公开(公告)号：CN102346817B

公开(公告)日：2015-03-25

申请号：CN201110302532.7

申请日：2011-10-09

Applicant: 广州医学院第二附属医院

Inventor： 陶爱林 ,  张利达 ,  邹泽红 ,  黄于艺

IPC: G06F19/24

Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域，更确切的是涉及一种借助支持向量机建立过敏原家族特征肽的过敏原的预测方法。该预测方法包括建立过敏原数据库；形成过敏原聚类与家族；提取过敏原家族代表肽；建立支持向量机模型；模型性能参数的优化训练及大规模过敏原数据的测试。本发明优点是：建立在优先淘选过敏原家族特征肽基础上，该特征肽不仅对过敏原的典型特征作了精细描述，而且将过敏原与非过敏原做了严格区分，避免了过敏原判别过程中假阳性和假阴性的产生，从而在过敏原判别的准确性与灵敏度上取得了高水平的平衡而具有明显优势。在蛋白序列过敏原性的生物信息学分析方面具有广阔的应用前景。

公开(公告)号：CN102346817A

公开(公告)日：2012-02-08

申请号：CN201110302532.7

申请日：2011-10-09

Applicant: 广州医学院第二附属医院

Inventor： 陶爱林 ,  张利达 ,  邹泽红 ,  黄于艺

IPC: G06F19/24

Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域，更确切的是涉及一种借助支持向量机建立过敏原家族特征肽的过敏原的预测方法。该预测方法包括建立过敏原数据库；形成过敏原聚类与家族；提取过敏原家族代表肽；建立支持向量机模型；模型性能参数的优化训练及大规模过敏原数据的测试。本发明优点是：建立在优先淘选过敏原家族特征肽基础上，该特征肽不仅对过敏原的典型特征作了精细描述，而且将过敏原与非过敏原做了严格区分，避免了过敏原判别过程中假阳性和假阴性的产生，从而在过敏原判别的准确性与灵敏度上取得了高水平的平衡而具有明显优势。在蛋白序列过敏原性的生物信息学分析方面具有广阔的应用前景。