一种m6A对鹅胚胎胸肌成肌细胞增殖调节的测定方法

    公开(公告)号:CN117660613A

    公开(公告)日:2024-03-08

    申请号:CN202311438093.1

    申请日:2023-11-01

    Abstract: 本发明公开了一种m6A对鹅胚胎胸肌成肌细胞增殖调节的测定方法,包括上控制机架,选择鹅胚胎第15天(E15)和E30的胸肌,进行MeRI P‑seq转录组范围内胸肌成肌细胞增殖的m6A修饰,鉴定了5429个差异表达基因(DEGs)和6465个差异甲基化基因(DMGs),在将DEGs与dmg重叠后,获得了3962个差异表达的甲基化基因(DEMGs),进行了mi RNA‑seq,获得了175个差异表达的mi rna(DEMs),通过将dem的靶基因与demg重叠,获得了2837个共享基因,GO和KEGG分析显示,MAPK在MAPK信号通路中富集,与成肌细胞增殖有关,选择I GF2BP1进行整合基因组查看器可视化(I GV),发现E15和E30之间I GF2BP1的m6A丰度存在显著差异,综上所述,推断mi RNA联合m6A修饰在成肌细胞增殖中起关键作用。

    基于m6A甲基化研究鸭胚胎期骨骼肌发育影响因素的方法

    公开(公告)号:CN117625800A

    公开(公告)日:2024-03-01

    申请号:CN202311386618.1

    申请日:2023-10-24

    Abstract: 本发明涉及的一种基于m6A甲基化研究鸭骨骼肌发育影响因素的方法:利用miRNA‑seq以及meRIP‑seq来鉴定鸭在胸肌胚胎细胞分化过程中的E13和E27两个阶段可能存在的受m6A调控的相关差异基因,对m6A基因进行重叠,再联合miRNA及其靶基因分析其功能。通过关联分析筛选出可能存在的m6A位点的miRNA初始转录本。显示MeRIP‑seq在E13组和E27组分别检测到14,344个和14,016个m6A峰。RRACH是鸭胸肌中主要的m6A基序。GO和KEGG分析显示m6A峰主要富集于肌肉发育、脂肪沉积相关通路,同时也富集到很多和肌肉发育相关的基因。证明了通过miRNA可以调控m6A相关基因以此来调控m6A修饰的机制,为研究RNA修饰对家禽骨骼肌发育的影响奠定了基础。

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