一种多尺度的药物-药物反应可解释预测方法和系统

    公开(公告)号:CN117198426B

    公开(公告)日:2024-01-30

    申请号:CN202311463160.5

    申请日:2023-11-06

    Abstract: 本发明提出了一种多尺度药物‑药物反应可解释预测方法和系统,包括:获取待预测两种药物的分子图和文本表示序列;在分子图中整合原子级特征向量;在药物文本序列中进行频繁子结构挖掘并利用变压器编码得到子结构级特征;不同尺度特征向量合并得到特征矩阵;两个药物的特征矩阵交互得到可解释的交互矩阵;在预测模块中处理交互矩阵得到DDI预测结果。本发明提出了一种多尺度特征融合策略来预测药物相互作用,它采用包含门控消息传递神经网络的图表示学习法和频繁子序列挖掘算法,实现了多尺度的DDI可解释性预测。(56)对比文件Xianfang Tang et al.Indicatorregularized non-negative matrixfactorization method-based drugrepurposing for COVID-19《.Frontiers inImmunology》.2021,全文.成志兴.整合多源信息的药物-靶标相互作用智能预测模型的研究《.硕士电子期刊》.2023,(第04期),全文.Chen Y et al.MUFFIN: multi-scalefeature fusion for drug-drug interactionprediction《.Bioinformatics》.2021,全文.

    一种多尺度的药物-药物反应可解释预测方法和系统

    公开(公告)号:CN117198426A

    公开(公告)日:2023-12-08

    申请号:CN202311463160.5

    申请日:2023-11-06

    Abstract: 本发明提出了一种多尺度药物‑药物反应可解释预测方法和系统,包括:获取待预测两种药物的分子图和文本表示序列;在分子图中整合原子级特征向量;在药物文本序列中进行频繁子结构挖掘并利用变压器编码得到子结构级特征;不同尺度特征向量合并得到特征矩阵;两个药物的特征矩阵交互得到可解释的交互矩阵;在预测模块中处理交互矩阵得到DDI预测结果。本发明提出了一种多尺度特征融合策略来预测药物相互作用,它采用包含门控消息传递神经网络的图表示学习法和频繁子序列挖掘算法,实现了多尺度的DDI可解释性预测。

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