氨酸残基；可用于蛋白质赖氨酸残基化学修饰的探针VI投料为蛋白质的0.1当量至200当量。根据蛋白质赖氨酸残基的化学选择性修饰技术和应用的需求，本发明提供了以含吡啶盐为活性官能团的蛋白质赖氨酸残基的高效选择性化学修饰方法。
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公开(公告)号：CN113912532B
公开(公告)日：2023-09-08
申请号：CN202111241384.2
申请日：2021-10-25
Applicant: 深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心 , 北京大学深圳研究生院 , 深圳湾实验室
IPC: C07D213/68 , C07D213/70 , C07K1/107 , C09K11/06
Abstract: 本发明提供了一种可用于蛋白质赖氨酸残基化学修饰的探针，具有如式VI所示的结构通式：本发明还提供了一种蛋白质的修饰方法，加入需要修饰的蛋白质，所述的化学修饰位点为蛋白质赖氨酸残基；可用于蛋白质赖氨酸残基化学修饰的探针VI投料为蛋白质的0.1当量至200当量。根据蛋白质赖氨酸残基的化学选择性修饰技术和应用的需求，本发明提供了以含吡啶盐为活性官能团的蛋白质赖氨酸残基的高效选择性化学修饰方法。
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公开(公告)号：CN113912525B
公开(公告)日：2023-08-01
申请号：CN202111242530.3
申请日：2021-10-25
Applicant: 深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心 , 北京大学深圳研究生院 , 深圳湾实验室
IPC: C07C381/12 , C07K1/113
Abstract: 本发明公开了一种用于修饰蛋白质半胱氨酸残基的探针，其结构通式如下所示：本发明还提供了一种用于修饰蛋白质半胱氨酸残基的探针的制备方法，在一个反应容器中加入底物卤代β‑羰基化合物I和硫醚II，所述的卤代β‑羰基化合物I的结构式为，所述的硫醚II的结构式为产物以沉淀的形式直接析出，或添加反应溶剂等体积的乙醚促进产物的析出。实验证明本发明蛋白质半胱氨酸探针III对细胞是非常安全的，可作为活细胞的半胱氨酸修饰探针进行开发探索。
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公开(公告)号：CN116283749A
公开(公告)日：2023-06-23
申请号：CN202310289623.4
申请日：2023-03-23
Applicant: 深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心
IPC: C07D213/68 , C07K1/107 , C07F9/58 , G01N21/64
Abstract: 本发明提供了一种可用于蛋白质赖氨酸残基化学修饰的探针，其结构如下所示：本发明还提供了上述的一种可用于蛋白质赖氨酸残基化学修饰的探针吡啶盐的制备方法。本发明还提供了上述的一种可用于蛋白质赖氨酸残基化学修饰的探针在荧光成像、标记、示踪或者生物治疗中的应用。本发明的一种用于啶盐活性酯探针可对溶酶体、内质网、线粒体和细胞膜进行特异性靶向，并应用于荧光成像、标记、示踪和生物治疗。
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公开(公告)号：CN115894714A
公开(公告)日：2023-04-04
申请号：CN202211290853.4
申请日：2022-10-20
Applicant: 深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心
Abstract: 本发明提供了一种多肽‑蛋白复合物共价探针，由多肽和蛋白复合组成，其特征在于，所述的蛋白为STAT3蛋白，所述的多肽的结构式如下所示，本发明还提供了上述多肽‑蛋白复合物共价探针的制备方法。本发明还提供了上述的多肽‑蛋白复合物共价探针在制备靶向和抓取识别STAT3相互作用蛋白的药物中的应用。本发明发现了与转录激活因子STAT3相互作用作用的靶标蛋白CARM1。本发明能提高与STAT3蛋白相互作用靶标蛋白的共价抓取和富集，对于寻找转录激活因子STAT3蛋白相互作用靶标蛋白以及研究STAT3蛋白在癌症发展的调节机制提供了一种新的思路。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113683659A
公开(公告)日：2021-11-23
申请号：CN202110960606.X
申请日：2021-08-20
Applicant: 北京大学深圳研究生院 , 深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心
IPC: C07K1/107 , C07K1/13 , G01N33/68 , G01N33/58 , G01N33/573
Abstract: 本发明属于生物医药领域，提供了一种形成蛋白质赖氨酸探针的方法，所述的方法是探针反应，包括以下步骤：S1，在弱酸性水溶液环境中，实现无自由基作用下巯基‑炔偶联反应，形成炔丙基锍盐；S2，在弱碱性条件下，通过炔丙基锍盐活化4‑戊炔酸羧基，形成烯酯；S3，通过USP7蛋白的共价配体导向，烯酯与USP7蛋白的赖氨酸残基上的氨基发生反应，将炔修饰转移到蛋白上；S4，炔与N3‑FAM发生点击化学反应，产生绿色荧光。本发明适用于蛋白质赖氨酸残基的化学修饰，通过点击化学在短时间内实现反应的快速进行。本发明使用的试剂毒性较小、成本低廉，适合实验室和工业化生产，并适合实验室和工业化蛋白质组学研究应用。
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公开(公告)号：CN114057827B
公开(公告)日：2023-10-13
申请号：CN202111461946.4
申请日：2021-12-02
Applicant: 深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心 , 北京大学深圳研究生院 , 深圳湾实验室
Abstract: 本发明公开了选择需要标记的蛋白，使用带有羧基或者硫代羧基的功能分子作为底物，使用不饱和锍盐作为羧基活化剂，在碱性缓冲溶液下，标记的蛋白发生固相肽键的生成反应；在缓冲溶液中，经过不饱和锍盐活化的胺酯交换反应和蛋白上的氨基形成特异性修饰反应；通过western blot或质谱手段鉴定特异性修饰情况。本发明使用含有羧基或硫代羧基的功能分子为底物，使用不饱和锍盐作用羧基活化剂，在不同类型的缓冲溶液中，能通过胺酯交换反应标记不同种类的各类蛋白。本发明使用安全低毒的锍盐活化酯作为标记分子，高效高选择性地可对蛋白标记，可用于基于活性的蛋白分析以及药物偶联抗体的中抗体分子的标记。
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公开(公告)号：CN113956206B
公开(公告)日：2023-04-28
申请号：CN202111240882.5
申请日：2021-10-25
Applicant: 深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心 , 北京大学深圳研究生院 , 深圳湾实验室
IPC: C07D239/34 , C07D213/64 , C07D213/68 , C07D277/68 , C07D263/58 , C07D251/30 , C09K11/06 , C07K1/107 , C07K1/13
Abstract: 本发明公开了一种用于修饰蛋白质赖氨酸残基的探针，其结构通式如下所示：本发明还提供了上述探针的制备方法。还提供了采用上述探针在蛋白质赖氨酸残基化学修饰中的用途。本发明探针对赖氨酸的修饰能力高于商品化探针，无论是用于纯蛋白质标记还是细胞中的蛋白质标记均具有一定的研究开发探索价值。
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公开(公告)号：CN114057827A
公开(公告)日：2022-02-18
申请号：CN202111461946.4
申请日：2021-12-02
Applicant: 深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心 , 北京大学深圳研究生院 , 深圳湾实验室
Abstract: 本发明公开了选择需要标记的蛋白，使用带有羧基或者硫代羧基的功能分子作为底物，使用不饱和锍盐作为羧基活化剂，在碱性缓冲溶液下，标记的蛋白发生固相肽键的生成反应；在缓冲溶液中，经过不饱和锍盐活化的胺酯交换反应和蛋白上的氨基形成特异性修饰反应；通过western blot或质谱手段鉴定特异性修饰情况。本发明使用含有羧基或硫代羧基的功能分子为底物，使用不饱和锍盐作用羧基活化剂，在不同类型的缓冲溶液中，能通过胺酯交换反应标记不同种类的各类蛋白。本发明使用安全低毒的锍盐活化酯作为标记分子，高效高选择性地可对蛋白标记，可用于基于活性的蛋白分析以及药物偶联抗体的中抗体分子的标记。
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公开(公告)号：CN113896782A
公开(公告)日：2022-01-07
申请号：CN202111201938.6
申请日：2021-10-15
Applicant: 深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心 , 北京大学深圳研究生院
IPC: C07K14/47 , C07K1/16 , C07K1/107 , C07K1/06 , C07K1/04 , C07C269/04 , C07C271/22 , C07C227/20 , C07C229/22 , C07C269/06 , C07C271/64 , G01N27/62
Abstract: 本发明提供了一种基于组蛋白H3K27位点翻译后修饰的多肽探针，其氨基酸序列结构如下所示，本发明基于组蛋白H3的氨基酸序列，以H3K27位点为中心进行设计，以保护的赖氨基酸为原料，经过非天然氨基酸和多肽的合成，实现了这种多肽探针的合成。本发明发现了与组蛋白H3K27位点乙酰化和巴豆酰化修饰的靶标蛋白STAT3。本发明能提高多肽探针与组蛋白赖氨酸翻译后修饰靶标蛋白的结合，对于寻找组蛋白H3K27翻译后修饰Readers、Writers和Erasers等调控蛋白提供了一种新的思路。
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