一种基于全基因组关联分析筛选大白猪繁殖性能相关候选标记的方法

    公开(公告)号:CN114300042A

    公开(公告)日:2022-04-08

    申请号:CN202111543356.6

    申请日:2021-12-16

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明属于家畜养殖技术领域,公开了一种基于全基因组关联分析筛选大白猪繁殖性能相关候选标记的方法,在丹系大白母猪中随机选择695头作为全基因组关联分析的实验对象,记录第一胎总产仔数、产活仔数、健仔数、断奶头数以及出生窝重、断奶窝重、校正21日龄窝重等繁殖性能数据,采集该群体的耳尾组织,提取基因组DNA,经过检测所提取到的基因组DNA的完整性、纯度及浓度,最终进行55K SNP芯片基因型测定,然后对丹系大白母猪繁殖性状的7项指标进行全基因组关联分析,筛选出7个显著SNP位点以及12个候选基因,为今后优质高产大白猪新品种选育提供理论支撑。

    杀菌通透性增强蛋白基因作为猪一般抗病力遗传标记的应用

    公开(公告)号:CN103173531B

    公开(公告)日:2014-08-06

    申请号:CN201210369867.5

    申请日:2012-09-27

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明涉及筛选一种猪一般抗病力BPI基因第4和10外显子变异位点组合基因型的遗传标记,属于猪遗传育种及分子标记辅助选择技术领域。本发明方法包括待测样品的猪基因组DNA的提取及其PCR扩增,外显子4的PCR产物经SSCP分析和外显子10的PCR产物经限制性内切酶HpaII的酶切,当待测猪个体基因型为CDAB型,则为一般抗病力强的个体。本发明为猪抗病育种工作的分子标记辅助选择提供一个更加高效准确的分子遗传标记,为提高仔猪一般抗病力和免疫应答能力提供了一种有效的分子标记育种手段,本发明的检测方法操作简单,费用较为低廉,准确度高,并可实现自动化的直接检测,本发明将在猪的育种中发挥巨大作用。

    一种猪circRNA序列及其应用、成环鉴定方法

    公开(公告)号:CN113846097A

    公开(公告)日:2021-12-28

    申请号:CN202111035863.9

    申请日:2021-09-06

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明基于最常见的一类肠道炎症性疾病——仔猪细菌性腹泻(PDW),其中F18大肠杆菌(E.coli F18)是引起断奶仔猪细菌性腹泻的主要病原,而地方品种猪对其抗性的调控机制有待系统阐明。前期通过组学测序筛选出1个大肠杆菌F18感染调控的关键候选RNA—circRNA_27388,由于circRNA_27388本体基因为FUT8,因此将其命名为circ_FUT8,在此基础上,本研究对circ_FUT8序列进行成环鉴定,为后续验证circRNA功能及调控机制奠定基础。

    一种与仔猪细菌性腹泻抗性相关的lncRNA标志物及其应用

    公开(公告)号:CN113832235A

    公开(公告)日:2021-12-24

    申请号:CN202111035954.2

    申请日:2021-09-06

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明通过组学测序筛选出1个大肠杆菌F18感染调控的关键候选lncRNA‑FUT3‑AS1,序列为SEQ ID NO:1,在此基础上,本研究围绕FUT3‑AS1功能与调控机制开展深入分析,首先利用qPCR和Northern blot技术检测了FUT3‑AS1在梅山猪与苏太猪F18大肠杆菌敏感型与抗性型断奶仔猪十二指肠中的表达差异情况,成功建立lncRNA‑FUT3‑AS1沉默的猪小肠上皮细胞,干扰效率达到68%,且通过细菌计数、革兰氏染色、扫描电镜以及间接免疫荧光等一系列检测手段发现,沉默lncRNA‑FUT3‑AS1可以显著地降低F18大肠杆菌对IPEC‑J2细胞的黏附能力。由此表明,lncRNA‑FUT3‑AS1在断奶仔猪抵抗F18大肠杆菌侵染过程中发挥了重要的抗性调控功能,其表达水平下调降低了小肠上皮细胞对F18大肠杆菌的黏附能力,有助于提高仔猪对F18大肠杆菌侵染的抵抗能力。

    一种用于猪抗病育种的遗传分子标记方法和应用

    公开(公告)号:CN109971840A

    公开(公告)日:2019-07-05

    申请号:CN201910286939.1

    申请日:2019-04-11

    Applicant: 扬州大学

    Abstract: 本发明公开了一种用于猪抗病育种的遗传分子标记方法和应用,遗传分子标记方法包括以下步骤:包括以下步骤:步骤一:猪TLR5基因变异位点的筛选和确定;步骤二:扩增包含所确定变异位点的序列;步骤三:对步骤二的扩增产物进行SSCP分析,全面检测猪核心群基因型;步骤四:对个体基因型与代表一般抗病力的重要细胞因子之间进行关联分析;最终选择扩增产物PCR‑SSCP带型4条带中出现3条带的样本为抗病育种中的有利个体。本发明提供的用于猪抗病育种的遗传分子标记方法,准确度高,可大批量检测,为提高仔猪的免疫应答能力和一般抗病力提供了一种有效的分子标记育种手段,将本遗传分子标记用于抗病育种,还可以加快育种进程。

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